Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G279700.1
Synonym Sb03g033130
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
expressed protein
UniProt C5XID3
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF629
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G14460 : LRR and NB-ARC domains-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g52290.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a038989
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G367000 glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein, putative, expressed K01126: E3.1.4.46, glpQ, glycerophosphoryl diester phosphodiesterase
2 Sobic.007G043750 - -
3 Sobic.003G257650 - -
4 Sobic.003G373700 - -
5 Sobic.005G078600 OsFBX411 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.010G020000 cytochrome P450 86A1, putative, expressed -
7 Sobic.003G394150 - -
8 Sobic.001G089850 - -
9 Sobic.003G198850 - -
10 Sobic.003G432400 NB-ARC domain containing protein, expressed -
11 Sobic.003G383000 expressed protein -
12 Sobic.009G258000 S-locus lectin protein kinase family protein, putative, expressed -
13 Sobic.004G115950 - -
14 Sobic.002G246100 - -
15 Sobic.002G262250 - -
16 Sobic.006G241500 - -
17 Sobic.002G359500 - -
18 Sobic.010G226100 - -
19 Sobic.006G038050 - -
20 Sobic.001G486400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G279700 Sobic003G279700 Sobic002G367000 Sobic002G367000 Sobic003G279700--Sobic002G367000 Sobic007G043750 Sobic007G043750 Sobic003G279700--Sobic007G043750 Sobic003G257650 Sobic003G257650 Sobic003G279700--Sobic003G257650 Sobic003G373700 Sobic003G373700 Sobic003G279700--Sobic003G373700 Sobic005G078600 Sobic005G078600 Sobic003G279700--Sobic005G078600 Sobic010G020000 Sobic010G020000 Sobic003G279700--Sobic010G020000 Sobic003G394150 Sobic003G394150 Sobic003G279700--Sobic003G394150 Sobic001G089850 Sobic001G089850 Sobic003G279700--Sobic001G089850 Sobic003G198850 Sobic003G198850 Sobic003G279700--Sobic003G198850 Sobic002G367000--Sobic003G257650 Sobic006G038050 Sobic006G038050 Sobic002G367000--Sobic006G038050 Sobic002G367000--Sobic003G198850 Sobic007G190600 Sobic007G190600 Sobic002G367000--Sobic007G190600 Sobic003G383000 Sobic003G383000 Sobic002G367000--Sobic003G383000 Sobic002G149500 Sobic002G149500 Sobic002G367000--Sobic002G149500 Sobic001G175200 Sobic001G175200 Sobic002G367000--Sobic001G175200 Sobic002G246100 Sobic002G246100 Sobic002G367000--Sobic002G246100 SobicK004201 SobicK004201 Sobic002G367000--SobicK004201 Sobic003G432400 Sobic003G432400 Sobic007G043750--Sobic003G432400 Sobic009G258000 Sobic009G258000 Sobic007G043750--Sobic009G258000 Sobic004G175800 Sobic004G175800 Sobic007G043750--Sobic004G175800 Sobic007G043750--Sobic003G394150 Sobic007G043750--Sobic003G257650 Sobic002G395400 Sobic002G395400 Sobic007G043750--Sobic002G395400 Sobic008G179400 Sobic008G179400 Sobic007G043750--Sobic008G179400 Sobic010G226100 Sobic010G226100 Sobic007G043750--Sobic010G226100 Sobic001G035700 Sobic001G035700 Sobic007G043750--Sobic001G035700 Sobic003G257650--Sobic002G367000 Sobic003G257650--Sobic003G394150 Sobic003G257650--Sobic001G175200 Sobic003G257650--Sobic010G226100 Sobic003G257650--Sobic010G020000 Sobic003G257650--Sobic005G078600 Sobic003G257650--Sobic007G190600 Sobic003G257650--Sobic006G038050 Sobic006G241500 Sobic006G241500 Sobic003G257650--Sobic006G241500 Sobic006G115532 Sobic006G115532 Sobic003G373700--Sobic006G115532 Sobic008G157400 Sobic008G157400 Sobic003G373700--Sobic008G157400 Sobic004G115950 Sobic004G115950 Sobic003G373700--Sobic004G115950 Sobic007G203600 Sobic007G203600 Sobic003G373700--Sobic007G203600 Sobic008G133750 Sobic008G133750 Sobic003G373700--Sobic008G133750 Sobic001G404950 Sobic001G404950 Sobic003G373700--Sobic001G404950 Sobic003G340500 Sobic003G340500 Sobic003G373700--Sobic003G340500 Sobic001G461101 Sobic001G461101 Sobic003G373700--Sobic001G461101 Sobic003G373700--Sobic003G198850 Sobic005G078600--Sobic003G257650 Sobic010G203400 Sobic010G203400 Sobic005G078600--Sobic010G203400 Sobic010G228800 Sobic010G228800 Sobic005G078600--Sobic010G228800 Sobic005G078600--Sobic006G241500 Sobic003G327950 Sobic003G327950 Sobic005G078600--Sobic003G327950 Sobic005G078600--Sobic001G089850 Sobic004G224733 Sobic004G224733 Sobic005G078600--Sobic004G224733 Sobic001G201933 Sobic001G201933 Sobic005G078600--Sobic001G201933 Sobic005G078600--Sobic010G226100 Sobic010G020000--Sobic003G394150 Sobic009G053700 Sobic009G053700 Sobic010G020000--Sobic009G053700 Sobic002G168700 Sobic002G168700 Sobic010G020000--Sobic002G168700 Sobic007G083700 Sobic007G083700 Sobic010G020000--Sobic007G083700 Sobic010G020000--Sobic003G383000 Sobic009G178650 Sobic009G178650 Sobic010G020000--Sobic009G178650 Sobic004G216650 Sobic004G216650 Sobic010G020000--Sobic004G216650 Sobic010G020000--Sobic003G257650 Sobic003G373050 Sobic003G373050 Sobic010G020000--Sobic003G373050 Sobic003G394150--Sobic002G395400 Sobic003G394150--Sobic010G020000 Sobic003G394150--Sobic003G257650 Sobic003G394150--Sobic009G053700 Sobic001G143850 Sobic001G143850 Sobic003G394150--Sobic001G143850 Sobic002G204700 Sobic002G204700 Sobic003G394150--Sobic002G204700 Sobic003G394150--Sobic003G432400 Sobic003G394150--Sobic007G043750 Sobic003G394150--Sobic002G367000 Sobic007G137201 Sobic007G137201 Sobic001G089850--Sobic007G137201 Sobic004G080901 Sobic004G080901 Sobic001G089850--Sobic004G080901 Sobic001G089850--Sobic010G226100 Sobic001G089850--Sobic005G078600 Sobic001G089850--Sobic003G257650 Sobic009G177100 Sobic009G177100 Sobic001G089850--Sobic009G177100 Sobic001G486400 Sobic001G486400 Sobic001G089850--Sobic001G486400 Sobic005G198150 Sobic005G198150 Sobic001G089850--Sobic005G198150 Sobic001G089850--Sobic010G228800 Sobic003G198850--Sobic003G383000 Sobic003G198850--Sobic001G404950 Sobic008G053800 Sobic008G053800 Sobic003G198850--Sobic008G053800 Sobic003G198850--Sobic004G115950 Sobic001G072100 Sobic001G072100 Sobic003G198850--Sobic001G072100 Sobic003G288700 Sobic003G288700 Sobic003G198850--Sobic003G288700 Sobic004G023800 Sobic004G023800 Sobic003G198850--Sobic004G023800 Sobic003G198850--SobicK004201 Sobic003G198850--Sobic002G149500
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.