Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G252750.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VYV7
Pfam -
Panther DB PTHR33033 PTHR33033:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G33160 : glycoside hydrolase family 28 protein / polygalacturonase (pectinase) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g28550.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G092550 - -
2 Sobic.002G363466 - -
3 Sobic.002G417101 - -
4 Sobic.003G095750 - -
5 Sobic.001G020900 heat shock protein DnaJ, putative, expressed -
6 Sobic.003G095301 - -
7 Sobic.005G068600 - -
8 Sobic.004G121500 expansin precursor, putative, expressed -
9 Sobic.002G400050 - -
10 Sobic.004G177050 - -
11 Sobic.002G034900 metallothionein family protein, expressed -
12 Sobic.002G175000 ras-related protein, putative, expressed K07976: Rab family, other
13 Sobic.006G253700 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR23 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed K14488: SAUR family protein
14 Sobic.009G196500 expressed protein -
15 Sobic.003G075632 - -
16 Sobic.003G383400 ZOS1-19 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
17 Sobic.009G168500 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
18 Sobic.001G383600 - -
19 Sobic.007G181801 - -
20 Sobic.005G077666 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G252750 Sobic003G252750 Sobic010G092550 Sobic010G092550 Sobic003G252750--Sobic010G092550 Sobic002G363466 Sobic002G363466 Sobic003G252750--Sobic002G363466 Sobic002G417101 Sobic002G417101 Sobic003G252750--Sobic002G417101 Sobic003G095750 Sobic003G095750 Sobic003G252750--Sobic003G095750 Sobic001G020900 Sobic001G020900 Sobic003G252750--Sobic001G020900 Sobic003G095301 Sobic003G095301 Sobic003G252750--Sobic003G095301 Sobic005G068600 Sobic005G068600 Sobic003G252750--Sobic005G068600 Sobic004G121500 Sobic004G121500 Sobic003G252750--Sobic004G121500 Sobic002G400050 Sobic002G400050 Sobic003G252750--Sobic002G400050 Sobic010G092550--Sobic003G095750 Sobic010G092550--Sobic002G400050 Sobic002G034900 Sobic002G034900 Sobic010G092550--Sobic002G034900 Sobic003G075632 Sobic003G075632 Sobic010G092550--Sobic003G075632 Sobic009G196500 Sobic009G196500 Sobic010G092550--Sobic009G196500 Sobic010G092550--Sobic003G095301 Sobic007G104201 Sobic007G104201 Sobic010G092550--Sobic007G104201 Sobic009G037400 Sobic009G037400 Sobic010G092550--Sobic009G037400 Sobic001G383600 Sobic001G383600 Sobic010G092550--Sobic001G383600 Sobic006G209200 Sobic006G209200 Sobic002G363466--Sobic006G209200 Sobic001G173251 Sobic001G173251 Sobic002G363466--Sobic001G173251 Sobic002G363466--Sobic003G095301 Sobic004G093300 Sobic004G093300 Sobic002G363466--Sobic004G093300 Sobic002G363466--Sobic010G092550 Sobic009G158200 Sobic009G158200 Sobic002G363466--Sobic009G158200 Sobic002G175000 Sobic002G175000 Sobic002G363466--Sobic002G175000 Sobic002G363466--Sobic004G121500 Sobic007G181801 Sobic007G181801 Sobic002G363466--Sobic007G181801 Sobic002G417101--Sobic004G121500 Sobic002G417101--Sobic003G095301 Sobic005G062300 Sobic005G062300 Sobic002G417101--Sobic005G062300 Sobic010G253250 Sobic010G253250 Sobic002G417101--Sobic010G253250 Sobic005G077666 Sobic005G077666 Sobic002G417101--Sobic005G077666 Sobic001G328850 Sobic001G328850 Sobic002G417101--Sobic001G328850 Sobic002G099500 Sobic002G099500 Sobic002G417101--Sobic002G099500 Sobic002G417101--Sobic007G181801 Sobic004G123801 Sobic004G123801 Sobic002G417101--Sobic004G123801 Sobic003G095750--Sobic002G034900 Sobic003G095750--Sobic002G400050 Sobic003G095750--Sobic003G075632 Sobic003G095750--Sobic009G196500 Sobic003G095750--Sobic009G037400 Sobic003G095750--Sobic010G092550 Sobic003G095750--Sobic007G104201 Sobic003G095750--Sobic003G095301 Sobic001G110150 Sobic001G110150 Sobic003G095750--Sobic001G110150 Sobic001G020900--Sobic002G363466 Sobic001G020900--Sobic003G252750 Sobic001G020900--Sobic002G417101 Sobic001G020900--Sobic004G121500 Sobic001G020900--Sobic003G095301 Sobic001G020900--Sobic002G175000 Sobic001G020900--Sobic006G209200 Sobic010G059100 Sobic010G059100 Sobic001G020900--Sobic010G059100 Sobic001G020900--Sobic005G068600 Sobic003G095301--Sobic007G181801 Sobic003G095301--Sobic009G196500 Sobic009G219601 Sobic009G219601 Sobic003G095301--Sobic009G219601 Sobic003G095301--Sobic004G123801 Sobic008G146801 Sobic008G146801 Sobic003G095301--Sobic008G146801 Sobic005G193900 Sobic005G193900 Sobic003G095301--Sobic005G193900 Sobic003G384650 Sobic003G384650 Sobic003G095301--Sobic003G384650 Sobic001G030800 Sobic001G030800 Sobic003G095301--Sobic001G030800 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic003G095301--Sobic001G018700 Sobic005G068600--Sobic002G363466 Sobic008G035000 Sobic008G035000 Sobic005G068600--Sobic008G035000 Sobic005G068600--Sobic006G209200 Sobic005G068600--Sobic003G252750 Sobic005G068600--Sobic004G121500 Sobic005G068600--Sobic010G092550 Sobic005G068600--Sobic002G417101 Sobic005G068600--Sobic002G175000 Sobic005G068600--Sobic001G173251 Sobic004G121500--Sobic002G417101 Sobic004G121500--Sobic005G062300 Sobic004G121500--Sobic005G077666 Sobic004G121500--Sobic003G095301 Sobic004G121500--Sobic001G328850 Sobic004G121500--Sobic007G181801 Sobic004G121500--Sobic004G123801 Sobic004G121500--Sobic002G175000 Sobic004G121500--Sobic009G219601 Sobic002G400050--Sobic002G034900 Sobic002G400050--Sobic003G095750 Sobic002G400050--Sobic009G196500 Sobic002G400050--Sobic003G075632 Sobic008G153801 Sobic008G153801 Sobic002G400050--Sobic008G153801 Sobic006G204850 Sobic006G204850 Sobic002G400050--Sobic006G204850 Sobic002G400050--Sobic009G037400 Sobic003G426750 Sobic003G426750 Sobic002G400050--Sobic003G426750 Sobic005G017632 Sobic005G017632 Sobic002G400050--Sobic005G017632
Octagon: transcription factors


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