Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G172000.1
Synonym Sb04g022290
Functional annotation -
UniProt A0A194YQ57
Pfam PF03108
Panther DB PTHR31973 PTHR31973:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g26170.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G172000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G102600 - -
2 Sobic.004G083250 - -
3 Sobic.001G122700 expressed protein -
4 Sobic.003G012750 - -
5 Sobic.002G365200 - -
6 Sobic.001G127600 ZOS3-15 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
7 Sobic.005G110350 - -
8 Sobic.008G053500 bile acid sodium symporter family protein, putative, expressed K03453: bile acid:Na+ symporter, BASS family
9 Sobic.001G197700 - -
10 Sobic.010G252301 - -
11 Sobic.003G203900 PME/invertase inhibitor, putative, expressed -
12 Sobic.010G045966 - -
13 Sobic.010G248150 - -
14 Sobic.001G325100 DUF623 domain containing protein, expressed -
15 Sobic.003G244401 - -
16 Sobic.001G111650 - -
17 Sobic.002G025900 expressed protein -
18 Sobic.003G441301 - -
19 Sobic.005G183900 pleiotropic drug resistance protein, putative, expressed -
20 Sobic.001G325500 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic004G172000 Sobic004G172000 Sobic005G102600 Sobic005G102600 Sobic004G172000--Sobic005G102600 Sobic004G083250 Sobic004G083250 Sobic004G172000--Sobic004G083250 Sobic001G122700 Sobic001G122700 Sobic004G172000--Sobic001G122700 Sobic003G012750 Sobic003G012750 Sobic004G172000--Sobic003G012750 Sobic002G365200 Sobic002G365200 Sobic004G172000--Sobic002G365200 Sobic001G127600 Sobic001G127600 Sobic004G172000--Sobic001G127600 Sobic005G110350 Sobic005G110350 Sobic004G172000--Sobic005G110350 Sobic008G053500 Sobic008G053500 Sobic004G172000--Sobic008G053500 Sobic001G197700 Sobic001G197700 Sobic004G172000--Sobic001G197700 Sobic005G102600--Sobic001G122700 Sobic005G102600--Sobic001G127600 Sobic009G185000 Sobic009G185000 Sobic005G102600--Sobic009G185000 Sobic002G282800 Sobic002G282800 Sobic005G102600--Sobic002G282800 Sobic002G018250 Sobic002G018250 Sobic005G102600--Sobic002G018250 Sobic010G207450 Sobic010G207450 Sobic005G102600--Sobic010G207450 Sobic002G089300 Sobic002G089300 Sobic005G102600--Sobic002G089300 Sobic001G090900 Sobic001G090900 Sobic005G102600--Sobic001G090900 Sobic010G248150 Sobic010G248150 Sobic005G102600--Sobic010G248150 Sobic004G083250--Sobic004G172000 Sobic004G083250--Sobic010G248150 Sobic001G222100 Sobic001G222100 Sobic004G083250--Sobic001G222100 Sobic002G392900 Sobic002G392900 Sobic004G083250--Sobic002G392900 Sobic004G083250--Sobic005G102600 Sobic004G083250--Sobic010G207450 Sobic004G083250--Sobic001G122700 Sobic002G317900 Sobic002G317900 Sobic004G083250--Sobic002G317900 Sobic006G257550 Sobic006G257550 Sobic004G083250--Sobic006G257550 Sobic001G122700--Sobic001G127600 Sobic001G122700--Sobic005G102600 Sobic001G122700--Sobic002G089300 Sobic004G196900 Sobic004G196900 Sobic001G122700--Sobic004G196900 Sobic004G295200 Sobic004G295200 Sobic001G122700--Sobic004G295200 Sobic003G244401 Sobic003G244401 