Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G172200.1
Synonym Sb05g023206
Functional annotation OsFBDUF60 - F-box and DUF domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PT33
Pfam PF03478
Panther DB PTHR33110 PTHR33110:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G22060 : F-box family protein with a domain of unknown function (DUF295)
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g38200.1 : OsFBDUF60 - F-box and DUF domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.005G172200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G168400 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed K14494: DELLA protein
2 Sobic.002G381600 uncharacterized glycosyl hydrolase Rv2006/MT2062, putative, expressed K01087: trehalose 6-phosphate phosphatase
3 Sobic.007G187100 terpene synthase, putative, expressed -
4 Sobic.001G129900 indole-3-acetate beta-glucosyltransferase, putative, expressed K13692: UDP-glucose:(indol-3-yl)acetate beta-D-glucosyltransferase
5 Sobic.009G061900 BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1 precursor, putative, expressed -
6 Sobic.005G021100 - -
7 Sobic.004G212350 - -
8 Sobic.005G079300 terpene synthase, putative, expressed -
9 Sobic.010G181900 expressed protein -
10 Sobic.009G052400 inorganic H+ pyrophosphatase, putative, expressed K01507: inorganic pyrophosphatase
11 Sobic.002G100000 OsFBL33 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
12 Sobic.001G392900 - -
13 Sobic.006G080500 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
14 Sobic.003G063900 - -
15 Sobic.005G032500 ASH-like SPRY domain containing protein, putative, expressed K14964: Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2
16 Sobic.007G037200 expressed protein -
17 Sobic.004G133600 Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@"ZmSWEET4c(Ortholog in maize:Sosso et al., 2015(PubMedID : 31659882)@Zhang et al., 2015)"(PubMedID : 27330561)@nodulin MtN3 family protein, putative, expressed K15382: SLC50A, solute carrier family 50 (sugar transporter)
18 Sobic.002G293100 ZOS9-17 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
19 Sobic.002G089500 DEF8 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
20 Sobic.001G200900 LTPL160 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G172200 Sobic005G172200 Sobic008G168400 Sobic008G168400 Sobic005G172200--Sobic008G168400 Sobic002G381600 Sobic002G381600 Sobic005G172200--Sobic002G381600 Sobic007G187100 Sobic007G187100 Sobic005G172200--Sobic007G187100 Sobic001G129900 Sobic001G129900 Sobic005G172200--Sobic001G129900 Sobic009G061900 Sobic009G061900 Sobic005G172200--Sobic009G061900 Sobic005G021100 Sobic005G021100 Sobic005G172200--Sobic005G021100 Sobic004G212350 Sobic004G212350 Sobic005G172200--Sobic004G212350 Sobic005G079300 Sobic005G079300 Sobic005G172200--Sobic005G079300 Sobic010G181900 Sobic010G181900 Sobic005G172200--Sobic010G181900 Sobic008G168400--Sobic001G129900 Sobic008G168400--Sobic002G381600 Sobic008G168400--Sobic005G079300 Sobic006G080500 Sobic006G080500 Sobic008G168400--Sobic006G080500 Sobic009G052400 Sobic009G052400 Sobic008G168400--Sobic009G052400 Sobic003G063900 Sobic003G063900 Sobic008G168400--Sobic003G063900 Sobic008G168400--Sobic005G021100 Sobic008G168400--Sobic007G187100 Sobic001G392900 Sobic001G392900 Sobic008G168400--Sobic001G392900 Sobic002G381600--Sobic001G129900 Sobic002G381600--Sobic008G168400 Sobic002G381600--Sobic009G052400 Sobic002G381600--Sobic006G080500 Sobic002G381600--Sobic005G079300 Sobic004G133600 Sobic004G133600 Sobic002G381600--Sobic004G133600 Sobic002G381600--Sobic005G021100 Sobic002G192600 Sobic002G192600 Sobic002G381600--Sobic002G192600 Sobic005G056300 Sobic005G056300 Sobic002G381600--Sobic005G056300 Sobic007G187100--Sobic009G061900 Sobic007G187100--Sobic005G079300 Sobic007G187100--Sobic001G129900 Sobic007G187100--Sobic002G192600 Sobic002G409300 Sobic002G409300 Sobic007G187100--Sobic002G409300 Sobic007G187100--Sobic004G212350 Sobic007G187100--Sobic004G133600 Sobic007G187100--Sobic008G168400 Sobic005G186300 Sobic005G186300 Sobic007G187100--Sobic005G186300 Sobic001G129900--Sobic006G080500 Sobic001G129900--Sobic009G052400 Sobic001G129900--Sobic002G381600 Sobic001G129900--Sobic008G168400 Sobic001G129900--Sobic005G079300 Sobic001G129900--Sobic002G192600 Sobic001G129900--Sobic004G133600 Sobic001G129900--Sobic005G056300 Sobic001G129900--Sobic007G187100 Sobic009G061900--Sobic007G187100 Sobic009G061900--Sobic005G186300 Sobic001G200900 Sobic001G200900 Sobic009G061900--Sobic001G200900 Sobic009G061900--Sobic002G192600 Sobic009G061900--Sobic002G409300 Sobic009G061900--Sobic009G052400 Sobic009G061900--Sobic001G129900 Sobic009G061900--Sobic004G133600 Sobic005G174000 Sobic005G174000 Sobic009G061900--Sobic005G174000 Sobic002G089500 Sobic002G089500 Sobic005G021100--Sobic002G089500 Sobic005G021100--Sobic001G392900 Sobic004G171600 Sobic004G171600 Sobic005G021100--Sobic004G171600 Sobic005G021100--Sobic002G381600 Sobic005G021100--Sobic008G168400 Sobic002G293100 Sobic002G293100 Sobic005G021100--Sobic002G293100 Sobic005G021100--Sobic009G052400 Sobic005G021100--Sobic001G129900 Sobic005G077900 Sobic005G077900 Sobic005G021100--Sobic005G077900 Sobic004G212350--Sobic007G187100 Sobic004G212350--Sobic009G061900 Sobic002G100000 Sobic002G100000 Sobic004G212350--Sobic002G100000 Sobic004G212350--Sobic008G168400 Sobic004G212350--Sobic005G079300 Sobic004G212350--Sobic001G129900 Sobic004G212350--Sobic002G381600 Sobic004G139700 Sobic004G139700 Sobic004G212350--Sobic004G139700 Sobic004G212350--Sobic002G409300 Sobic005G079300--Sobic001G129900 Sobic005G079300--Sobic006G080500 Sobic005G079300--Sobic008G168400 Sobic005G079300--Sobic005G056300 Sobic005G079300--Sobic009G052400 Sobic005G079300--Sobic002G381600 Sobic005G079300--Sobic007G187100 Sobic005G079300--Sobic004G133600 Sobic005G079300--Sobic002G192600 Sobic010G181900--Sobic008G168400 Sobic010G181900--Sobic002G100000 Sobic005G089101 Sobic005G089101 Sobic010G181900--Sobic005G089101 Sobic003G307600 Sobic003G307600 Sobic010G181900--Sobic003G307600 Sobic010G181900--Sobic003G063900 Sobic010G181900--Sobic005G079300 Sobic010G181900--Sobic007G187100 Sobic010G181900--Sobic004G212350 Sobic010G181900--Sobic002G381600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.