Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G159601.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt C6JSH1 , A0A1Z5R7W1 , A0A109ND73
Pfam PF00612
Panther DB PTHR32295 PTHR32295:SF37
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G14750 : IQ-domain 19
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g43580.1 : IQ calmodulin-binding motif family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025301 , Zm00025a007338
Brachypodium KQK14057 , PNT74401 , PNT62370 , KQJ85920 , KQJ85921
Barley HORVU3Hr1G055710.9 , HORVU3Hr1G055710.8 , HORVU3Hr1G055710.7 , HORVU3Hr1G055710.6 , HORVU3Hr1G055710.5 , HORVU3Hr1G055710.4 , HORVU3Hr1G055710.3 , HORVU3Hr1G055710.2 , HORVU3Hr1G055710.1 , HORVU3Hr1G055710.16 , HORVU3Hr1G055710.15 , HORVU3Hr1G055710.14 , HORVU3Hr1G055710.13 , HORVU3Hr1G055710.12 , HORVU3Hr1G055710.11 , HORVU3Hr1G055710.10
Wheat TraesCS5B02G381100 , TraesCS5D02G387500 , TraesCS5A02G377500 , TraesCSU02G074100 , TraesCS5A02G055100
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G013500 chalcone synthase, putative, expressed -
2 Sobic.001G472301 - -
3 Sobic.007G153100 GS9(Ortholog in rice:Zhao et al.(2018))(PubMedID : 31659906)@expressed protein -
4 Sobic.001G511600 expressed protein -
5 Sobic.002G179200 DUF623 domain containing protein, expressed -
6 Sobic.006G092300 ZOS4-06 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
7 Sobic.004G234400 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
8 Sobic.003G004900 AMP-binding domain containing protein, expressed K01904: 4-coumarate--CoA ligase
9 Sobic.003G120600 transmembrane protein 136, putative, expressed -
10 Sobic.001G102600 regulatory protein, putative, expressed -
11 Sobic.005G090000 expressed protein -
12 Sobic.003G011700 3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase, putative, expressed K00606: 3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase
13 Sobic.006G137000 protein phosphatase 2C, putative, expressed K17499: PPM1G, protein phosphatase 1G
14 Sobic.001G472400 pumilio domain-containing protein PPD1, putative, expressed -
15 Sobic.010G189366 - K01674: carbonic anhydrase
16 Sobic.010G048000 expressed protein -
17 Sobic.001G133100 ribosome inactivating protein, putative, expressed -
18 Sobic.001G320300 HOTHEAD precursor, putative, expressed -
19 Sobic.006G165300 OsSub42 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
20 Sobic.006G267400 CRP2 - Cysteine-rich family protein precursor, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G159601 Sobic008G159601 Sobic008G013500 Sobic008G013500 Sobic008G159601--Sobic008G013500 Sobic001G472301 Sobic001G472301 Sobic008G159601--Sobic001G472301 Sobic007G153100 Sobic007G153100 Sobic008G159601--Sobic007G153100 Sobic001G511600 Sobic001G511600 Sobic008G159601--Sobic001G511600 Sobic002G179200 Sobic002G179200 Sobic008G159601--Sobic002G179200 Sobic006G092300 Sobic006G092300 Sobic008G159601--Sobic006G092300 Sobic004G234400 Sobic004G234400 Sobic008G159601--Sobic004G234400 Sobic003G004900 Sobic003G004900 Sobic008G159601--Sobic003G004900 Sobic003G120600 Sobic003G120600 Sobic008G159601--Sobic003G120600 Sobic008G013500--Sobic001G472301 Sobic008G013500--Sobic007G153100 Sobic008G013500--Sobic001G511600 Sobic008G013500--Sobic004G234400 Sobic008G013500--Sobic008G159601 Sobic008G013500--Sobic002G179200 Sobic005G090000 Sobic005G090000 Sobic008G013500--Sobic005G090000 Sobic003G011700 