Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G041800.1
Synonym Sb05g003470
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y518
Pfam -
Panther DB PTHR33177 PTHR33177:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G11600 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g06130.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a033530 , Zm00025a053938
Brachypodium KQJ92179
Barley HORVU5Hr1G040360.2 , HORVU5Hr1G040360.3 , HORVU5Hr1G040360.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G373200 strictosidine synthase, putative, expressed -
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20 Sobic.003G072100 D-mannose binding lectin family protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G041800 Sobic005G041800 Sobic003G373200 Sobic003G373200 Sobic005G041800--Sobic003G373200 Sobic007G011500 Sobic007G011500 Sobic005G041800--Sobic007G011500 Sobic002G032033 Sobic002G032033 Sobic005G041800--Sobic002G032033 Sobic005G216866 Sobic005G216866 Sobic005G041800--Sobic005G216866 Sobic006G129200 Sobic006G129200 Sobic005G041800--Sobic006G129200 Sobic004G224350 Sobic004G224350 Sobic005G041800--Sobic004G224350 Sobic002G393266 Sobic002G393266 Sobic005G041800--Sobic002G393266 Sobic003G268650 Sobic003G268650 Sobic005G041800--Sobic003G268650 Sobic001G183900 Sobic001G183900 Sobic005G041800--Sobic001G183900 Sobic003G373200--Sobic005G041800 Sobic003G373200--Sobic002G032033 Sobic003G373200--Sobic003G268650 Sobic003G373200--Sobic005G216866 Sobic003G373200--Sobic007G011500 Sobic003G373200--Sobic004G224350 Sobic003G373200--Sobic001G183900 Sobic001G167701 Sobic001G167701 Sobic003G373200--Sobic001G167701 Sobic005G167600 Sobic005G167600 Sobic003G373200--Sobic005G167600 Sobic007G011500--Sobic005G041800 Sobic007G011500--Sobic006G129200 Sobic002G152300 Sobic002G152300 Sobic007G011500--Sobic002G152300 Sobic003G254500 Sobic003G254500 Sobic007G011500--Sobic003G254500 Sobic007G024600 Sobic007G024600 Sobic007G011500--Sobic007G024600 Sobic007G011500--Sobic003G373200 Sobic002G367500 Sobic002G367500 Sobic007G011500--Sobic002G367500 Sobic007G011500--Sobic002G032033 Sobic007G011500--Sobic002G393266 Sobic002G032033--Sobic001G183900 Sobic002G032033--Sobic005G216866 Sobic002G032033--Sobic004G224350 Sobic004G246950 Sobic004G246950 Sobic002G032033--Sobic004G246950 Sobic002G032033--Sobic005G167600 Sobic002G032033--Sobic003G268650 Sobic003G072100 Sobic003G072100 Sobic002G032033--Sobic003G072100 Sobic002G032033--Sobic001G167701 Sobic002G430601 Sobic002G430601 Sobic002G032033--Sobic002G430601 Sobic005G216866--Sobic001G183900 Sobic005G216866--Sobic002G032033 Sobic005G216866--Sobic004G246950 Sobic001G338200 Sobic001G338200 Sobic005G216866--Sobic001G338200 Sobic005G216866--Sobic004G224350 Sobic010G090550 Sobic010G090550 Sobic005G216866--Sobic010G090550 Sobic005G216866--Sobic003G072100 Sobic005G216866--Sobic005G167600 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic005G216866--Sobic001G018700 Sobic006G129200--Sobic007G011500 Sobic006G129200--Sobic005G041800 Sobic006G129200--Sobic002G152300 Sobic006G129200--Sobic003G254500 Sobic006G129200--Sobic007G024600 Sobic006G129200--Sobic003G373200 Sobic006G129200--Sobic002G367500 Sobic006G129200--Sobic002G032033 Sobic006G129200--Sobic002G393266 Sobic004G224350--Sobic001G183900 Sobic004G224350--Sobic002G032033 Sobic003G090100 Sobic003G090100 Sobic004G224350--Sobic003G090100 Sobic005G207900 Sobic005G207900 Sobic004G224350--Sobic005G207900 Sobic004G224350--Sobic005G216866 Sobic004G224350--Sobic004G246950 Sobic004G224350--Sobic003G072100 Sobic004G224350--Sobic001G018700 Sobic002G393266--Sobic005G041800 Sobic002G393266--Sobic002G032033 Sobic002G393266--Sobic001G167701 Sobic002G393266--Sobic003G373200 Sobic002G393266--Sobic005G216866 Sobic002G393266--Sobic004G224350 Sobic002G393266--Sobic001G183900 Sobic010G180750 Sobic010G180750 Sobic002G393266--Sobic010G180750 Sobic007G104201 Sobic007G104201 Sobic002G393266--Sobic007G104201 Sobic003G268650--Sobic001G183900 Sobic003G268650--Sobic002G032033 Sobic003G094850 Sobic003G094850 Sobic003G268650--Sobic003G094850 Sobic005G102750 Sobic005G102750 Sobic003G268650--Sobic005G102750 Sobic005G190400 Sobic005G190400 Sobic003G268650--Sobic005G190400 Sobic003G268650--Sobic005G216866 Sobic009G219601 Sobic009G219601 Sobic003G268650--Sobic009G219601 Sobic003G268650--Sobic004G246950 Sobic003G268650--Sobic003G072100 Sobic001G183900--Sobic003G072100 Sobic001G183900--Sobic004G246950 Sobic001G183900--Sobic002G032033 Sobic001G183900--Sobic001G018700
Octagon: transcription factors


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