Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G074900.1
Synonym
Functional annotation LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed
UniProt A0A1B6PQR8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g13960.1 : LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G036201 - -
2 Sobic.009G051301 - -
3 Sobic.005G148600 - -
4 Sobic.004G196200 cytochrome P450, putative, expressed K12639: CYP724B1, cytochrome P450 family 724 subfamily B polypeptide 1
5 Sobic.005G090500 - -
6 Sobic.006G271400 methyl-CpG binding domain containing protein, expressed -
7 Sobic.005G074800 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
8 Sobic.009G086800 no apical meristem protein, putative, expressed -
9 Sobic.006G279000 expressed protein -
10 Sobic.009G061800 BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1 precursor, putative, expressed -
11 Sobic.002G291132 - -
12 Sobic.009G039900 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
13 Sobic.007G147300 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed K09286: EREBP-like factor
14 Sobic.007G082900 - -
15 Sobic.010G216800 expressed protein -
16 Sobic.010G209300 expressed protein -
17 Sobic.003G350900 homeobox domain containing protein, expressed -
18 Sobic.008G001700 Homologous to Dof genes in Arabidopsis and rice.(PubMedID : 21161392)@Phylogenetic analysis of cloned SbDof genes along with other reported Dof proteins. The 3D structural prediction of SbDof proteins based on multiple threading method.(PubMedID : 22476870)@"PBF1(Ortholog in maize:Lang et al., 2014)"(PubMedID : 31659911)@Upregulated in response to drought and salt stress(PubMedID : 27230576)@dof zinc finger domain containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.001G530400 expressed protein -
20 Sobic.004G116200 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic005G074900 Sobic005G074900 Sobic006G036201 Sobic006G036201 Sobic005G074900--Sobic006G036201 Sobic009G051301 Sobic009G051301 Sobic005G074900--Sobic009G051301 Sobic005G148600 Sobic005G148600 Sobic005G074900--Sobic005G148600 Sobic004G196200 Sobic004G196200 Sobic005G074900--Sobic004G196200 Sobic005G090500 Sobic005G090500 Sobic005G074900--Sobic005G090500 Sobic006G271400 Sobic006G271400 Sobic005G074900--Sobic006G271400 Sobic005G074800 Sobic005G074800 Sobic005G074900--Sobic005G074800 Sobic009G086800 Sobic009G086800 Sobic005G074900--Sobic009G086800 Sobic006G279000 Sobic006G279000 Sobic005G074900--Sobic006G279000 Sobic006G036201--Sobic005G074900 Sobic006G036201--Sobic009G051301 Sobic002G291132 Sobic002G291132 Sobic006G036201--Sobic002G291132 Sobic006G036201--Sobic009G086800 Sobic001G530400 Sobic001G530400 Sobic006G036201--Sobic001G530400 Sobic006G036201--Sobic004G196200 Sobic009G061800 Sobic009G061800 Sobic006G036201--Sobic009G061800 Sobic006G036201--Sobic005G148600 Sobic006G036201--Sobic006G279000 Sobic009G051301--Sobic005G074900 Sobic009G051301--Sobic006G036201 Sobic009G051301--Sobic004G196200 Sobic009G051301--Sobic005G148600 Sobic009G051301--Sobic005G090500 Sobic009G051301--Sobic005G074800 Sobic009G051301--Sobic006G271400 Sobic007G082900 Sobic007G082900 Sobic009G051301--Sobic007G082900 Sobic009G051301--Sobic009G086800 Sobic005G148600--Sobic004G196200 Sobic005G148600--Sobic005G074800 Sobic005G148600--Sobic005G090500 Sobic009G039900 Sobic009G039900 Sobic005G148600--Sobic009G039900 Sobic006G064700 Sobic006G064700 Sobic005G148600--Sobic006G064700 Sobic005G153400 Sobic005G153400 Sobic005G148600--Sobic005G153400 Sobic009G039100 Sobic009G039100 Sobic005G148600--Sobic009G039100 Sobic005G148600--Sobic007G082900 Sobic005G148600--Sobic005G074900 Sobic004G196200--Sobic005G148600 Sobic004G196200--Sobic005G074800 Sobic004G196200--Sobic007G082900 Sobic010G219300 Sobic010G219300 Sobic004G196200--Sobic010G219300 Sobic004G196200--Sobic009G039900 Sobic004G196200--Sobic005G090500 Sobic004G196200--Sobic005G153400 Sobic010G034900 Sobic010G034900 Sobic004G196200--Sobic010G034900 Sobic004G196200--Sobic005G074900 Sobic005G090500--Sobic005G074800 Sobic005G090500--Sobic005G148600 Sobic002G053100 Sobic002G053100 Sobic005G090500--Sobic002G053100 Sobic005G090500--Sobic004G196200 Sobic005G090500--Sobic006G271400 Sobic004G171500 Sobic004G171500 Sobic005G090500--Sobic004G171500 Sobic005G090500--Sobic006G064700 Sobic008G001700 Sobic008G001700 Sobic005G090500--Sobic008G001700 Sobic005G090500--Sobic005G074900 Sobic005G075000 Sobic005G075000 Sobic006G271400--Sobic005G075000 Sobic010G209300 Sobic010G209300 Sobic006G271400--Sobic010G209300 Sobic006G271400--Sobic005G090500 Sobic006G031000 Sobic006G031000 Sobic006G271400--Sobic006G031000 Sobic010G058000 Sobic010G058000 Sobic006G271400--Sobic010G058000 Sobic006G271400--Sobic005G074900 Sobic002G408700 Sobic002G408700 Sobic006G271400--Sobic002G408700 Sobic006G271400--Sobic002G053100 Sobic003G363300 Sobic003G363300 Sobic006G271400--Sobic003G363300 Sobic005G074800--Sobic005G148600 Sobic005G074800--Sobic004G196200 Sobic005G074800--Sobic005G090500 Sobic005G074800--Sobic010G034900 Sobic002G345400 Sobic002G345400 Sobic005G074800--Sobic002G345400 Sobic005G102451 Sobic005G102451 Sobic005G074800--Sobic005G102451 Sobic005G074800--Sobic010G219300 Sobic005G056100 Sobic005G056100 Sobic005G074800--Sobic005G056100 Sobic008G064000 Sobic008G064000 Sobic005G074800--Sobic008G064000 Sobic007G147300 Sobic007G147300 Sobic009G086800--Sobic007G147300 Sobic004G116200 Sobic004G116200 Sobic009G086800--Sobic004G116200 Sobic009G086800--Sobic008G001700 Sobic009G086800--Sobic009G061800 Sobic009G086800--Sobic002G291132 Sobic002G088000 Sobic002G088000 Sobic009G086800--Sobic002G088000 Sobic005G188000 Sobic005G188000 Sobic009G086800--Sobic005G188000 Sobic003G350900 Sobic003G350900 Sobic009G086800--Sobic003G350900 Sobic009G086800--Sobic004G171500 Sobic002G147500 Sobic002G147500 Sobic006G279000--Sobic002G147500 Sobic004G090300 Sobic004G090300 Sobic006G279000--Sobic004G090300 Sobic001G330600 Sobic001G330600 Sobic006G279000--Sobic001G330600 Sobic006G279000--Sobic006G036201 Sobic006G279000--Sobic005G074900 Sobic006G279000--Sobic003G363300 Sobic006G279000--Sobic005G075000 Sobic006G279000--Sobic006G271400 Sobic001G234000 Sobic001G234000 Sobic006G279000--Sobic001G234000
Octagon: transcription factors


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