Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G149100.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RIM5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G024600 - -
2 Sobic.007G049500 expressed protein -
3 Sobic.008G013500 chalcone synthase, putative, expressed -
4 Sobic.002G152300 expressed protein -
5 Sobic.002G039900 "domain confirmed by Pfam database, expression induced by IAA and BR treatments"(PubMedID : 20499123)@- -
6 Sobic.007G011500 OsFBX64 - F-box domain containing protein, expressed -
7 Sobic.004G234400 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
8 Sobic.003G254500 expressed protein -
9 Sobic.004G146700 peroxidase family protein, expressed K00430: peroxidase
10 Sobic.006G129200 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
11 Sobic.001G472301 - -
12 Sobic.008G159601 - -
13 Sobic.003G006600 aquaporin protein, putative, expressed K09873: aquaporin TIP
14 Sobic.007G153100 GS9(Ortholog in rice:Zhao et al.(2018))(PubMedID : 31659906)@expressed protein -
15 Sobic.002G367500 expressed protein -
16 Sobic.008G154900 expressed protein -
17 Sobic.001G511600 expressed protein -
18 Sobic.001G480200 THO complex subunit 1, putative, expressed -
19 Sobic.005G041800 expressed protein -
20 Sobic.003G090700 expressed protein -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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