Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G024600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt C5YMH7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G149100 - -
2 Sobic.002G152300 expressed protein -
3 Sobic.007G011500 OsFBX64 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.007G049500 expressed protein -
5 Sobic.003G254500 expressed protein -
6 Sobic.006G129200 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
7 Sobic.002G039900 "domain confirmed by Pfam database, expression induced by IAA and BR treatments"(PubMedID : 20499123)@- -
8 Sobic.005G041800 expressed protein -
9 Sobic.008G013500 chalcone synthase, putative, expressed -
10 Sobic.002G367500 expressed protein -
11 Sobic.004G234400 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
12 Sobic.004G146700 peroxidase family protein, expressed K00430: peroxidase
13 Sobic.003G373200 strictosidine synthase, putative, expressed -
14 Sobic.001G472301 - -
15 Sobic.001G480200 THO complex subunit 1, putative, expressed -
16 Sobic.008G159601 - -
17 Sobic.005G059900 NAM, putative, expressed -
18 Sobic.002G393266 - -
19 Sobic.003G006600 aquaporin protein, putative, expressed K09873: aquaporin TIP
20 Sobic.002G067400 ATPase, putative, expressed K08900: mitochondrial chaperone BCS1


Gene co-expression network
sample Sobic007G024600 Sobic007G024600 Sobic005G149100 Sobic005G149100 Sobic007G024600--Sobic005G149100 Sobic002G152300 Sobic002G152300 Sobic007G024600--Sobic002G152300 Sobic007G011500 Sobic007G011500 Sobic007G024600--Sobic007G011500 Sobic007G049500 Sobic007G049500 Sobic007G024600--Sobic007G049500 Sobic003G254500 Sobic003G254500 Sobic007G024600--Sobic003G254500 Sobic006G129200 Sobic006G129200 Sobic007G024600--Sobic006G129200 Sobic002G039900 Sobic002G039900 Sobic007G024600--Sobic002G039900 Sobic005G041800 Sobic005G041800 Sobic007G024600--Sobic005G041800 Sobic008G013500 Sobic008G013500 Sobic007G024600--Sobic008G013500 Sobic005G149100--Sobic007G024600 Sobic005G149100--Sobic007G049500 Sobic005G149100--Sobic008G013500 Sobic005G149100--Sobic002G152300 Sobic005G149100--Sobic002G039900 Sobic005G149100--Sobic007G011500 Sobic004G234400 Sobic004G234400 Sobic005G149100--Sobic004G234400 Sobic005G149100--Sobic003G254500 Sobic004G146700 Sobic004G146700 Sobic005G149100--Sobic004G146700 Sobic002G152300--Sobic007G011500 Sobic002G152300--Sobic007G024600 Sobic002G152300--Sobic006G129200 Sobic002G152300--Sobic005G041800 Sobic002G152300--Sobic003G254500 Sobic002G152300--Sobic005G149100 Sobic003G373200 Sobic003G373200 Sobic002G152300--Sobic003G373200 Sobic002G367500 Sobic002G367500 Sobic002G152300--Sobic002G367500 Sobic002G152300--Sobic007G049500 Sobic007G011500--Sobic005G041800 Sobic007G011500--Sobic006G129200 Sobic007G011500--Sobic002G152300 Sobic007G011500--Sobic003G254500 Sobic007G011500--Sobic007G024600 Sobic007G011500--Sobic003G373200 Sobic007G011500--Sobic002G367500 Sobic002G032033 Sobic002G032033 Sobic007G011500--Sobic002G032033 Sobic002G393266 Sobic002G393266 Sobic007G011500--Sobic002G393266 Sobic007G049500--Sobic005G149100 Sobic007G049500--Sobic007G024600 Sobic007G049500--Sobic008G013500 Sobic007G049500--Sobic002G039900 Sobic007G049500--Sobic004G234400 Sobic007G049500--Sobic002G152300 Sobic001G472301 Sobic001G472301 Sobic007G049500--Sobic001G472301 Sobic008G154900 Sobic008G154900 Sobic007G049500--Sobic008G154900 Sobic007G049500--Sobic006G129200 Sobic003G254500--Sobic007G011500 Sobic003G254500--Sobic007G024600 Sobic003G254500--Sobic005G041800 Sobic003G254500--Sobic002G152300 Sobic003G254500--Sobic006G129200 Sobic003G254500--Sobic003G373200 Sobic003G254500--Sobic005G149100 Sobic003G254500--Sobic002G367500 Sobic003G254500--Sobic002G032033 Sobic006G129200--Sobic007G011500 Sobic006G129200--Sobic005G041800 Sobic006G129200--Sobic002G152300 Sobic006G129200--Sobic003G254500 Sobic006G129200--Sobic007G024600 Sobic006G129200--Sobic003G373200 Sobic006G129200--Sobic002G367500 Sobic006G129200--Sobic002G032033 Sobic006G129200--Sobic002G393266 Sobic002G039900--Sobic007G049500 Sobic002G039900--Sobic005G149100 Sobic002G039900--Sobic007G024600 Sobic002G039900--Sobic008G013500 Sobic002G039900--Sobic008G154900 Sobic002G039900--Sobic004G234400 Sobic002G039900--Sobic002G152300 Sobic002G039900--Sobic001G472301 Sobic002G039900--Sobic007G011500 Sobic005G041800--Sobic003G373200 Sobic005G041800--Sobic007G011500 Sobic005G041800--Sobic002G032033 Sobic005G216866 Sobic005G216866 Sobic005G041800--Sobic005G216866 Sobic005G041800--Sobic006G129200 Sobic004G224350 Sobic004G224350 Sobic005G041800--Sobic004G224350 Sobic005G041800--Sobic002G393266 Sobic003G268650 Sobic003G268650 Sobic005G041800--Sobic003G268650 Sobic001G183900 Sobic001G183900 Sobic005G041800--Sobic001G183900 Sobic008G013500--Sobic001G472301 Sobic007G153100 Sobic007G153100 Sobic008G013500--Sobic007G153100 Sobic001G511600 Sobic001G511600 Sobic008G013500--Sobic001G511600 Sobic008G013500--Sobic004G234400 Sobic008G159601 Sobic008G159601 Sobic008G013500--Sobic008G159601 Sobic002G179200 Sobic002G179200 Sobic008G013500--Sobic002G179200 Sobic005G090000 Sobic005G090000 Sobic008G013500--Sobic005G090000 Sobic003G011700 Sobic003G011700 Sobic008G013500--Sobic003G011700 Sobic001G102600 Sobic001G102600 Sobic008G013500--Sobic001G102600
Octagon: transcription factors


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