Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G090700.1
Synonym Sb03g007588
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0VWC4
Pfam PF04601 PF07762
Panther DB PTHR33086 PTHR33086:SF8
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g14180.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G038400 expressed protein -
2 Sobic.001G472301 - -
3 Sobic.001G511600 expressed protein -
4 Sobic.008G013500 chalcone synthase, putative, expressed -
5 Sobic.007G043300 monocopper oxidase, putative, expressed -
6 Sobic.001G102600 regulatory protein, putative, expressed -
7 Sobic.007G153100 GS9(Ortholog in rice:Zhao et al.(2018))(PubMedID : 31659906)@expressed protein -
8 Sobic.002G380800 - -
9 Sobic.010G050100 expressed protein -
10 Sobic.010G189366 - K01674: carbonic anhydrase
11 Sobic.006G137000 protein phosphatase 2C, putative, expressed K17499: PPM1G, protein phosphatase 1G
12 Sobic.005G158400 expressed protein -
13 Sobic.004G234400 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
14 Sobic.001G472400 pumilio domain-containing protein PPD1, putative, expressed -
15 Sobic.002G035000 OsGrx_C10 - glutaredoxin subgroup III, expressed K03676: grxC, GLRX, glutaredoxin 3
16 Sobic.003G011700 3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase, putative, expressed K00606: 3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase
17 Sobic.010G048000 expressed protein -
18 Sobic.005G090000 expressed protein -
19 Sobic.003G038800 Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@nodulin MtN3 family protein, putative, expressed K15382: SLC50A, solute carrier family 50 (sugar transporter)
20 Sobic.002G179200 DUF623 domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G090700 Sobic003G090700 Sobic010G038400 Sobic010G038400 Sobic003G090700--Sobic010G038400 Sobic001G472301 Sobic001G472301 Sobic003G090700--Sobic001G472301 Sobic001G511600 Sobic001G511600 Sobic003G090700--Sobic001G511600 Sobic008G013500 Sobic008G013500 Sobic003G090700--Sobic008G013500 Sobic007G043300 Sobic007G043300 Sobic003G090700--Sobic007G043300 Sobic001G102600 Sobic001G102600 Sobic003G090700--Sobic001G102600 Sobic007G153100 Sobic007G153100 Sobic003G090700--Sobic007G153100 Sobic002G380800 Sobic002G380800 Sobic003G090700--Sobic002G380800 Sobic010G050100 Sobic010G050100 Sobic003G090700--Sobic010G050100 Sobic010G038400--Sobic010G050100 Sobic009G046000 Sobic009G046000 Sobic010G038400--Sobic009G046000 Sobic003G271700 Sobic003G271700 Sobic010G038400--Sobic003G271700 Sobic005G090100 Sobic005G090100 Sobic010G038400--Sobic005G090100 Sobic006G089700 Sobic006G089700 Sobic010G038400--Sobic006G089700 Sobic010G236000 Sobic010G236000 Sobic010G038400--Sobic010G236000 Sobic007G206000 Sobic007G206000 Sobic010G038400--Sobic007G206000 Sobic002G410600 Sobic002G410600 Sobic010G038400--Sobic002G410600 Sobic010G038400--Sobic007G043300 Sobic001G472301--Sobic001G511600 Sobic001G472301--Sobic008G013500 Sobic001G472301--Sobic007G153100 Sobic005G090000 Sobic005G090000 Sobic001G472301--Sobic005G090000 Sobic001G472301--Sobic001G102600 Sobic003G011700 Sobic003G011700 Sobic001G472301--Sobic003G011700 Sobic001G472400 Sobic001G472400 