Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G152932.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RJ06
Pfam PF00304
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g11195.1 : gamma-thionin family domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G109000 response regulator receiver domain containing protein, expressed K14492: two-component response regulator ARR-A family
2 Sobic.005G153500 - -
3 Sobic.010G119100 - -
4 Sobic.004G017700 trehalose-6-phosphate synthase, putative, expressed K16055: trehalose 6-phosphate synthase/phosphatase
5 Sobic.010G069800 cytochrome P450 72A1, putative, expressed K15639: CYP734A1, PHYB activation tagged suppressor 1
6 Sobic.005G221200 - -
7 Sobic.005G074700 LTPL32 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
8 Sobic.005G174600 - -
9 Sobic.005G148700 - -
10 Sobic.005G141500 - -
11 Sobic.009G039000 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
12 Sobic.005G149800 - -
13 Sobic.010G010300 - -
14 Sobic.005G109900 cytochrome P450, putative, expressed K05917: sterol 14alpha-demethylase
15 Sobic.009G039700 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
16 Sobic.005G174700 DEFL74 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
17 Sobic.006G276401 - -
18 Sobic.003G057650 - -
19 Sobic.005G109800 cytochrome P450, putative, expressed K05917: sterol 14alpha-demethylase
20 Sobic.003G363300 hydrolase, alpha/beta fold family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G152932 Sobic005G152932 Sobic007G109000 Sobic007G109000 Sobic005G152932--Sobic007G109000 Sobic005G153500 Sobic005G153500 Sobic005G152932--Sobic005G153500 Sobic010G119100 Sobic010G119100 Sobic005G152932--Sobic010G119100 Sobic004G017700 Sobic004G017700 Sobic005G152932--Sobic004G017700 Sobic010G069800 Sobic010G069800 Sobic005G152932--Sobic010G069800 Sobic005G221200 Sobic005G221200 Sobic005G152932--Sobic005G221200 Sobic005G074700 Sobic005G074700 Sobic005G152932--Sobic005G074700 Sobic005G174600 Sobic005G174600 Sobic005G152932--Sobic005G174600 Sobic005G148700 Sobic005G148700 Sobic005G152932--Sobic005G148700 Sobic009G039000 Sobic009G039000 Sobic007G109000--Sobic009G039000 Sobic007G109000--Sobic005G074700 Sobic007G109000--Sobic010G119100 Sobic007G109000--Sobic004G017700 Sobic007G047000 Sobic007G047000 Sobic007G109000--Sobic007G047000 Sobic007G109000--Sobic005G152932 Sobic007G109000--Sobic005G148700 Sobic005G082400 Sobic005G082400 Sobic007G109000--Sobic005G082400 Sobic006G276401 Sobic006G276401 Sobic007G109000--Sobic006G276401 Sobic005G153500--Sobic005G174600 Sobic010G010300 Sobic010G010300 Sobic005G153500--Sobic010G010300 Sobic009G006800 Sobic009G006800 Sobic005G153500--Sobic009G006800 Sobic005G149800 Sobic005G149800 Sobic005G153500--Sobic005G149800 Sobic003G415800 Sobic003G415800 Sobic005G153500--Sobic003G415800 Sobic005G153500--Sobic005G221200 Sobic005G141500 Sobic005G141500 Sobic005G153500--Sobic005G141500 Sobic001G270600 Sobic001G270600 Sobic005G153500--Sobic001G270600 Sobic010G137700 Sobic010G137700 Sobic005G153500--Sobic010G137700 Sobic010G119100--Sobic007G109000 Sobic010G119100--Sobic005G074700 Sobic010G119100--Sobic005G152932 Sobic010G119100--Sobic007G047000 Sobic010G119100--Sobic009G039000 Sobic010G119100--Sobic004G017700 Sobic010G233500 Sobic010G233500 Sobic010G119100--Sobic010G233500 Sobic010G119100--Sobic005G148700 Sobic002G345600 Sobic002G345600 Sobic010G119100--Sobic002G345600 Sobic004G017700--Sobic009G039000 Sobic004G017700--Sobic005G148700 Sobic004G017700--Sobic007G109000 Sobic005G147700 Sobic005G147700 Sobic004G017700--Sobic005G147700 Sobic004G017700--Sobic006G276401 Sobic004G017700--Sobic005G074700 Sobic004G017700--Sobic007G047000 Sobic004G017700--Sobic005G221200 Sobic004G017700--Sobic005G082400 Sobic010G069800--Sobic005G152932 Sobic010G069800--Sobic005G074700 Sobic010G069800--Sobic004G017700 Sobic010G069800--Sobic007G109000 Sobic010G069800--Sobic009G039000 Sobic005G146200 Sobic005G146200 Sobic010G069800--Sobic005G146200 Sobic004G198550 Sobic004G198550 Sobic010G069800--Sobic004G198550 Sobic002G010700 Sobic002G010700 Sobic010G069800--Sobic002G010700 Sobic009G051101 Sobic009G051101 Sobic010G069800--Sobic009G051101 Sobic005G221200--Sobic005G141500 Sobic005G221200--Sobic005G174600 Sobic005G109900 Sobic005G109900 Sobic005G221200--Sobic005G109900 Sobic009G039700 Sobic009G039700 Sobic005G221200--Sobic009G039700 Sobic005G221200--Sobic005G148700 Sobic003G135201 Sobic003G135201 Sobic005G221200--Sobic003G135201 Sobic005G221200--Sobic009G006800 Sobic005G221200--Sobic006G276401 Sobic005G109800 Sobic005G109800 Sobic005G221200--Sobic005G109800 Sobic005G074700--Sobic007G109000 Sobic005G074700--Sobic007G047000 Sobic005G074700--Sobic009G039000 Sobic005G074700--Sobic004G017700 Sobic005G074700--Sobic010G119100 Sobic002G250800 Sobic002G250800 Sobic005G074700--Sobic002G250800 Sobic005G074700--Sobic002G345600 Sobic005G074700--Sobic010G069800 Sobic005G074700--Sobic005G152932 Sobic005G174600--Sobic005G141500 Sobic005G174600--Sobic005G221200 Sobic005G174600--Sobic005G109900 Sobic005G174600--Sobic009G006800 Sobic005G174600--Sobic005G109800 Sobic005G174600--Sobic003G135201 Sobic005G174600--Sobic009G039700 Sobic009G039500 Sobic009G039500 Sobic005G174600--Sobic009G039500 Sobic005G174600--Sobic003G415800 Sobic005G148700--Sobic006G276401 Sobic005G148700--Sobic005G221200 Sobic005G148700--Sobic009G039700 Sobic005G148700--Sobic005G141500 Sobic001G323500 Sobic001G323500 Sobic005G148700--Sobic001G323500 Sobic005G148700--Sobic005G174600 Sobic005G148700--Sobic005G109900 Sobic005G148700--Sobic005G147700 Sobic005G148700--Sobic004G017700
Octagon: transcription factors


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