Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G129200.2
Synonym
Functional annotation zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5REG5
Pfam PF13639
Panther DB PTHR14155 PTHR14155:SF120
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0005515protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G44578 : RING/U-box superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g41070.1 : zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a010913 , Zm00025a010918 , Zm00025a010931 , Zm00025a010934 , Zm00025a010937 , Zm00025a010928 , Zm00025a056359
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G011500 OsFBX64 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.005G041800 expressed protein -
3 Sobic.002G152300 expressed protein -
4 Sobic.003G254500 expressed protein -
5 Sobic.007G024600 - -
6 Sobic.003G373200 strictosidine synthase, putative, expressed -
7 Sobic.002G367500 expressed protein -
8 Sobic.002G032033 - -
9 Sobic.002G393266 - -
10 Sobic.005G149100 - -
11 Sobic.007G049500 expressed protein -
12 Sobic.005G216866 - -
13 Sobic.004G224350 - -
14 Sobic.003G268650 - -
15 Sobic.001G167701 - -
16 Sobic.005G167600 resistance protein, putative, expressed -
17 Sobic.001G183900 expressed protein -
18 Sobic.005G059900 NAM, putative, expressed -
19 Sobic.007G104201 - -
20 Sobic.010G180750 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G129200 Sobic006G129200 Sobic007G011500 Sobic007G011500 Sobic006G129200--Sobic007G011500 Sobic005G041800 Sobic005G041800 Sobic006G129200--Sobic005G041800 Sobic002G152300 Sobic002G152300 Sobic006G129200--Sobic002G152300 Sobic003G254500 Sobic003G254500 Sobic006G129200--Sobic003G254500 Sobic007G024600 Sobic007G024600 Sobic006G129200--Sobic007G024600 Sobic003G373200 Sobic003G373200 Sobic006G129200--Sobic003G373200 Sobic002G367500 Sobic002G367500 Sobic006G129200--Sobic002G367500 Sobic002G032033 Sobic002G032033 Sobic006G129200--Sobic002G032033 Sobic002G393266 Sobic002G393266 Sobic006G129200--Sobic002G393266 Sobic007G011500--Sobic005G041800 Sobic007G011500--Sobic006G129200 Sobic007G011500--Sobic002G152300 Sobic007G011500--Sobic003G254500 Sobic007G011500--Sobic007G024600 Sobic007G011500--Sobic003G373200 Sobic007G011500--Sobic002G367500 Sobic007G011500--Sobic002G032033 Sobic007G011500--Sobic002G393266 Sobic005G041800--Sobic003G373200 Sobic005G041800--Sobic007G011500 Sobic005G041800--Sobic002G032033 Sobic005G216866 Sobic005G216866 Sobic005G041800--Sobic005G216866 Sobic005G041800--Sobic006G129200 Sobic004G224350 Sobic004G224350 Sobic005G041800--Sobic004G224350 Sobic005G041800--Sobic002G393266 Sobic003G268650 Sobic003G268650 Sobic005G041800--Sobic003G268650 Sobic001G183900 Sobic001G183900 Sobic005G041800--Sobic001G183900 Sobic002G152300--Sobic007G011500 Sobic002G152300--Sobic007G024600 Sobic002G152300--Sobic006G129200 Sobic002G152300--Sobic005G041800 Sobic002G152300--Sobic003G254500 Sobic005G149100 Sobic005G149100 Sobic002G152300--Sobic005G149100 Sobic002G152300--Sobic003G373200 Sobic002G152300--Sobic002G367500 Sobic007G049500 Sobic007G049500 Sobic002G152300--Sobic007G049500 Sobic003G254500--Sobic007G011500 Sobic003G254500--Sobic007G024600 Sobic003G254500--Sobic005G041800 Sobic003G254500--Sobic002G152300 Sobic003G254500--Sobic006G129200 Sobic003G254500--Sobic003G373200 Sobic003G254500--Sobic005G149100 Sobic003G254500--Sobic002G367500 Sobic003G254500--Sobic002G032033 Sobic007G024600--Sobic005G149100 Sobic007G024600--Sobic002G152300 Sobic007G024600--Sobic007G011500 Sobic007G024600--Sobic007G049500 Sobic007G024600--Sobic003G254500 Sobic007G024600--Sobic006G129200 Sobic002G039900 Sobic002G039900 Sobic007G024600--Sobic002G039900 Sobic007G024600--Sobic005G041800 Sobic008G013500 Sobic008G013500 Sobic007G024600--Sobic008G013500 Sobic003G373200--Sobic005G041800 Sobic003G373200--Sobic002G032033 Sobic003G373200--Sobic003G268650 Sobic003G373200--Sobic005G216866 Sobic003G373200--Sobic007G011500 Sobic003G373200--Sobic004G224350 Sobic003G373200--Sobic001G183900 Sobic001G167701 Sobic001G167701 Sobic003G373200--Sobic001G167701 Sobic005G167600 Sobic005G167600 Sobic003G373200--Sobic005G167600 Sobic002G367500--Sobic007G011500 Sobic002G367500--Sobic005G041800 Sobic002G367500--Sobic006G129200 Sobic002G367500--Sobic003G373200 Sobic002G367500--Sobic002G152300 Sobic002G367500--Sobic003G254500 Sobic002G367500--Sobic002G032033 Sobic002G367500--Sobic007G024600 Sobic002G367500--Sobic005G216866 Sobic002G032033--Sobic001G183900 Sobic002G032033--Sobic005G216866 Sobic002G032033--Sobic004G224350 Sobic004G246950 Sobic004G246950 Sobic002G032033--Sobic004G246950 Sobic002G032033--Sobic005G167600 Sobic002G032033--Sobic003G268650 Sobic003G072100 Sobic003G072100 Sobic002G032033--Sobic003G072100 Sobic002G032033--Sobic001G167701 Sobic002G430601 Sobic002G430601 Sobic002G032033--Sobic002G430601 Sobic002G393266--Sobic005G041800 Sobic002G393266--Sobic002G032033 Sobic002G393266--Sobic001G167701 Sobic002G393266--Sobic003G373200 Sobic002G393266--Sobic005G216866 Sobic002G393266--Sobic004G224350 Sobic002G393266--Sobic001G183900 Sobic010G180750 Sobic010G180750 Sobic002G393266--Sobic010G180750 Sobic007G104201 Sobic007G104201 Sobic002G393266--Sobic007G104201
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.