Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G494700.1,Sobic.001G494700.2
Synonym Sb01g046240
Functional annotation nodulin, putative, expressed
UniProt A0A1Z5SBJ3 , A0A1B6QQC3
Pfam PF00892
Panther DB PTHR31218 PTHR31218:SF46
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016021; integral component of membrane GO:0016020membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G30420 : nodulin MtN21 /EamA-like transporter family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g05530.1 : nodulin, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G029200 - -
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20 Sobic.004G098650 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G494700 Sobic001G494700 Sobic004G029200 Sobic004G029200 Sobic001G494700--Sobic004G029200 Sobic003G279000 Sobic003G279000 Sobic001G494700--Sobic003G279000 Sobic001G129750 Sobic001G129750 Sobic001G494700--Sobic001G129750 Sobic003G020900 Sobic003G020900 Sobic001G494700--Sobic003G020900 Sobic005G009900 Sobic005G009900 Sobic001G494700--Sobic005G009900 Sobic003G262000 Sobic003G262000 Sobic001G494700--Sobic003G262000 Sobic001G302000 Sobic001G302000 Sobic001G494700--Sobic001G302000 Sobic008G130350 Sobic008G130350 Sobic001G494700--Sobic008G130350 Sobic001G185700 Sobic001G185700 Sobic001G494700--Sobic001G185700 Sobic004G029200--Sobic005G009900 Sobic004G029200--Sobic003G279000 Sobic004G029200--Sobic008G130350 Sobic004G029200--Sobic001G129750 Sobic004G029200--Sobic003G020900 Sobic004G029200--Sobic001G494700 Sobic004G029200--Sobic003G262000 Sobic004G029200--Sobic001G302000 Sobic010G081300 Sobic010G081300 Sobic004G029200--Sobic010G081300 Sobic003G279000--Sobic004G029200 Sobic003G279000--Sobic001G129750 Sobic003G279000--Sobic003G020900 Sobic003G279000--Sobic003G262000 Sobic003G279000--Sobic001G302000 Sobic002G430601 Sobic002G430601 Sobic003G279000--Sobic002G430601 Sobic003G279000--Sobic008G130350 Sobic003G279000--Sobic005G009900 Sobic006G080050 Sobic006G080050 Sobic003G279000--Sobic006G080050 Sobic001G129750--Sobic003G020900 Sobic001G129750--Sobic003G262000 Sobic001G129750--Sobic002G430601 Sobic001G129750--Sobic001G302000 Sobic001G129750--Sobic006G080050 Sobic006G190950 Sobic006G190950 Sobic001G129750--Sobic006G190950 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic001G129750--Sobic001G018700 Sobic003G020900--Sobic001G129750 Sobic003G020900--Sobic003G262000 Sobic003G020900--Sobic002G430601 Sobic003G020900--Sobic001G302000 Sobic003G020900--Sobic006G080050 Sobic003G020900--Sobic006G190950 Sobic003G020900--Sobic001G018700 Sobic005G009900--Sobic004G029200 Sobic005G009900--Sobic003G279000 Sobic002G331900 Sobic002G331900 Sobic005G009900--Sobic002G331900 Sobic005G009900--Sobic010G081300 Sobic007G048300 Sobic007G048300 Sobic005G009900--Sobic007G048300 Sobic005G009900--Sobic001G494700 Sobic005G009900--Sobic008G130350 Sobic005G009900--Sobic001G129750 Sobic005G009900--Sobic003G020900 Sobic003G262000--Sobic003G020900 Sobic003G262000--Sobic001G129750 Sobic003G262000--Sobic002G430601 Sobic003G262000--Sobic006G190950 Sobic003G262000--Sobic001G302000 Sobic003G405400 Sobic003G405400 Sobic003G262000--Sobic003G405400 Sobic003G384650 Sobic003G384650 Sobic003G262000--Sobic003G384650 Sobic003G262000--Sobic006G080050 Sobic001G539100 Sobic001G539100 Sobic003G262000--Sobic001G539100 Sobic001G302000--Sobic006G080050 Sobic001G302000--Sobic003G020900 Sobic001G302000--Sobic001G129750 Sobic001G302000--Sobic003G262000 Sobic001G302000--Sobic002G430601 Sobic003G066200 Sobic003G066200 Sobic001G302000--Sobic003G066200 Sobic001G302000--Sobic006G190950 Sobic001G302000--Sobic001G018700 Sobic008G130350--Sobic004G029200 Sobic008G130350--Sobic006G190950 Sobic008G130350--Sobic001G129750 Sobic008G130350--Sobic003G020900 Sobic008G130350--Sobic003G279000 Sobic010G017600 Sobic010G017600 Sobic008G130350--Sobic010G017600 Sobic008G130350--Sobic003G262000 Sobic008G106550 Sobic008G106550 Sobic008G130350--Sobic008G106550 Sobic002G026600 Sobic002G026600 Sobic008G130350--Sobic002G026600 Sobic001G185700--Sobic003G066200 Sobic001G328850 Sobic001G328850 Sobic001G185700--Sobic001G328850 Sobic001G185700--Sobic001G018700
Octagon: transcription factors


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