Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G060832.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RI26
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G082700 expressed protein -
2 Sobic.009G034250 - -
3 Sobic.006G011700 dirigent, putative -
4 Sobic.006G029250 - -
5 Sobic.004G311550 - -
6 Sobic.004G056350 - -
7 Sobic.006G257250 - -
8 Sobic.009G013850 - -
9 Sobic.003G042000 - -
10 Sobic.002G157950 - -
11 Sobic.004G198350 - -
12 Sobic.004G127500 - -
13 Sobic.009G024166 - -
14 Sobic.004G195650 - -
15 Sobic.008G028850 - -
16 Sobic.006G113700 heavy metal associated domain containing protein, expressed -
17 Sobic.005G191400 MBTB63 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
18 Sobic.003G407950 - -
19 Sobic.010G180750 - -
20 Sobic.005G190400 MBTB2 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein


Gene co-expression network
sample Sobic005G060832 Sobic005G060832 Sobic007G082700 Sobic007G082700 Sobic005G060832--Sobic007G082700 Sobic009G034250 Sobic009G034250 Sobic005G060832--Sobic009G034250 Sobic006G011700 Sobic006G011700 Sobic005G060832--Sobic006G011700 Sobic006G029250 Sobic006G029250 Sobic005G060832--Sobic006G029250 Sobic004G311550 Sobic004G311550 Sobic005G060832--Sobic004G311550 Sobic004G056350 Sobic004G056350 Sobic005G060832--Sobic004G056350 Sobic006G257250 Sobic006G257250 Sobic005G060832--Sobic006G257250 Sobic009G013850 Sobic009G013850 Sobic005G060832--Sobic009G013850 Sobic003G042000 Sobic003G042000 Sobic005G060832--Sobic003G042000 Sobic007G082700--Sobic004G311550 Sobic007G082700--Sobic004G056350 Sobic007G082700--Sobic006G257250 Sobic007G082700--Sobic009G013850 Sobic007G082700--Sobic003G042000 Sobic002G157950 Sobic002G157950 Sobic007G082700--Sobic002G157950 Sobic007G082700--Sobic006G029250 Sobic009G024166 Sobic009G024166 Sobic007G082700--Sobic009G024166 Sobic007G082700--Sobic009G034250 Sobic009G034250--Sobic006G029250 Sobic009G034250--Sobic009G013850 Sobic009G034250--Sobic007G082700 Sobic004G195650 Sobic004G195650 Sobic009G034250--Sobic004G195650 Sobic003G407950 Sobic003G407950 Sobic009G034250--Sobic003G407950 Sobic009G034250--Sobic003G042000 Sobic009G034250--Sobic004G311550 Sobic009G034250--Sobic004G056350 Sobic009G034250--Sobic006G257250 Sobic008G028850 Sobic008G028850 Sobic006G011700--Sobic008G028850 Sobic006G011700--Sobic006G257250 Sobic006G011700--Sobic004G056350 Sobic006G011700--Sobic004G311550 Sobic006G011700--Sobic009G024166 Sobic006G011700--Sobic003G042000 Sobic003G090100 Sobic003G090100 Sobic006G011700--Sobic003G090100 Sobic004G127500 Sobic004G127500 Sobic006G011700--Sobic004G127500 Sobic006G113700 Sobic006G113700 Sobic006G011700--Sobic006G113700 Sobic006G029250--Sobic009G034250 Sobic006G029250--Sobic009G013850 Sobic006G029250--Sobic007G082700 Sobic006G029250--Sobic004G195650 Sobic006G029250--Sobic003G042000 Sobic006G029250--Sobic003G407950 Sobic006G029250--Sobic004G311550 Sobic006G029250--Sobic004G056350 Sobic006G029250--Sobic006G257250 Sobic004G311550--Sobic004G056350 Sobic004G311550--Sobic006G257250 Sobic004G311550--Sobic009G024166 Sobic004G311550--Sobic003G042000 Sobic004G311550--Sobic008G028850 Sobic004G311550--Sobic007G082700 Sobic004G311550--Sobic006G113700 Sobic004G311550--Sobic009G013850 Sobic004G311550--Sobic006G011700 Sobic004G056350--Sobic006G257250 Sobic004G056350--Sobic004G311550 Sobic004G056350--Sobic009G024166 Sobic004G056350--Sobic003G042000 Sobic004G056350--Sobic008G028850 Sobic004G056350--Sobic007G082700 Sobic004G056350--Sobic006G113700 Sobic004G056350--Sobic009G013850 Sobic004G056350--Sobic006G011700 Sobic006G257250--Sobic004G056350 Sobic006G257250--Sobic004G311550 Sobic006G257250--Sobic009G024166 Sobic006G257250--Sobic003G042000 Sobic006G257250--Sobic008G028850 Sobic006G257250--Sobic007G082700 Sobic006G257250--Sobic006G113700 Sobic006G257250--Sobic009G013850 Sobic006G257250--Sobic006G011700 Sobic009G013850--Sobic004G311550 Sobic009G013850--Sobic004G056350 Sobic009G013850--Sobic006G257250 Sobic009G013850--Sobic007G082700 Sobic009G013850--Sobic003G042000 Sobic009G013850--Sobic006G029250 Sobic009G013850--Sobic009G024166 Sobic009G013850--Sobic009G034250 Sobic009G013850--Sobic004G195650 Sobic003G042000--Sobic004G311550 Sobic003G042000--Sobic004G056350 Sobic003G042000--Sobic006G257250 Sobic003G042000--Sobic009G024166 Sobic003G042000--Sobic007G082700 Sobic003G042000--Sobic009G013850 Sobic003G042000--Sobic008G028850 Sobic003G042000--Sobic006G113700 Sobic003G042000--Sobic006G011700
Octagon: transcription factors


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