Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G131600.3,Sobic.005G131600.2,Sobic.005G131600.4,Sobic.005G131600.5
Synonym Sb05g019510
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RID7 , A0A1Z5RIH3 , A0A1Z5RJB5 , A0A1Z5RJK6
Pfam PF08263 PF00560 PF07714 PF13855 PF00560 PF13855 PF00069 PF00560 PF13855 PF07714 PF00560 PF07714 PF13855
Panther DB PTHR27000 PTHR27000:SF152
NCBI CDD KOG1187; Serine/threonine protein kinase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding GO:0006468protein phosphorylation GO:0004672protein kinase activity GO:0005515protein binding GO:0006468protein phosphorylation GO:0005524ATP binding GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G47570 : Leucine-rich repeat protein kinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g45630.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029814 , Zm00025a041926
Brachypodium KQK00343
Barley HORVU7Hr1G108490.1 , HORVU7Hr1G108490.3 , HORVU7Hr1G108490.2 , HORVU7Hr1G108490.5 , HORVU7Hr1G108490.4 , HORVU7Hr1G108490.7 , HORVU7Hr1G108490.6 , HORVU7Hr1G108490.9 , HORVU7Hr1G108490.8
Wheat TraesCS7D02G463700 , TraesCS7A02G476800
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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9 Sobic.006G094900 DUF567 domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.009G213150 - -
11 Sobic.004G223700 - -
12 Sobic.010G098800 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6, putative, expressed K03884: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6
13 Sobic.002G152100 alpha-galactosidase precursor, putative, expressed -
14 Sobic.003G173200 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4, putative, expressed -
15 Sobic.002G149600 - -
16 Sobic.004G334501 - -
17 Sobic.001G081450 - -
18 Sobic.009G094100 - -
19 Sobic.007G116150 - -
20 Sobic.002G094100 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G131600 Sobic005G131600 Sobic005G024500 Sobic005G024500 Sobic005G131600--Sobic005G024500 Sobic003G172000 Sobic003G172000 Sobic005G131600--Sobic003G172000 Sobic002G121050 Sobic002G121050 Sobic005G131600--Sobic002G121050 Sobic002G094000 Sobic002G094000 Sobic005G131600--Sobic002G094000 Sobic002G073000 Sobic002G073000 Sobic005G131600--Sobic002G073000 Sobic004G272950 Sobic004G272950 Sobic005G131600--Sobic004G272950 Sobic007G179266 Sobic007G179266 Sobic005G131600--Sobic007G179266 Sobic005G019300 Sobic005G019300 Sobic005G131600--Sobic005G019300 Sobic006G094900 Sobic006G094900 Sobic005G131600--Sobic006G094900 Sobic005G024500--Sobic002G094000 Sobic005G024500--Sobic005G019300 Sobic005G024500--Sobic003G172000 Sobic005G024500--Sobic002G073000 Sobic005G024500--Sobic002G121050 Sobic005G024500--Sobic006G094900 Sobic004G334501 Sobic004G334501 Sobic005G024500--Sobic004G334501 Sobic002G094100 Sobic002G094100 Sobic005G024500--Sobic002G094100 Sobic009G097500 Sobic009G097500 Sobic005G024500--Sobic009G097500 Sobic003G172000--Sobic002G121050 Sobic002G149600 Sobic002G149600 Sobic003G172000--Sobic002G149600 Sobic003G172000--Sobic004G272950 Sobic002G074700 Sobic002G074700 Sobic003G172000--Sobic002G074700 Sobic009G094100 Sobic009G094100 Sobic003G172000--Sobic009G094100 Sobic003G172000--Sobic005G024500 Sobic002G152100 Sobic002G152100 Sobic003G172000--Sobic002G152100 Sobic003G172000--Sobic006G094900 Sobic003G263450 Sobic003G263450 Sobic003G172000--Sobic003G263450 Sobic002G121050--Sobic003G172000 Sobic002G121050--Sobic002G149600 Sobic002G121050--Sobic002G074700 Sobic002G121050--Sobic004G272950 Sobic002G121050--Sobic009G094100 Sobic002G121050--Sobic003G263450 Sobic002G121050--Sobic006G094900 Sobic002G121050--Sobic002G152100 Sobic002G121050--Sobic005G024500 Sobic002G094000--Sobic005G024500 Sobic002G094000--Sobic005G019300 Sobic002G094000--Sobic002G073000 Sobic002G094000--Sobic002G094100 Sobic003G142500 Sobic003G142500 Sobic002G094000--Sobic003G142500 Sobic002G094000--Sobic006G094900 Sobic009G213150 Sobic009G213150 Sobic002G094000--Sobic009G213150 Sobic004G278800 Sobic004G278800 Sobic002G094000--Sobic004G278800 Sobic002G094000--Sobic004G334501 Sobic002G073000--Sobic002G094000 Sobic010G166201 Sobic010G166201 Sobic002G073000--Sobic010G166201 Sobic002G073000--Sobic005G024500 Sobic010G098800 Sobic010G098800 Sobic002G073000--Sobic010G098800 Sobic003G173200 Sobic003G173200 Sobic002G073000--Sobic003G173200 Sobic004G223700 Sobic004G223700 Sobic002G073000--Sobic004G223700 Sobic002G073000--Sobic002G094100 Sobic002G073000--Sobic004G334501 Sobic002G073000--Sobic002G121050 Sobic004G272950--Sobic004G223700 Sobic003G168600 Sobic003G168600 Sobic004G272950--Sobic003G168600 Sobic009G209650 Sobic009G209650 Sobic004G272950--Sobic009G209650 Sobic001G081450 Sobic001G081450 Sobic004G272950--Sobic001G081450 Sobic004G272950--Sobic003G172000 Sobic007G116150 Sobic007G116150 Sobic004G272950--Sobic007G116150 Sobic004G272950--Sobic002G121050 SobicK031300 SobicK031300 Sobic004G272950--SobicK031300 Sobic004G272950--Sobic002G152100 Sobic007G179266--Sobic009G213150 Sobic007G179266--Sobic006G094900 Sobic004G127350 Sobic004G127350 Sobic007G179266--Sobic004G127350 Sobic009G188200 Sobic009G188200 Sobic007G179266--Sobic009G188200 Sobic007G179266--Sobic002G094000 Sobic008G129500 Sobic008G129500 Sobic007G179266--Sobic008G129500 Sobic007G179266--Sobic009G094100 Sobic007G179266--Sobic009G097500 Sobic007G179266--Sobic002G094100 Sobic005G019300--Sobic002G094000 Sobic005G019300--Sobic005G024500 Sobic005G019300--Sobic006G094900 Sobic005G019300--Sobic003G172000 Sobic005G019300--Sobic002G121050 Sobic005G019300--Sobic002G073000 Sobic005G019300--Sobic009G213150 Sobic005G019300--Sobic004G278800 Sobic005G019300--Sobic002G094100 Sobic006G094900--Sobic002G121050 Sobic006G094900--Sobic003G172000 Sobic006G094900--Sobic002G094000 Sobic006G094900--Sobic002G149600 Sobic006G094900--Sobic009G213150 Sobic006G094900--Sobic005G024500 Sobic006G094900--Sobic007G179266 Sobic001G154450 Sobic001G154450 Sobic006G094900--Sobic001G154450 Sobic006G094900--Sobic009G094100
Octagon: transcription factors


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