Sobic001G122700--Sobic003G244401 Sobic001G122700--Sobic010G248150 Sobic006G229400 Sobic006G229400 Sobic001G122700--Sobic006G229400 Sobic001G122700--Sobic009G185000 Sobic010G025600 Sobic010G025600 Sobic003G012750--Sobic010G025600 Sobic006G199601 Sobic006G199601 Sobic003G012750--Sobic006G199601 Sobic003G012750--Sobic008G053500 Sobic005G110517 Sobic005G110517 Sobic003G012750--Sobic005G110517 Sobic003G012750--Sobic002G365200 Sobic004G140900 Sobic004G140900 Sobic003G012750--Sobic004G140900 Sobic001G288500 Sobic001G288500 Sobic003G012750--Sobic001G288500 Sobic010G167700 Sobic010G167700 Sobic003G012750--Sobic010G167700 Sobic001G251750 Sobic001G251750 Sobic003G012750--Sobic001G251750 Sobic002G365200--Sobic008G053500 Sobic002G365200--Sobic003G012750 Sobic002G074700 Sobic002G074700 Sobic002G365200--Sobic002G074700 Sobic002G365200--Sobic006G199601 Sobic003G263450 Sobic003G263450 Sobic002G365200--Sobic003G263450 Sobic001G325100 Sobic001G325100 Sobic002G365200--Sobic001G325100 Sobic007G079901 Sobic007G079901 Sobic002G365200--Sobic007G079901 Sobic002G365200--Sobic004G140900 Sobic002G149600 Sobic002G149600 Sobic002G365200--Sobic002G149600 Sobic001G127600--Sobic001G122700 Sobic001G127600--Sobic005G102600 Sobic001G127600--Sobic002G089300 Sobic001G127600--Sobic004G196900 Sobic001G127600--Sobic006G229400 Sobic001G127600--Sobic009G185000 Sobic009G244450 Sobic009G244450 Sobic001G127600--Sobic009G244450 Sobic002G341400 Sobic002G341400 Sobic001G127600--Sobic002G341400 Sobic005G029300 Sobic005G029300 Sobic001G127600--Sobic005G029300 Sobic010G252301 Sobic010G252301 Sobic005G110350--Sobic010G252301 Sobic010G045966 Sobic010G045966 Sobic005G110350--Sobic010G045966 Sobic002G025900 Sobic002G025900 Sobic005G110350--Sobic002G025900 Sobic009G055700 Sobic009G055700 Sobic005G110350--Sobic009G055700 Sobic008G167900 Sobic008G167900 Sobic005G110350--Sobic008G167900 Sobic005G183900 Sobic005G183900 Sobic005G110350--Sobic005G183900 Sobic001G440401 Sobic001G440401 Sobic005G110350--Sobic001G440401 Sobic003G288700 Sobic003G288700 Sobic005G110350--Sobic003G288700 Sobic004G092950 Sobic004G092950 Sobic005G110350--Sobic004G092950 Sobic008G053500--Sobic002G365200 Sobic008G053500--Sobic006G199601 Sobic008G053500--Sobic001G325100 Sobic008G053500--Sobic010G045966 Sobic008G053500--Sobic003G012750 Sobic008G053500--Sobic002G074700 Sobic008G053500--Sobic010G025600 Sobic008G053500--Sobic001G288500 Sobic008G138850 Sobic008G138850 Sobic008G053500--Sobic008G138850 Sobic002G018000 Sobic002G018000 Sobic001G197700--Sobic002G018000 Sobic001G197700--Sobic005G102600 Sobic001G197700--Sobic002G018250 Sobic010G200100 Sobic010G200100 Sobic001G197700--Sobic010G200100 Sobic002G320300 Sobic002G320300 Sobic001G197700--Sobic002G320300 Sobic003G247100 Sobic003G247100 Sobic001G197700--Sobic003G247100 Sobic003G203900 Sobic003G203900 Sobic001G197700--Sobic003G203900 Sobic006G080200 Sobic006G080200 Sobic001G197700--Sobic006G080200 Sobic001G197700--Sobic010G207450
Octagon: transcription factors


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