Sobic003G011700 Sobic008G013500--Sobic003G011700 Sobic001G102600 Sobic001G102600 Sobic008G013500--Sobic001G102600 Sobic001G472301--Sobic001G511600 Sobic001G472301--Sobic008G013500 Sobic001G472301--Sobic007G153100 Sobic001G472301--Sobic005G090000 Sobic001G472301--Sobic001G102600 Sobic001G472301--Sobic003G011700 Sobic001G472400 Sobic001G472400 Sobic001G472301--Sobic001G472400 Sobic001G472301--Sobic002G179200 Sobic010G189366 Sobic010G189366 Sobic001G472301--Sobic010G189366 Sobic007G153100--Sobic001G511600 Sobic007G153100--Sobic001G472301 Sobic006G137000 Sobic006G137000 Sobic007G153100--Sobic006G137000 Sobic007G153100--Sobic001G102600 Sobic007G153100--Sobic008G013500 Sobic007G153100--Sobic003G004900 Sobic007G153100--Sobic002G179200 Sobic007G153100--Sobic003G011700 Sobic007G153100--Sobic010G189366 Sobic001G511600--Sobic001G102600 Sobic001G511600--Sobic001G472301 Sobic001G511600--Sobic003G011700 Sobic001G511600--Sobic001G472400 Sobic001G511600--Sobic010G189366 Sobic001G511600--Sobic005G090000 Sobic004G349150 Sobic004G349150 Sobic001G511600--Sobic004G349150 Sobic004G202800 Sobic004G202800 Sobic001G511600--Sobic004G202800 Sobic001G511600--Sobic003G004900 Sobic001G366000 Sobic001G366000 Sobic002G179200--Sobic001G366000 Sobic002G179200--Sobic003G011700 Sobic002G179200--Sobic001G102600 Sobic008G004200 Sobic008G004200 Sobic002G179200--Sobic008G004200 Sobic002G179200--Sobic001G511600 Sobic002G179200--Sobic006G092300 Sobic002G179200--Sobic010G189366 Sobic002G179200--Sobic003G004900 Sobic002G179200--Sobic001G472400 Sobic006G079500 Sobic006G079500 Sobic006G092300--Sobic006G079500 Sobic006G092300--Sobic001G102600 Sobic006G092300--Sobic010G189366 Sobic010G215700 Sobic010G215700 Sobic006G092300--Sobic010G215700 Sobic007G206000 Sobic007G206000 Sobic006G092300--Sobic007G206000 Sobic006G092300--Sobic004G349150 Sobic005G226500 Sobic005G226500 Sobic006G092300--Sobic005G226500 Sobic001G491400 Sobic001G491400 Sobic006G092300--Sobic001G491400 Sobic005G200700 Sobic005G200700 Sobic006G092300--Sobic005G200700 Sobic004G234400--Sobic008G013500 Sobic004G234400--Sobic001G472301 Sobic004G234400--Sobic007G153100 Sobic004G234400--Sobic008G159601 Sobic004G234400--Sobic001G511600 Sobic003G090700 Sobic003G090700 Sobic004G234400--Sobic003G090700 Sobic008G154900 Sobic008G154900 Sobic004G234400--Sobic008G154900 Sobic004G234400--Sobic002G179200 Sobic007G049500 Sobic007G049500 Sobic004G234400--Sobic007G049500 Sobic007G180700 Sobic007G180700 Sobic003G004900--Sobic007G180700 Sobic006G267400 Sobic006G267400 Sobic003G004900--Sobic006G267400 Sobic003G004900--Sobic001G102600 Sobic003G004900--Sobic010G189366 Sobic002G173300 Sobic002G173300 Sobic003G004900--Sobic002G173300 Sobic003G004900--Sobic004G349150 Sobic004G001700 Sobic004G001700 Sobic003G004900--Sobic004G001700 Sobic006G098300 Sobic006G098300 Sobic003G004900--Sobic006G098300 Sobic003G004900--Sobic006G137000 Sobic007G125400 Sobic007G125400 Sobic003G120600--Sobic007G125400 Sobic003G120600--Sobic003G004900 Sobic003G120600--Sobic008G004200 Sobic003G120600--Sobic002G179200 Sobic001G438500 Sobic001G438500 Sobic003G120600--Sobic001G438500 Sobic001G179400 Sobic001G179400 Sobic003G120600--Sobic001G179400 Sobic003G120600--Sobic006G092300 Sobic010G065700 Sobic010G065700 Sobic003G120600--Sobic010G065700 Sobic008G012600 Sobic008G012600 Sobic003G120600--Sobic008G012600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.