Sobic001G472301--Sobic001G472400 Sobic002G179200 Sobic002G179200 Sobic001G472301--Sobic002G179200 Sobic010G189366 Sobic010G189366 Sobic001G472301--Sobic010G189366 Sobic001G511600--Sobic001G102600 Sobic001G511600--Sobic001G472301 Sobic001G511600--Sobic003G011700 Sobic001G511600--Sobic001G472400 Sobic001G511600--Sobic010G189366 Sobic001G511600--Sobic005G090000 Sobic004G349150 Sobic004G349150 Sobic001G511600--Sobic004G349150 Sobic004G202800 Sobic004G202800 Sobic001G511600--Sobic004G202800 Sobic003G004900 Sobic003G004900 Sobic001G511600--Sobic003G004900 Sobic008G013500--Sobic001G472301 Sobic008G013500--Sobic007G153100 Sobic008G013500--Sobic001G511600 Sobic004G234400 Sobic004G234400 Sobic008G013500--Sobic004G234400 Sobic008G159601 Sobic008G159601 Sobic008G013500--Sobic008G159601 Sobic008G013500--Sobic002G179200 Sobic008G013500--Sobic005G090000 Sobic008G013500--Sobic003G011700 Sobic008G013500--Sobic001G102600 Sobic007G043300--Sobic010G038400 Sobic010G087800 Sobic010G087800 Sobic007G043300--Sobic010G087800 Sobic003G375300 Sobic003G375300 Sobic007G043300--Sobic003G375300 Sobic007G043300--Sobic003G090700 Sobic007G043300--Sobic003G271700 Sobic002G035000 Sobic002G035000 Sobic007G043300--Sobic002G035000 Sobic007G043300--Sobic010G050100 Sobic007G043300--Sobic006G089700 Sobic003G009800 Sobic003G009800 Sobic007G043300--Sobic003G009800 Sobic001G102600--Sobic010G189366 Sobic001G102600--Sobic004G349150 Sobic006G267400 Sobic006G267400 Sobic001G102600--Sobic006G267400 Sobic004G001700 Sobic004G001700 Sobic001G102600--Sobic004G001700 Sobic010G187400 Sobic010G187400 Sobic001G102600--Sobic010G187400 Sobic001G102600--Sobic003G004900 Sobic006G098300 Sobic006G098300 Sobic001G102600--Sobic006G098300 Sobic008G032400 Sobic008G032400 Sobic001G102600--Sobic008G032400 Sobic001G102600--Sobic001G472400 Sobic007G153100--Sobic001G511600 Sobic007G153100--Sobic001G472301 Sobic006G137000 Sobic006G137000 Sobic007G153100--Sobic006G137000 Sobic007G153100--Sobic001G102600 Sobic007G153100--Sobic008G013500 Sobic007G153100--Sobic003G004900 Sobic007G153100--Sobic002G179200 Sobic007G153100--Sobic003G011700 Sobic007G153100--Sobic010G189366 Sobic003G038800 Sobic003G038800 Sobic002G380800--Sobic003G038800 Sobic002G380800--Sobic002G410600 Sobic003G038700 Sobic003G038700 Sobic002G380800--Sobic003G038700 Sobic002G380800--Sobic002G035000 Sobic009G075000 Sobic009G075000 Sobic002G380800--Sobic009G075000 Sobic006G151800 Sobic006G151800 Sobic002G380800--Sobic006G151800 Sobic002G380800--Sobic010G189366 Sobic002G380800--Sobic004G349150 Sobic002G380800--Sobic009G046000 Sobic010G050100--Sobic010G236000 Sobic010G050100--Sobic005G090100 Sobic005G200700 Sobic005G200700 Sobic010G050100--Sobic005G200700 Sobic002G399600 Sobic002G399600 Sobic010G050100--Sobic002G399600 Sobic010G050100--Sobic004G001700 Sobic009G074900 Sobic009G074900 Sobic010G050100--Sobic009G074900 Sobic005G226500 Sobic005G226500 Sobic010G050100--Sobic005G226500 Sobic007G107500 Sobic007G107500 Sobic010G050100--Sobic007G107500 Sobic007G037400 Sobic007G037400 Sobic010G050100--Sobic007G037400
Octagon: transcription factors


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