Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G240500.1
Synonym Sb03g029770
Functional annotation glycosyl transferase, group 1 domain containing protein, expressed
UniProt C5XF92
Pfam PF13439 PF00534
Panther DB PTHR12526 PTHR12526:SF316
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G19460 : UDP-Glycosyltransferase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g46430.1 : glycosyl transferase, group 1 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a028223
Brachypodium KQK08993
Barley HORVU3Hr1G058900.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G082100 xyloglucan fucosyltransferase, putative, expressed K13681: xyloglucan fucosyltransferase
2 Sobic.007G007300 methyltransferase domain containing protein, expressed -
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5 Sobic.004G308500 xyloglucan fucosyltransferase, putative, expressed K13681: xyloglucan fucosyltransferase
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11 Sobic.007G073000 - -
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18 Sobic.006G209000 Protein transferase (Os)(PubMedID : 27208977)@transferase family domain containing protein, expressed -
19 Sobic.007G090600 CSLC3 - cellulose synthase-like family C, expressed -
20 Sobic.003G215300 pleiotropic drug resistance protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G240500 Sobic003G240500 Sobic010G082100 Sobic010G082100 Sobic003G240500--Sobic010G082100 Sobic007G007300 Sobic007G007300 Sobic003G240500--Sobic007G007300 Sobic006G266800 Sobic006G266800 Sobic003G240500--Sobic006G266800 Sobic005G110514 Sobic005G110514 Sobic003G240500--Sobic005G110514 Sobic004G308500 Sobic004G308500 Sobic003G240500--Sobic004G308500 Sobic004G322000 Sobic004G322000 Sobic003G240500--Sobic004G322000 Sobic001G506500 Sobic001G506500 Sobic003G240500--Sobic001G506500 Sobic002G166150 Sobic002G166150 Sobic003G240500--Sobic002G166150 Sobic001G506700 Sobic001G506700 Sobic003G240500--Sobic001G506700 Sobic010G082100--Sobic003G240500 Sobic010G082100--Sobic001G506500 Sobic010G082100--Sobic007G007300 Sobic010G082100--Sobic005G110514 Sobic009G106100 Sobic009G106100 Sobic010G082100--Sobic009G106100 Sobic010G082100--Sobic006G266800 Sobic010G082100--Sobic004G308500 Sobic001G274400 Sobic001G274400 Sobic010G082100--Sobic001G274400 Sobic010G170150 Sobic010G170150 Sobic010G082100--Sobic010G170150 Sobic007G090600 Sobic007G090600 Sobic007G007300--Sobic007G090600 Sobic007G007300--Sobic004G322000 Sobic003G095100 Sobic003G095100 Sobic007G007300--Sobic003G095100 Sobic003G282300 Sobic003G282300 Sobic007G007300--Sobic003G282300 Sobic007G007300--Sobic004G308500 Sobic003G215300 Sobic003G215300 Sobic007G007300--Sobic003G215300 Sobic006G133200 Sobic006G133200 Sobic007G007300--Sobic006G133200 Sobic004G014600 Sobic004G014600 Sobic007G007300--Sobic004G014600 Sobic005G052700 Sobic005G052700 Sobic007G007300--Sobic005G052700 Sobic002G195600 Sobic002G195600 Sobic006G266800--Sobic002G195600 Sobic006G266800--Sobic003G215300 Sobic006G266800--Sobic007G007300 Sobic001G503000 Sobic001G503000 Sobic006G266800--Sobic001G503000 Sobic007G073000 Sobic007G073000 Sobic006G266800--Sobic007G073000 Sobic006G196400 Sobic006G196400 Sobic006G266800--Sobic006G196400 