Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G180750.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A194YK28
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G224350 - -
2 Sobic.001G167701 - -
3 Sobic.003G268650 - -
4 Sobic.002G032033 - -
5 Sobic.003G373200 strictosidine synthase, putative, expressed -
6 Sobic.005G216866 - -
7 Sobic.001G183900 expressed protein -
8 Sobic.002G397001 - -
9 Sobic.004G179100 protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1, putative, expressed K10956: protein transport protein SEC61 subunit alpha
10 Sobic.005G167600 resistance protein, putative, expressed -
11 Sobic.003G090100 seven in absentia protein family domain containing protein, expressed -
12 Sobic.009G072066 - -
13 Sobic.004G075301 - -
14 Sobic.005G207900 zinc knuckle family protein, expressed -
15 Sobic.004G127500 - -
16 Sobic.005G041800 expressed protein -
17 Sobic.002G157950 - -
18 Sobic.004G246950 - -
19 Sobic.007G104201 - -
20 Sobic.003G072100 D-mannose binding lectin family protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G180750 Sobic010G180750 Sobic004G224350 Sobic004G224350 Sobic010G180750--Sobic004G224350 Sobic001G167701 Sobic001G167701 Sobic010G180750--Sobic001G167701 Sobic003G268650 Sobic003G268650 Sobic010G180750--Sobic003G268650 Sobic002G032033 Sobic002G032033 Sobic010G180750--Sobic002G032033 Sobic003G373200 Sobic003G373200 Sobic010G180750--Sobic003G373200 Sobic005G216866 Sobic005G216866 Sobic010G180750--Sobic005G216866 Sobic001G183900 Sobic001G183900 Sobic010G180750--Sobic001G183900 Sobic002G397001 Sobic002G397001 Sobic010G180750--Sobic002G397001 Sobic004G179100 Sobic004G179100 Sobic010G180750--Sobic004G179100 Sobic004G224350--Sobic001G183900 Sobic004G224350--Sobic002G032033 Sobic003G090100 Sobic003G090100 Sobic004G224350--Sobic003G090100 Sobic005G207900 Sobic005G207900 Sobic004G224350--Sobic005G207900 Sobic004G224350--Sobic005G216866 Sobic004G246950 Sobic004G246950 Sobic004G224350--Sobic004G246950 Sobic003G072100 Sobic003G072100 Sobic004G224350--Sobic003G072100 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic004G224350--Sobic001G018700 Sobic007G104201 Sobic007G104201 Sobic001G167701--Sobic007G104201 Sobic001G167701--Sobic001G183900 Sobic001G167701--Sobic002G032033 Sobic001G167701--Sobic005G216866 Sobic001G167701--Sobic004G246950 Sobic001G167701--Sobic004G224350 Sobic001G167701--Sobic003G072100 Sobic001G167701--Sobic002G397001 Sobic007G146800 Sobic007G146800 Sobic001G167701--Sobic007G146800 Sobic003G268650--Sobic001G183900 Sobic003G268650--Sobic002G032033 Sobic003G094850 Sobic003G094850 Sobic003G268650--Sobic003G094850 Sobic005G102750 Sobic005G102750 Sobic003G268650--Sobic005G102750 Sobic005G190400 Sobic005G190400 Sobic003G268650--Sobic005G190400 Sobic003G268650--Sobic005G216866 Sobic009G219601 Sobic009G219601 Sobic003G268650--Sobic009G219601 Sobic003G268650--Sobic004G246950 Sobic003G268650--Sobic003G072100 Sobic002G032033--Sobic001G183900 Sobic002G032033--Sobic005G216866 Sobic002G032033--Sobic004G224350 Sobic002G032033--Sobic004G246950 Sobic005G167600 Sobic005G167600 Sobic002G032033--Sobic005G167600 Sobic002G032033--Sobic003G268650 Sobic002G032033--Sobic003G072100 Sobic002G032033--Sobic001G167701 Sobic002G430601 Sobic002G430601 Sobic002G032033--Sobic002G430601 Sobic005G041800 Sobic005G041800 Sobic003G373200--Sobic005G041800 Sobic003G373200--Sobic002G032033 Sobic003G373200--Sobic003G268650 Sobic003G373200--Sobic005G216866 Sobic007G011500 Sobic007G011500 Sobic003G373200--Sobic007G011500 Sobic003G373200--Sobic004G224350 Sobic003G373200--Sobic001G183900 Sobic003G373200--Sobic001G167701 Sobic003G373200--Sobic005G167600 Sobic005G216866--Sobic001G183900 Sobic005G216866--Sobic002G032033 Sobic005G216866--Sobic004G246950 Sobic001G338200 Sobic001G338200 Sobic005G216866--Sobic001G338200 Sobic005G216866--Sobic004G224350 Sobic010G090550 Sobic010G090550 Sobic005G216866--Sobic010G090550 Sobic005G216866--Sobic003G072100 Sobic005G216866--Sobic005G167600 Sobic005G216866--Sobic001G018700 Sobic001G183900--Sobic003G072100 Sobic001G183900--Sobic004G246950 Sobic001G183900--Sobic002G032033 Sobic001G183900--Sobic001G018700 Sobic002G397001--Sobic007G146800 Sobic009G072066 Sobic009G072066 Sobic002G397001--Sobic009G072066 Sobic008G082450 Sobic008G082450 Sobic002G397001--Sobic008G082450 Sobic010G140300 Sobic010G140300 Sobic002G397001--Sobic010G140300 Sobic002G397001--Sobic010G090550 Sobic006G089200 Sobic006G089200 Sobic002G397001--Sobic006G089200 Sobic002G397001--Sobic001G018700 Sobic004G075301 Sobic004G075301 Sobic004G179100--Sobic004G075301 Sobic004G179100--Sobic009G072066 Sobic004G179100--Sobic002G397001 Sobic001G273600 Sobic001G273600 Sobic004G179100--Sobic001G273600 Sobic009G248700 Sobic009G248700 Sobic004G179100--Sobic009G248700 Sobic004G179100--Sobic007G146800 Sobic003G434500 Sobic003G434500 Sobic004G179100--Sobic003G434500 Sobic004G179100--Sobic006G089200 Sobic004G179100--Sobic001G018700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.