Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G039900.2
Synonym Sb02g003433, lateral organ boundaries, SbLBD12
Functional annotation "domain confirmed by Pfam database, expression induced by IAA and BR treatments" (PubMedID : 20499123)
-
UniProt A0A1W0W288
Pfam PF03195
Panther DB PTHR31301 PTHR31301:SF23
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G63090 : Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g41600.1 : DUF260 domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a016147 , Zm00025a016146
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.005G059900 NAM, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G039900 Sobic002G039900 Sobic007G049500 Sobic007G049500 Sobic002G039900--Sobic007G049500 Sobic005G149100 Sobic005G149100 Sobic002G039900--Sobic005G149100 Sobic007G024600 Sobic007G024600 Sobic002G039900--Sobic007G024600 Sobic008G013500 Sobic008G013500 Sobic002G039900--Sobic008G013500 Sobic008G154900 Sobic008G154900 Sobic002G039900--Sobic008G154900 Sobic004G234400 Sobic004G234400 Sobic002G039900--Sobic004G234400 Sobic002G152300 Sobic002G152300 Sobic002G039900--Sobic002G152300 Sobic001G472301 Sobic001G472301 Sobic002G039900--Sobic001G472301 Sobic007G011500 Sobic007G011500 Sobic002G039900--Sobic007G011500 Sobic007G049500--Sobic005G149100 Sobic007G049500--Sobic007G024600 Sobic007G049500--Sobic008G013500 Sobic007G049500--Sobic002G039900 Sobic007G049500--Sobic004G234400 Sobic007G049500--Sobic002G152300 Sobic007G049500--Sobic001G472301 Sobic007G049500--Sobic008G154900 Sobic006G129200 Sobic006G129200 Sobic007G049500--Sobic006G129200 Sobic005G149100--Sobic007G024600 Sobic005G149100--Sobic007G049500 Sobic005G149100--Sobic008G013500 Sobic005G149100--Sobic002G152300 Sobic005G149100--Sobic002G039900 Sobic005G149100--Sobic007G011500 Sobic005G149100--Sobic004G234400 Sobic003G254500 Sobic003G254500 Sobic005G149100--Sobic003G254500 Sobic004G146700 Sobic004G146700 Sobic005G149100--Sobic004G146700 Sobic007G024600--Sobic005G149100 Sobic007G024600--Sobic002G152300 Sobic007G024600--Sobic007G011500 Sobic007G024600--Sobic007G049500 Sobic007G024600--Sobic003G254500 Sobic007G024600--Sobic006G129200 Sobic007G024600--Sobic002G039900 Sobic005G041800 Sobic005G041800 Sobic007G024600--Sobic005G041800 Sobic007G024600--Sobic008G013500 Sobic008G013500--Sobic001G472301 Sobic007G153100 Sobic007G153100 Sobic008G013500--Sobic007G153100 Sobic001G511600 Sobic001G511600 Sobic008G013500--Sobic001G511600 Sobic008G013500--Sobic004G234400 Sobic008G159601 Sobic008G159601 Sobic008G013500--Sobic008G159601 Sobic002G179200 Sobic002G179200 Sobic008G013500--Sobic002G179200 Sobic005G090000 Sobic005G090000 Sobic008G013500--Sobic005G090000 Sobic003G011700 Sobic003G011700 Sobic008G013500--Sobic003G011700 Sobic001G102600 Sobic001G102600 Sobic008G013500--Sobic001G102600 Sobic006G005800 Sobic006G005800 Sobic008G154900--Sobic006G005800 Sobic008G154900--Sobic003G011700 Sobic008G154900--Sobic002G179200 Sobic006G274000 Sobic006G274000 Sobic008G154900--Sobic006G274000 Sobic008G154900--Sobic004G234400 Sobic001G266100 Sobic001G266100 Sobic008G154900--Sobic001G266100 Sobic008G154900--Sobic008G013500 Sobic002G353100 Sobic002G353100 Sobic008G154900--Sobic002G353100 Sobic008G154900--Sobic001G472301 Sobic004G234400--Sobic008G013500 Sobic004G234400--Sobic001G472301 Sobic004G234400--Sobic007G153100 Sobic004G234400--Sobic008G159601 Sobic004G234400--Sobic001G511600 Sobic003G090700 Sobic003G090700 Sobic004G234400--Sobic003G090700 Sobic004G234400--Sobic008G154900 Sobic004G234400--Sobic002G179200 Sobic004G234400--Sobic007G049500 Sobic002G152300--Sobic007G011500 Sobic002G152300--Sobic007G024600 Sobic002G152300--Sobic006G129200 Sobic002G152300--Sobic005G041800 Sobic002G152300--Sobic003G254500 Sobic002G152300--Sobic005G149100 Sobic003G373200 Sobic003G373200 Sobic002G152300--Sobic003G373200 Sobic002G367500 Sobic002G367500 Sobic002G152300--Sobic002G367500 Sobic002G152300--Sobic007G049500 Sobic001G472301--Sobic001G511600 Sobic001G472301--Sobic008G013500 Sobic001G472301--Sobic007G153100 Sobic001G472301--Sobic005G090000 Sobic001G472301--Sobic001G102600 Sobic001G472301--Sobic003G011700 Sobic001G472400 Sobic001G472400 Sobic001G472301--Sobic001G472400 Sobic001G472301--Sobic002G179200 Sobic010G189366 Sobic010G189366 Sobic001G472301--Sobic010G189366 Sobic007G011500--Sobic005G041800 Sobic007G011500--Sobic006G129200 Sobic007G011500--Sobic002G152300 Sobic007G011500--Sobic003G254500 Sobic007G011500--Sobic007G024600 Sobic007G011500--Sobic003G373200 Sobic007G011500--Sobic002G367500 Sobic002G032033 Sobic002G032033 Sobic007G011500--Sobic002G032033 Sobic002G393266 Sobic002G393266 Sobic007G011500--Sobic002G393266
Octagon: transcription factors


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