Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G012100.1
Synonym Sb05g001060
Functional annotation RING-H2 finger protein, putative, expressed
UniProt C5Y3F7
Pfam PF13639
Panther DB PTHR14155 PTHR14155:SF102
NCBI CDD KOG1493; Anaphase-promoting complex (APC), subunit 11
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0005515protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G35330 : RING/U-box superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g40020.1 : RING-H2 finger protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.009G147450 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G012100 Sobic005G012100 Sobic003G192900 Sobic003G192900 Sobic005G012100--Sobic003G192900 Sobic002G310400 Sobic002G310400 Sobic005G012100--Sobic002G310400 Sobic004G104250 Sobic004G104250 Sobic005G012100--Sobic004G104250 Sobic007G089400 Sobic007G089400 Sobic005G012100--Sobic007G089400 Sobic010G278900 Sobic010G278900 Sobic005G012100--Sobic010G278900 Sobic010G081950 Sobic010G081950 Sobic005G012100--Sobic010G081950 Sobic009G124100 Sobic009G124100 Sobic005G012100--Sobic009G124100 Sobic004G024350 Sobic004G024350 Sobic005G012100--Sobic004G024350 Sobic010G046801 Sobic010G046801 Sobic005G012100--Sobic010G046801 Sobic003G192900--Sobic002G310400 Sobic003G192900--Sobic004G104250 Sobic003G192900--Sobic010G081950 Sobic003G192900--Sobic004G024350 Sobic001G331401 Sobic001G331401 Sobic003G192900--Sobic001G331401 Sobic003G192900--Sobic010G278900 Sobic003G192900--Sobic009G124100 Sobic002G232300 Sobic002G232300 Sobic003G192900--Sobic002G232300 Sobic009G147450 Sobic009G147450 Sobic003G192900--Sobic009G147450 Sobic002G310400--Sobic004G104250 Sobic002G310400--Sobic010G081950 Sobic002G310400--Sobic001G331401 Sobic002G310400--Sobic009G124100 Sobic002G310400--Sobic004G024350 Sobic002G310400--Sobic009G147450 Sobic001G488800 Sobic001G488800 Sobic002G310400--Sobic001G488800 Sobic010G018200 Sobic010G018200 Sobic002G310400--Sobic010G018200 Sobic005G065050 Sobic005G065050 Sobic002G310400--Sobic005G065050 Sobic004G104250--Sobic009G124100 Sobic004G104250--Sobic010G081950 Sobic004G104250--Sobic002G310400 Sobic006G089350 Sobic006G089350 Sobic004G104250--Sobic006G089350 Sobic005G224601 Sobic005G224601 Sobic004G104250--Sobic005G224601 Sobic006G210233 Sobic006G210233 Sobic004G104250--Sobic006G210233 Sobic001G035700 Sobic001G035700 Sobic004G104250--Sobic001G035700 Sobic004G104250--Sobic001G488800 Sobic005G165950 Sobic005G165950 Sobic004G104250--Sobic005G165950 Sobic003G069300 Sobic003G069300 Sobic007G089400--Sobic003G069300 Sobic004G230000 Sobic004G230000 Sobic007G089400--Sobic004G230000 Sobic005G187800 Sobic005G187800 Sobic010G278900--Sobic005G187800 Sobic010G278900--Sobic002G232300 Sobic008G007500 Sobic008G007500 Sobic010G278900--Sobic008G007500 Sobic001G259850 Sobic001G259850 Sobic010G278900--Sobic001G259850 Sobic008G029000 Sobic008G029000 Sobic010G278900--Sobic008G029000 Sobic010G278900--Sobic010G018200 Sobic005G199151 Sobic005G199151 Sobic010G278900--Sobic005G199151 Sobic004G351000 Sobic004G351000 Sobic010G278900--Sobic004G351000 Sobic003G003300 Sobic003G003300 Sobic010G278900--Sobic003G003300 Sobic010G081950--Sobic004G104250 Sobic010G081950--Sobic009G124100 Sobic010G081950--Sobic002G310400 Sobic010G081950--Sobic006G089350 Sobic010G081950--Sobic005G224601 Sobic004G238400 Sobic004G238400 Sobic010G081950--Sobic004G238400 Sobic010G081950--Sobic006G210233 Sobic010G081950--Sobic001G035700 Sobic010G081950--Sobic001G488800 Sobic009G124100--Sobic004G104250 Sobic009G124100--Sobic010G081950 Sobic009G124100--Sobic001G035700 Sobic009G124100--Sobic002G310400 Sobic009G124100--Sobic006G089350 Sobic009G124100--Sobic005G224601 Sobic009G124100--Sobic006G210233 Sobic009G124100--Sobic001G488800 Sobic009G124100--Sobic005G165950 Sobic003G344501 Sobic003G344501 Sobic004G024350--Sobic003G344501 Sobic004G024350--Sobic004G230000 Sobic010G046801--Sobic004G024350 Sobic010G046801--Sobic002G310400 Sobic004G187501 Sobic004G187501 Sobic010G046801--Sobic004G187501 Sobic002G125400 Sobic002G125400 Sobic010G046801--Sobic002G125400 Sobic010G046801--Sobic004G230000
Octagon: transcription factors


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