Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G196000.2
Synonym ATPMT5, PMT5, ATPLT5, Sb05g025280
Functional annotation transporter family protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RKA2
Pfam PF07690
Panther DB PTHR23500 PTHR23500:SF17
NCBI CDD KOG0254; Predicted transporter (major facilitator superfamily)
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016021; integral component of membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G18830 : polyol/monosaccharide transporter 5
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g41850.1 : transporter family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029256 , Zm00025a029259 , Zm00025a029260 , Zm00025a029265 , Zm00025a029266
Brachypodium KQJ87608
Barley HORVU7Hr1G098820.3 , HORVU7Hr1G098820.1
Wheat TraesCS7D02G422500 , TraesCS4D02G262900 , TraesCS4B02G062900 , TraesCS4A02G251900 , TraesCS4D02G061900 , TraesCS7B02G330800
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G184400 SMP-30/Gluconolaconase/LRE-like region containing protein, expressed -
2 Sobic.001G166100 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
3 Sobic.003G407950 - -
4 Sobic.002G251050 - -
5 Sobic.009G187150 - -
6 Sobic.004G138600 - -
7 Sobic.001G499800 expansin precursor, putative, expressed -
8 Sobic.001G495550 - -
9 Sobic.009G121150 - -
10 Sobic.010G111450 - -
11 Sobic.001G405200 transcription factor like protein, putative, expressed -
12 Sobic.002G040201 - -
13 Sobic.006G076100 - -
14 Sobic.009G034250 - -
15 Sobic.006G029250 - -
16 Sobic.003G013950 - -
17 Sobic.003G344950 - -
18 Sobic.005G060832 - -
19 Sobic.001G405450 - -
20 Sobic.010G185350 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G196000 Sobic005G196000 Sobic010G184400 Sobic010G184400 Sobic005G196000--Sobic010G184400 Sobic001G166100 Sobic001G166100 Sobic005G196000--Sobic001G166100 Sobic003G407950 Sobic003G407950 Sobic005G196000--Sobic003G407950 Sobic002G251050 Sobic002G251050 Sobic005G196000--Sobic002G251050 Sobic009G187150 Sobic009G187150 Sobic005G196000--Sobic009G187150 Sobic004G138600 Sobic004G138600 Sobic005G196000--Sobic004G138600 Sobic001G499800 Sobic001G499800 Sobic005G196000--Sobic001G499800 Sobic001G495550 Sobic001G495550 Sobic005G196000--Sobic001G495550 Sobic009G121150 Sobic009G121150 Sobic005G196000--Sobic009G121150 Sobic010G184400--Sobic005G196000 Sobic003G333300 Sobic003G333300 Sobic010G184400--Sobic003G333300 Sobic010G184400--Sobic001G495550 Sobic003G344950 Sobic003G344950 Sobic010G184400--Sobic003G344950 Sobic010G184400--Sobic001G499800 Sobic002G028901 Sobic002G028901 Sobic010G184400--Sobic002G028901 Sobic010G184400--Sobic002G251050 Sobic005G035400 Sobic005G035400 Sobic010G184400--Sobic005G035400 Sobic005G230800 Sobic005G230800 Sobic010G184400--Sobic005G230800 Sobic001G405200 Sobic001G405200 Sobic001G166100--Sobic001G405200 Sobic001G166100--Sobic002G251050 Sobic001G166100--Sobic003G407950 Sobic010G111450 Sobic010G111450 Sobic001G166100--Sobic010G111450 Sobic002G040201 Sobic002G040201 Sobic001G166100--Sobic002G040201 Sobic001G166100--Sobic009G121150 Sobic006G029250 Sobic006G029250 Sobic001G166100--Sobic006G029250 Sobic009G034250 Sobic009G034250 Sobic001G166100--Sobic009G034250 Sobic006G076100 Sobic006G076100 Sobic001G166100--Sobic006G076100 Sobic003G407950--Sobic006G029250 Sobic003G407950--Sobic009G034250 Sobic003G407950--Sobic002G251050 Sobic003G407950--Sobic001G405200 Sobic003G407950--Sobic009G187150 Sobic004G198350 Sobic004G198350 Sobic003G407950--Sobic004G198350 Sobic001G405450 Sobic001G405450 Sobic003G407950--Sobic001G405450 Sobic009G013850 Sobic009G013850 Sobic003G407950--Sobic009G013850 Sobic004G195650 Sobic004G195650 Sobic003G407950--Sobic004G195650 Sobic002G251050--Sobic003G407950 Sobic002G251050--Sobic006G029250 Sobic002G251050--Sobic009G034250 Sobic002G251050--Sobic010G111450 Sobic002G251050--Sobic001G405200 Sobic002G251050--Sobic009G187150 Sobic002G251050--Sobic006G076100 Sobic002G251050--Sobic004G138600 Sobic002G251050--Sobic004G195650 Sobic009G187150--Sobic003G407950 Sobic009G187150--Sobic006G029250 Sobic009G187150--Sobic002G251050 Sobic009G187150--Sobic009G034250 Sobic009G187150--Sobic001G405450 Sobic009G187150--Sobic010G111450 Sobic009G187150--Sobic001G405200 Sobic001G300450 Sobic001G300450 Sobic009G187150--Sobic001G300450 Sobic009G187150--Sobic006G076100 Sobic004G138600--Sobic010G111450 Sobic004G138600--Sobic002G251050 Sobic004G138600--Sobic006G076100 Sobic004G138600--Sobic002G040201 Sobic003G013950 Sobic003G013950 Sobic004G138600--Sobic003G013950 Sobic004G138600--Sobic003G407950 Sobic004G138600--Sobic009G187150 Sobic004G138600--Sobic006G029250 Sobic004G138600--Sobic009G034250 Sobic001G499800--Sobic001G495550 Sobic008G112550 Sobic008G112550 Sobic001G499800--Sobic008G112550 Sobic001G499800--Sobic003G344950 Sobic001G366600 Sobic001G366600 Sobic001G499800--Sobic001G366600 Sobic001G170301 Sobic001G170301 Sobic001G499800--Sobic001G170301 Sobic001G519100 Sobic001G519100 Sobic001G499800--Sobic001G519100 Sobic001G499800--Sobic001G166100 Sobic001G499800--Sobic010G184400 Sobic001G499800--Sobic009G121150 Sobic001G495550--Sobic002G028901 Sobic001G495550--Sobic003G333300 Sobic001G495550--Sobic001G499800 Sobic009G064700 Sobic009G064700 Sobic001G495550--Sobic009G064700 Sobic001G495550--Sobic010G184400 Sobic001G495550--Sobic003G344950 Sobic001G495550--Sobic005G035400 Sobic001G495550--Sobic008G112550 Sobic003G098650 Sobic003G098650 Sobic001G495550--Sobic003G098650 Sobic009G121150--Sobic006G029250 Sobic009G121150--Sobic001G405200 Sobic009G121150--Sobic009G034250 Sobic009G121150--Sobic003G407950 Sobic009G121150--Sobic004G198350 Sobic009G121150--Sobic001G166100 Sobic009G121150--Sobic002G251050 Sobic009G121150--Sobic009G013850 Sobic007G082700 Sobic007G082700 Sobic009G121150--Sobic007G082700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.