Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G511600.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QQM5
Pfam PF07762
Panther DB PTHR33086 PTHR33086:SF8
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g20310.4 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G102600 regulatory protein, putative, expressed -
2 Sobic.001G472301 - -
3 Sobic.003G011700 3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase, putative, expressed K00606: 3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase
4 Sobic.001G472400 pumilio domain-containing protein PPD1, putative, expressed -
5 Sobic.010G189366 - K01674: carbonic anhydrase
6 Sobic.005G090000 expressed protein -
7 Sobic.004G349150 - -
8 Sobic.004G202800 glycosyl hydrolase family 5 protein, putative, expressed -
9 Sobic.003G004900 AMP-binding domain containing protein, expressed K01904: 4-coumarate--CoA ligase
10 Sobic.007G153100 GS9(Ortholog in rice:Zhao et al.(2018))(PubMedID : 31659906)@expressed protein -
11 Sobic.006G137000 protein phosphatase 2C, putative, expressed K17499: PPM1G, protein phosphatase 1G
12 Sobic.006G267400 CRP2 - Cysteine-rich family protein precursor, expressed -
13 Sobic.006G006800 expressed protein -
14 Sobic.004G001700 POEI25 - Pollen Ole e I allergen and extensin family protein precursor, expressed -
15 Sobic.010G048000 expressed protein -
16 Sobic.006G092300 ZOS4-06 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
17 Sobic.002G179200 DUF623 domain containing protein, expressed -
18 Sobic.002G173300 BURP domain containing protein, expressed -
19 Sobic.010G187400 ABC-2 type transporter domain containing protein, expressed -
20 Sobic.008G032400 LTPL58 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G511600 Sobic001G511600 Sobic001G102600 Sobic001G102600 Sobic001G511600--Sobic001G102600 Sobic001G472301 Sobic001G472301 Sobic001G511600--Sobic001G472301 Sobic003G011700 Sobic003G011700 Sobic001G511600--Sobic003G011700 Sobic001G472400 Sobic001G472400 Sobic001G511600--Sobic001G472400 Sobic010G189366 Sobic010G189366 Sobic001G511600--Sobic010G189366 Sobic005G090000 Sobic005G090000 Sobic001G511600--Sobic005G090000 Sobic004G349150 Sobic004G349150 Sobic001G511600--Sobic004G349150 Sobic004G202800 Sobic004G202800 Sobic001G511600--Sobic004G202800 Sobic003G004900 Sobic003G004900 Sobic001G511600--Sobic003G004900 Sobic001G102600--Sobic010G189366 Sobic001G102600--Sobic004G349150 Sobic006G267400 Sobic006G267400 Sobic001G102600--Sobic006G267400 Sobic004G001700 Sobic004G001700 Sobic001G102600--Sobic004G001700 Sobic010G187400 Sobic010G187400 Sobic001G102600--Sobic010G187400 Sobic001G102600--Sobic003G004900 Sobic006G098300 Sobic006G098300 Sobic001G102600--Sobic006G098300 Sobic008G032400 Sobic008G032400 Sobic001G102600--Sobic008G032400 Sobic001G102600--Sobic001G472400 Sobic001G472301--Sobic001G511600 Sobic008G013500 Sobic008G013500 Sobic001G472301--Sobic008G013500 Sobic007G153100 Sobic007G153100 Sobic001G472301--Sobic007G153100 Sobic001G472301--Sobic005G090000 Sobic001G472301--Sobic001G102600 Sobic001G472301--Sobic003G011700 Sobic001G472301--Sobic001G472400 Sobic002G179200 Sobic002G179200 Sobic001G472301--Sobic002G179200 Sobic001G472301--Sobic010G189366 Sobic003G011700--Sobic001G102600 Sobic003G011700--Sobic010G189366 Sobic001G491400 Sobic001G491400 Sobic003G011700--Sobic001G491400 Sobic010G049600 Sobic010G049600 Sobic003G011700--Sobic010G049600 Sobic003G011700--Sobic004G349150 Sobic003G011700--Sobic001G472400 Sobic003G011700--Sobic003G004900 Sobic005G200700 Sobic005G200700 Sobic003G011700--Sobic005G200700 Sobic003G011700--Sobic001G511600 Sobic001G472400--Sobic010G189366 Sobic001G472400--Sobic001G102600 Sobic001G472400--Sobic004G349150 Sobic001G472400--Sobic004G001700 Sobic001G472400--Sobic006G267400 Sobic001G472400--Sobic010G187400 Sobic010G259400 Sobic010G259400 Sobic001G472400--Sobic010G259400 Sobic001G472400--Sobic004G202800 Sobic001G472400--Sobic008G032400 Sobic010G189366--Sobic004G349150 Sobic010G189366--Sobic001G102600 Sobic010G189366--Sobic004G001700 Sobic010G189366--Sobic010G187400 Sobic010G189366--Sobic008G032400 Sobic006G006900 Sobic006G006900 Sobic010G189366--Sobic006G006900 Sobic002G270400 Sobic002G270400 Sobic010G189366--Sobic002G270400 Sobic001G133200 Sobic001G133200 Sobic010G189366--Sobic001G133200 Sobic005G090000--Sobic001G511600 Sobic010G048000 Sobic010G048000 Sobic005G090000--Sobic010G048000 Sobic005G090000--Sobic001G472400 Sobic005G090000--Sobic001G472301 Sobic005G090000--Sobic001G102600 Sobic005G090000--Sobic003G011700 Sobic005G090000--Sobic010G189366 Sobic005G090000--Sobic002G179200 Sobic005G090000--Sobic004G202800 Sobic004G349150--Sobic010G189366 Sobic004G349150--Sobic010G187400 Sobic004G349150--Sobic004G001700 Sobic004G349150--Sobic008G032400 Sobic004G349150--Sobic006G006900 Sobic004G349150--Sobic002G270400 Sobic003G263800 Sobic003G263800 Sobic004G349150--Sobic003G263800 Sobic002G427550 Sobic002G427550 Sobic004G349150--Sobic002G427550 Sobic004G349150--Sobic001G133200 Sobic006G006800 Sobic006G006800 Sobic004G202800--Sobic006G006800 Sobic010G236000 Sobic010G236000 Sobic004G202800--Sobic010G236000 Sobic004G202800--Sobic008G032400 Sobic004G202800--Sobic006G006900 Sobic003G088200 Sobic003G088200 Sobic004G202800--Sobic003G088200 Sobic004G202800--Sobic010G187400 Sobic004G202800--Sobic003G263800 Sobic004G202800--Sobic001G133200 Sobic007G180700 Sobic007G180700 Sobic003G004900--Sobic007G180700 Sobic003G004900--Sobic006G267400 Sobic003G004900--Sobic001G102600 Sobic003G004900--Sobic010G189366 Sobic002G173300 Sobic002G173300 Sobic003G004900--Sobic002G173300 Sobic003G004900--Sobic004G349150 Sobic003G004900--Sobic004G001700 Sobic003G004900--Sobic006G098300 Sobic006G137000 Sobic006G137000 Sobic003G004900--Sobic006G137000
Octagon: transcription factors


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