Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G032500.1
Synonym TRO, Sb05g002740
Functional annotation ASH-like SPRY domain containing protein, putative, expressed
UniProt C5Y4J5
Pfam PF00622
Panther DB PTHR10598
NCBI CDD -
KEGG Orthology K14964; Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G51450 : TRAUCO
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g04930.1 : ASH-like SPRY domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a013045
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G037200 expressed protein -
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9 Sobic.004G212350 - -
10 Sobic.002G015400 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
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13 Sobic.003G106400 3-beta-hydroxysteroid-Delta-isomerase, putative, expressed K01824: cholestenol Delta-isomerase
14 Sobic.005G021100 - -
15 Sobic.005G089101 - K08066: NFYC, nuclear transcription factor Y, gamma
16 Sobic.010G181900 expressed protein -
17 Sobic.008G168400 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed K14494: DELLA protein
18 Sobic.001G489075 - -
19 Sobic.007G187100 terpene synthase, putative, expressed -
20 Sobic.003G266100 ESP4, putative, expressed K06100: symplekin


Gene co-expression network
sample Sobic005G032500 Sobic005G032500 Sobic007G037200 Sobic007G037200 Sobic005G032500--Sobic007G037200 Sobic002G100000 Sobic002G100000 Sobic005G032500--Sobic002G100000 Sobic008G031400 Sobic008G031400 Sobic005G032500--Sobic008G031400 Sobic002G058900 Sobic002G058900 Sobic005G032500--Sobic002G058900 Sobic008G159300 Sobic008G159300 Sobic005G032500--Sobic008G159300 Sobic002G217000 Sobic002G217000 Sobic005G032500--Sobic002G217000 Sobic004G220900 Sobic004G220900 Sobic005G032500--Sobic004G220900 Sobic002G101200 Sobic002G101200 Sobic005G032500--Sobic002G101200 Sobic004G212350 Sobic004G212350 Sobic005G032500--Sobic004G212350 Sobic007G037200--Sobic005G032500 Sobic007G037200--Sobic004G220900 Sobic007G037200--Sobic002G058900 Sobic007G037200--Sobic008G159300 Sobic007G037200--Sobic002G100000 Sobic007G037200--Sobic002G217000 Sobic007G037200--Sobic008G031400 Sobic003G106400 Sobic003G106400 Sobic007G037200--Sobic003G106400 Sobic007G037200--Sobic004G212350 Sobic005G089101 Sobic005G089101 Sobic002G100000--Sobic005G089101 Sobic002G100000--Sobic004G212350 Sobic002G100000--Sobic007G037200 Sobic010G181900 Sobic010G181900 Sobic002G100000--Sobic010G181900 Sobic002G100000--Sobic005G032500 Sobic002G100000--Sobic002G217000 Sobic008G168400 Sobic008G168400 Sobic002G100000--Sobic008G168400 Sobic002G100000--Sobic004G220900 Sobic007G187100 Sobic007G187100 Sobic002G100000--Sobic007G187100 Sobic008G184100 Sobic008G184100 Sobic008G031400--Sobic008G184100 Sobic003G091500 Sobic003G091500 Sobic008G031400--Sobic003G091500 Sobic008G031400--Sobic005G032500 Sobic008G088900 Sobic008G088900 Sobic008G031400--Sobic008G088900 Sobic008G031400--Sobic007G037200 Sobic001G489075 Sobic001G489075 Sobic008G031400--Sobic001G489075 Sobic004G171600 Sobic004G171600 Sobic008G031400--Sobic004G171600 Sobic002G108300 Sobic002G108300 Sobic008G031400--Sobic002G108300 Sobic002G293100 Sobic002G293100 Sobic008G031400--Sobic002G293100 Sobic002G058900--Sobic008G159300 Sobic002G058900--Sobic007G037200 Sobic002G058900--Sobic002G217000 Sobic002G058900--Sobic005G032500 Sobic002G015400 Sobic002G015400 Sobic002G058900--Sobic002G015400 Sobic006G004100 Sobic006G004100 Sobic002G058900--Sobic006G004100 Sobic002G058900--Sobic002G101200 Sobic003G266100 Sobic003G266100 Sobic002G058900--Sobic003G266100 Sobic002G059500 Sobic002G059500 Sobic002G058900--Sobic002G059500 Sobic008G159300--Sobic002G015400 Sobic008G159300--Sobic002G058900 Sobic001G511400 Sobic001G511400 Sobic008G159300--Sobic001G511400 Sobic008G159300--Sobic003G266100 Sobic008G159300--Sobic007G037200 Sobic008G159300--Sobic005G032500 Sobic002G172200 Sobic002G172200 Sobic008G159300--Sobic002G172200 Sobic002G172100 Sobic002G172100 Sobic008G159300--Sobic002G172100 Sobic008G159300--Sobic004G220900 Sobic003G225800 Sobic003G225800 Sobic002G217000--Sobic003G225800 Sobic002G217000--Sobic002G101200 Sobic005G197000 Sobic005G197000 Sobic002G217000--Sobic005G197000 Sobic002G217000--Sobic002G058900 Sobic002G217000--Sobic007G037200 Sobic002G217000--Sobic005G089101 Sobic002G217000--Sobic005G032500 Sobic002G217000--Sobic002G100000 Sobic002G217000--Sobic006G004100 Sobic004G220900--Sobic003G106400 Sobic004G220900--Sobic003G266100 Sobic004G220900--Sobic006G004100 Sobic009G021400 Sobic009G021400 Sobic004G220900--Sobic009G021400 Sobic004G220900--Sobic007G037200 Sobic004G220900--Sobic002G172100 Sobic003G294800 Sobic003G294800 Sobic004G220900--Sobic003G294800 Sobic004G220900--Sobic008G159300 Sobic004G220900--Sobic005G032500 Sobic002G101200--Sobic002G217000 Sobic002G101200--Sobic005G032500 Sobic002G101200--Sobic002G058900 Sobic002G101200--Sobic007G037200 Sobic002G166800 Sobic002G166800 Sobic002G101200--Sobic002G166800 Sobic002G101200--Sobic002G100000 Sobic002G101200--Sobic003G225800 Sobic006G031000 Sobic006G031000 Sobic002G101200--Sobic006G031000 Sobic009G051201 Sobic009G051201 Sobic002G101200--Sobic009G051201 Sobic004G212350--Sobic007G187100 Sobic009G061900 Sobic009G061900 Sobic004G212350--Sobic009G061900 Sobic004G212350--Sobic002G100000 Sobic004G212350--Sobic008G168400 Sobic005G079300 Sobic005G079300 Sobic004G212350--Sobic005G079300 Sobic001G129900 Sobic001G129900 Sobic004G212350--Sobic001G129900 Sobic002G381600 Sobic002G381600 Sobic004G212350--Sobic002G381600 Sobic004G139700 Sobic004G139700 Sobic004G212350--Sobic004G139700 Sobic002G409300 Sobic002G409300 Sobic004G212350--Sobic002G409300
Octagon: transcription factors


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