Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G279000.1
Synonym Sb03g033075
Functional annotation aspartic proteinase nepenthesin precursor, putative, expressed
UniProt A0A1B6Q5S7
Pfam PF00026
Panther DB PTHR13683 PTHR13683:SF338
NCBI CDD KOG1339; Aspartyl protease
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006508; proteolysis GO:0004190aspartic-type endopeptidase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G01300 : Eukaryotic aspartyl protease family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g52190.1 : aspartic proteinase nepenthesin precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a027759
Brachypodium KQK09511
Barley HORVU3Hr1G068330.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G029200 - -
2 Sobic.001G129750 - -
3 Sobic.003G020900 - -
4 Sobic.003G262000 plant-specific domain TIGR01568 family protein, expressed -
5 Sobic.001G302000 - -
6 Sobic.002G430601 - -
7 Sobic.008G130350 - -
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12 Sobic.009G185601 - -
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14 Sobic.004G098650 - -
15 Sobic.003G094850 - -
16 Sobic.001G120700 - -
17 Sobic.003G384650 - -
18 Sobic.005G102750 - -
19 Sobic.001G146450 - -
20 Sobic.003G066200 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic003G279000 Sobic003G279000 Sobic004G029200 Sobic004G029200 Sobic003G279000--Sobic004G029200 Sobic001G129750 Sobic001G129750 Sobic003G279000--Sobic001G129750 Sobic003G020900 Sobic003G020900 Sobic003G279000--Sobic003G020900 Sobic003G262000 Sobic003G262000 Sobic003G279000--Sobic003G262000 Sobic001G302000 Sobic001G302000 Sobic003G279000--Sobic001G302000 Sobic002G430601 Sobic002G430601 Sobic003G279000--Sobic002G430601 Sobic008G130350 Sobic008G130350 Sobic003G279000--Sobic008G130350 Sobic005G009900 Sobic005G009900 Sobic003G279000--Sobic005G009900 Sobic006G080050 Sobic006G080050 Sobic003G279000--Sobic006G080050 Sobic004G029200--Sobic005G009900 Sobic004G029200--Sobic003G279000 Sobic004G029200--Sobic008G130350 Sobic004G029200--Sobic001G129750 Sobic004G029200--Sobic003G020900 Sobic001G494700 Sobic001G494700 Sobic004G029200--Sobic001G494700 Sobic004G029200--Sobic003G262000 Sobic004G029200--Sobic001G302000 Sobic010G081300 Sobic010G081300 Sobic004G029200--Sobic010G081300 Sobic001G129750--Sobic003G020900 Sobic001G129750--Sobic003G262000 Sobic001G129750--Sobic002G430601 Sobic001G129750--Sobic001G302000 Sobic001G129750--Sobic006G080050 Sobic006G190950 Sobic006G190950 Sobic001G129750--Sobic006G190950 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic001G129750--Sobic001G018700 Sobic003G020900--Sobic001G129750 Sobic003G020900--Sobic003G262000 Sobic003G020900--Sobic002G430601 Sobic003G020900--Sobic001G302000 Sobic003G020900--Sobic006G080050 Sobic003G020900--Sobic006G190950 Sobic003G020900--Sobic001G018700 Sobic003G262000--Sobic003G020900 Sobic003G262000--Sobic001G129750 Sobic003G262000--Sobic002G430601 Sobic003G262000--Sobic006G190950 Sobic003G262000--Sobic001G302000 Sobic003G405400 Sobic003G405400 Sobic003G262000--Sobic003G405400 Sobic003G384650 Sobic003G384650 Sobic003G262000--Sobic003G384650 Sobic003G262000--Sobic006G080050 Sobic001G539100 Sobic001G539100 Sobic003G262000--Sobic001G539100 Sobic001G302000--Sobic006G080050 Sobic001G302000--Sobic003G020900 Sobic001G302000--Sobic001G129750 Sobic001G302000--Sobic003G262000 Sobic001G302000--Sobic002G430601 Sobic003G066200 Sobic003G066200 Sobic001G302000--Sobic003G066200 Sobic001G302000--Sobic006G190950 Sobic001G302000--Sobic001G018700 Sobic002G430601--Sobic003G262000 Sobic002G430601--Sobic003G020900 Sobic002G430601--Sobic001G129750 Sobic003G072100 Sobic003G072100 Sobic002G430601--Sobic003G072100 Sobic003G242500 Sobic003G242500 Sobic002G430601--Sobic003G242500 Sobic001G183900 Sobic001G183900 Sobic002G430601--Sobic001G183900 Sobic002G430601--Sobic006G190950 Sobic002G430601--Sobic001G018700 Sobic008G130350--Sobic004G029200 Sobic008G130350--Sobic006G190950 Sobic008G130350--Sobic001G129750 Sobic008G130350--Sobic003G020900 Sobic008G130350--Sobic003G279000 Sobic010G017600 Sobic010G017600 Sobic008G130350--Sobic010G017600 Sobic008G130350--Sobic003G262000 Sobic008G106550 Sobic008G106550 Sobic008G130350--Sobic008G106550 Sobic002G026600 Sobic002G026600 Sobic008G130350--Sobic002G026600 Sobic005G009900--Sobic004G029200 Sobic005G009900--Sobic003G279000 Sobic002G331900 Sobic002G331900 Sobic005G009900--Sobic002G331900 Sobic005G009900--Sobic010G081300 Sobic007G048300 Sobic007G048300 Sobic005G009900--Sobic007G048300 Sobic005G009900--Sobic001G494700 Sobic005G009900--Sobic008G130350 Sobic005G009900--Sobic001G129750 Sobic005G009900--Sobic003G020900 Sobic006G080050--Sobic001G302000 Sobic006G080050--Sobic003G066200 Sobic010G158300 Sobic010G158300 Sobic006G080050--Sobic010G158300 Sobic006G080050--Sobic001G018700
Octagon: transcription factors


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