Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G104201.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R9N7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G167701 - -
2 Sobic.002G034900 metallothionein family protein, expressed -
3 Sobic.001G110150 - -
4 Sobic.001G183900 expressed protein -
5 Sobic.002G032033 - -
6 Sobic.009G196500 expressed protein -
7 Sobic.003G095750 - -
8 Sobic.005G216866 - -
9 Sobic.003G075632 - -
10 Sobic.004G246950 - -
11 Sobic.003G072100 D-mannose binding lectin family protein, expressed -
12 Sobic.004G224350 - -
13 Sobic.009G037400 cytokinin inducible protein, putative, expressed -
14 Sobic.007G146800 late embryogenesis abundant protein, putative, expressed -
15 Sobic.002G397001 - -
16 Sobic.002G400050 - -
17 Sobic.001G018700 RD26, putative, expressed -
18 Sobic.001G018700 RD26, putative, expressed -
19 Sobic.001G018700 RD26, putative, expressed -
20 Sobic.001G018700 RD26, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G104201 Sobic007G104201 Sobic001G167701 Sobic001G167701 Sobic007G104201--Sobic001G167701 Sobic002G034900 Sobic002G034900 Sobic007G104201--Sobic002G034900 Sobic001G110150 Sobic001G110150 Sobic007G104201--Sobic001G110150 Sobic001G183900 Sobic001G183900 Sobic007G104201--Sobic001G183900 Sobic002G032033 Sobic002G032033 Sobic007G104201--Sobic002G032033 Sobic009G196500 Sobic009G196500 Sobic007G104201--Sobic009G196500 Sobic003G095750 Sobic003G095750 Sobic007G104201--Sobic003G095750 Sobic005G216866 Sobic005G216866 Sobic007G104201--Sobic005G216866 Sobic003G075632 Sobic003G075632 Sobic007G104201--Sobic003G075632 Sobic001G167701--Sobic007G104201 Sobic001G167701--Sobic001G183900 Sobic001G167701--Sobic002G032033 Sobic001G167701--Sobic005G216866 Sobic004G246950 Sobic004G246950 Sobic001G167701--Sobic004G246950 Sobic004G224350 Sobic004G224350 Sobic001G167701--Sobic004G224350 Sobic003G072100 Sobic003G072100 Sobic001G167701--Sobic003G072100 Sobic002G397001 Sobic002G397001 Sobic001G167701--Sobic002G397001 Sobic007G146800 Sobic007G146800 Sobic001G167701--Sobic007G146800 Sobic002G034900--Sobic009G196500 Sobic002G034900--Sobic003G075632 Sobic009G037400 Sobic009G037400 Sobic002G034900--Sobic009G037400 Sobic002G034900--Sobic003G095750 Sobic002G400050 Sobic002G400050 Sobic002G034900--Sobic002G400050 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic002G034900--Sobic001G018700 Sobic001G110150--Sobic009G196500 Sobic001G110150--Sobic001G183900 Sobic001G110150--Sobic003G072100 Sobic005G193900 Sobic005G193900 Sobic001G110150--Sobic005G193900 Sobic001G110150--Sobic002G034900 Sobic001G273600 Sobic001G273600 Sobic001G110150--Sobic001G273600 Sobic007G023650 Sobic007G023650 Sobic001G110150--Sobic007G023650 Sobic006G089200 Sobic006G089200 Sobic001G110150--Sobic006G089200 Sobic001G110150--Sobic004G246950 Sobic001G183900--Sobic003G072100 Sobic001G183900--Sobic004G246950 Sobic001G183900--Sobic002G032033 Sobic001G183900--Sobic001G018700 Sobic002G032033--Sobic001G183900 Sobic002G032033--Sobic005G216866 Sobic002G032033--Sobic004G224350 Sobic002G032033--Sobic004G246950 Sobic005G167600 Sobic005G167600 Sobic002G032033--Sobic005G167600 Sobic003G268650 Sobic003G268650 Sobic002G032033--Sobic003G268650 Sobic002G032033--Sobic003G072100 Sobic002G032033--Sobic001G167701 Sobic002G430601 Sobic002G430601 Sobic002G032033--Sobic002G430601 Sobic009G196500--Sobic002G034900 Sobic009G196500--Sobic005G193900 Sobic009G196500--Sobic001G018700 Sobic003G095750--Sobic002G034900 Sobic003G095750--Sobic002G400050 Sobic003G095750--Sobic003G075632 Sobic003G095750--Sobic009G196500 Sobic003G095750--Sobic009G037400 Sobic010G092550 Sobic010G092550 Sobic003G095750--Sobic010G092550 Sobic003G095750--Sobic007G104201 Sobic003G095301 Sobic003G095301 Sobic003G095750--Sobic003G095301 Sobic003G095750--Sobic001G110150 Sobic005G216866--Sobic001G183900 Sobic005G216866--Sobic002G032033 Sobic005G216866--Sobic004G246950 Sobic001G338200 Sobic001G338200 Sobic005G216866--Sobic001G338200 Sobic005G216866--Sobic004G224350 Sobic010G090550 Sobic010G090550 Sobic005G216866--Sobic010G090550 Sobic005G216866--Sobic003G072100 Sobic005G216866--Sobic005G167600 Sobic005G216866--Sobic001G018700 Sobic003G075632--Sobic002G034900 Sobic003G075632--Sobic009G196500 Sobic003G075632--Sobic009G037400 Sobic003G075632--Sobic003G095750 Sobic001G030800 Sobic001G030800 Sobic003G075632--Sobic001G030800 Sobic003G075632--Sobic001G018700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.