Sobic002G115600 Sobic002G115600 Sobic006G266800--Sobic002G115600 Sobic006G266800--Sobic004G322000 Sobic008G138900 Sobic008G138900 Sobic006G266800--Sobic008G138900 Sobic004G003100 Sobic004G003100 Sobic005G110514--Sobic004G003100 Sobic005G110514--Sobic004G308500 Sobic009G233100 Sobic009G233100 Sobic005G110514--Sobic009G233100 Sobic005G110514--Sobic009G106100 Sobic003G007400 Sobic003G007400 Sobic005G110514--Sobic003G007400 Sobic007G186500 Sobic007G186500 Sobic005G110514--Sobic007G186500 Sobic001G506800 Sobic001G506800 Sobic005G110514--Sobic001G506800 Sobic005G216600 Sobic005G216600 Sobic005G110514--Sobic005G216600 Sobic004G121600 Sobic004G121600 Sobic005G110514--Sobic004G121600 Sobic002G289500 Sobic002G289500 Sobic004G308500--Sobic002G289500 Sobic004G308500--Sobic004G014600 Sobic004G308500--Sobic004G121600 Sobic001G415100 Sobic001G415100 Sobic004G308500--Sobic001G415100 Sobic007G111800 Sobic007G111800 Sobic004G308500--Sobic007G111800 Sobic005G046400 Sobic005G046400 Sobic004G308500--Sobic005G046400 Sobic005G106300 Sobic005G106300 Sobic004G308500--Sobic005G106300 Sobic006G097900 Sobic006G097900 Sobic004G308500--Sobic006G097900 Sobic003G441800 Sobic003G441800 Sobic004G308500--Sobic003G441800 Sobic004G322000--Sobic007G090600 Sobic004G322000--Sobic003G215300 Sobic006G031100 Sobic006G031100 Sobic004G322000--Sobic006G031100 Sobic003G140200 Sobic003G140200 Sobic004G322000--Sobic003G140200 Sobic004G322000--Sobic003G282300 Sobic003G240400 Sobic003G240400 Sobic004G322000--Sobic003G240400 Sobic008G035800 Sobic008G035800 Sobic004G322000--Sobic008G035800 Sobic010G082000 Sobic010G082000 Sobic004G322000--Sobic010G082000 Sobic004G322000--Sobic004G014600 Sobic001G506500--Sobic010G082100 Sobic001G506500--Sobic003G240500 Sobic005G048400 Sobic005G048400 Sobic001G506500--Sobic005G048400 Sobic003G176300 Sobic003G176300 Sobic001G506500--Sobic003G176300 Sobic001G506500--Sobic007G007300 Sobic001G506500--Sobic004G308500 Sobic001G070100 Sobic001G070100 Sobic001G506500--Sobic001G070100 Sobic001G526500 Sobic001G526500 Sobic001G506500--Sobic001G526500 Sobic007G149000 Sobic007G149000 Sobic001G506500--Sobic007G149000 Sobic001G342000 Sobic001G342000 Sobic002G166150--Sobic001G342000 Sobic002G166150--Sobic001G415100 Sobic005G182900 Sobic005G182900 Sobic002G166150--Sobic005G182900 Sobic002G166150--Sobic004G308500 Sobic002G166150--Sobic002G289500 Sobic002G166150--Sobic004G014600 Sobic002G029500 Sobic002G029500 Sobic002G166150--Sobic002G029500 Sobic008G033100 Sobic008G033100 Sobic002G166150--Sobic008G033100 Sobic001G272800 Sobic001G272800 Sobic002G166150--Sobic001G272800 Sobic002G411000 Sobic002G411000 Sobic001G506700--Sobic002G411000 Sobic005G065700 Sobic005G065700 Sobic001G506700--Sobic005G065700 Sobic002G019100 Sobic002G019100 Sobic001G506700--Sobic002G019100 Sobic005G071900 Sobic005G071900 Sobic001G506700--Sobic005G071900 Sobic001G506600 Sobic001G506600 Sobic001G506700--Sobic001G506600 Sobic006G209000 Sobic006G209000 Sobic001G506700--Sobic006G209000 Sobic006G009700 Sobic006G009700 Sobic001G506700--Sobic006G009700 Sobic005G066300 Sobic005G066300 Sobic001G506700--Sobic005G066300 Sobic001G506700--Sobic001G503000
Octagon: transcription factors


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