Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G056100.2
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YMY3
Pfam PF12274
Panther DB PTHR33120 PTHR33120:SF14
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G35330 : RING/U-box superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g34860.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G172900 expressed protein -
2 Sobic.009G066000 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -
3 Sobic.007G139950 - -
4 Sobic.003G331550 - -
5 Sobic.006G115400 ZOS4-08 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
6 Sobic.007G220066 - -
7 Sobic.002G105501 - -
8 Sobic.002G341400 expressed protein -
9 Sobic.005G008700 pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.010G046200 NBS-LRR type disease resistance protein, putative, expressed -
11 Sobic.003G162200 IPP transferase, putative, expressed K10760: adenylate dimethylallyltransferase (cytokinin synthase)
12 Sobic.003G386350 - -
13 Sobic.003G049100 prolyl 4-hydroxylase, putative, expressed K00472: prolyl 4-hydroxylase
14 Sobic.003G089900 seven in absentia protein family protein, putative, expressed -
15 Sobic.007G141001 - -
16 Sobic.006G145400 Os4bglu14 - monolignol beta-glucoside homologue without catalytic acid/base, expressed K05350: beta-glucosidase
17 Sobic.005G082000 DEFL8 - Defensin and Defensin-like DEFL family -
18 Sobic.002G143600 expressed protein -
19 Sobic.004G345300 expressed protein -
20 Sobic.001G303300 exostosin family domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G056100 Sobic004G056100 Sobic007G172900 Sobic007G172900 Sobic004G056100--Sobic007G172900 Sobic009G066000 Sobic009G066000 Sobic004G056100--Sobic009G066000 Sobic007G139950 Sobic007G139950 Sobic004G056100--Sobic007G139950 Sobic003G331550 Sobic003G331550 Sobic004G056100--Sobic003G331550 Sobic006G115400 Sobic006G115400 Sobic004G056100--Sobic006G115400 Sobic007G220066 Sobic007G220066 Sobic004G056100--Sobic007G220066 Sobic002G105501 Sobic002G105501 Sobic004G056100--Sobic002G105501 Sobic002G341400 Sobic002G341400 Sobic004G056100--Sobic002G341400 Sobic005G008700 Sobic005G008700 Sobic004G056100--Sobic005G008700 Sobic007G172900--Sobic004G056100 Sobic007G172900--Sobic006G115400 Sobic007G172900--Sobic009G066000 Sobic007G172900--Sobic007G139950 Sobic007G172900--Sobic005G008700 Sobic007G172900--Sobic003G331550 Sobic010G046200 Sobic010G046200 Sobic007G172900--Sobic010G046200 Sobic003G162200 Sobic003G162200 Sobic007G172900--Sobic003G162200 Sobic007G172900--Sobic007G220066 Sobic009G066000--Sobic007G139950 Sobic009G066000--Sobic007G220066 Sobic009G066000--Sobic002G105501 Sobic009G066000--Sobic006G115400 Sobic009G066000--Sobic003G331550 Sobic009G066000--Sobic003G162200 Sobic009G066000--Sobic002G341400 Sobic009G066000--Sobic010G046200 Sobic009G066000--Sobic004G056100 Sobic007G139950--Sobic009G066000 Sobic007G139950--Sobic003G331550 Sobic007G139950--Sobic006G115400 Sobic007G139950--Sobic003G162200 Sobic007G139950--Sobic007G220066 Sobic007G139950--Sobic002G105501 Sobic007G139950--Sobic002G341400 Sobic007G141001 Sobic007G141001 Sobic007G139950--Sobic007G141001 Sobic003G049100 Sobic003G049100 Sobic007G139950--Sobic003G049100 Sobic003G331550--Sobic007G139950 Sobic003G331550--Sobic009G066000 Sobic003G331550--Sobic002G341400 Sobic003G331550--Sobic003G162200 Sobic003G331550--Sobic006G115400 Sobic003G331550--Sobic003G049100 Sobic009G244450 Sobic009G244450 Sobic003G331550--Sobic009G244450 Sobic003G331550--Sobic007G141001 Sobic003G331550--Sobic010G046200 Sobic006G115400--Sobic007G139950 Sobic006G115400--Sobic009G066000 Sobic006G115400--Sobic003G331550 Sobic006G115400--Sobic003G162200 Sobic006G115400--Sobic007G220066 Sobic006G115400--Sobic002G105501 Sobic006G115400--Sobic002G341400 Sobic006G115400--Sobic007G172900 Sobic006G115400--Sobic003G049100 Sobic007G220066--Sobic002G105501 Sobic007G220066--Sobic009G066000 Sobic007G220066--Sobic007G139950 Sobic009G096566 Sobic009G096566 Sobic007G220066--Sobic009G096566 Sobic007G220066--Sobic006G115400 Sobic003G386350 Sobic003G386350 Sobic007G220066--Sobic003G386350 Sobic004G349500 Sobic004G349500 Sobic007G220066--Sobic004G349500 Sobic007G220066--Sobic003G331550 Sobic007G220066--Sobic010G046200 Sobic002G105501--Sobic007G220066 Sobic002G105501--Sobic009G066000 Sobic002G105501--Sobic007G139950 Sobic002G105501--Sobic009G096566 Sobic002G105501--Sobic006G115400 Sobic002G105501--Sobic003G386350 Sobic002G105501--Sobic004G349500 Sobic002G105501--Sobic003G331550 Sobic002G105501--Sobic010G046200 Sobic002G143600 Sobic002G143600 Sobic002G341400--Sobic002G143600 Sobic002G069601 Sobic002G069601 Sobic002G341400--Sobic002G069601 Sobic003G353050 Sobic003G353050 Sobic002G341400--Sobic003G353050 Sobic001G025201 Sobic001G025201 Sobic002G341400--Sobic001G025201 Sobic003G318400 Sobic003G318400 Sobic002G341400--Sobic003G318400 Sobic002G333200 Sobic002G333200 Sobic002G341400--Sobic002G333200 Sobic007G059800 Sobic007G059800 Sobic002G341400--Sobic007G059800 Sobic002G341400--Sobic003G049100 Sobic008G192100 Sobic008G192100 Sobic002G341400--Sobic008G192100 Sobic005G008700--Sobic003G049100 Sobic006G053500 Sobic006G053500 Sobic005G008700--Sobic006G053500 Sobic003G063600 Sobic003G063600 Sobic005G008700--Sobic003G063600 Sobic005G008700--Sobic003G162200 Sobic004G196000 Sobic004G196000 Sobic005G008700--Sobic004G196000 Sobic004G289700 Sobic004G289700 Sobic005G008700--Sobic004G289700 Sobic001G218701 Sobic001G218701 Sobic005G008700--Sobic001G218701 Sobic001G493300 Sobic001G493300 Sobic005G008700--Sobic001G493300 Sobic005G082000 Sobic005G082000 Sobic005G008700--Sobic005G082000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.