Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G373200.1
Synonym Sb03g041380
Functional annotation strictosidine synthase, putative, expressed
UniProt C5XRB6
Pfam PF03088
Panther DB PTHR10426 PTHR10426:SF34
NCBI CDD KOG1520; Predicted alkaloid synthase/Surface mucin Hemomucin
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016844; strictosidine synthase activity GO:0009058biosynthetic process


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G57030 : Calcium-dependent phosphotriesterase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g07810.1 : strictosidine synthase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a039537 , Zm00025a002403 , Zm00025a002400 , Zm00025a039540 , Zm00025a002406 , Zm00025a039641
Brachypodium -
Barley HORVU2Hr1G013460.2 , HORVU2Hr1G013460.3 , HORVU2Hr1G013460.1 , HORVU5Hr1G093840.3 , HORVU5Hr1G093840.2 , HORVU5Hr1G093840.1 , HORVU2Hr1G012970.4 , HORVU2Hr1G012970.3 , HORVU2Hr1G012970.2 , HORVU2Hr1G012970.1 , HORVU3Hr1G065520.3 , HORVU3Hr1G065520.2 , HORVU6Hr1G026020.2 , HORVU6Hr1G026020.3 , HORVU6Hr1G026020.1 , HORVU3Hr1G065520.1 , HORVU6Hr1G026020.4
Wheat TraesCS2D02G076200 , TraesCS2B02G092900 , TraesCS2D02G076400 , TraesCS2D02G076300 , TraesCS5B02G383000 , TraesCS5B02G382800 , TraesCS3B02G289800 , TraesCS3D02G256900 , TraesCS5D02G389100 , TraesCSU02G189700 , TraesCS3A02G256600 , TraesCS2A02G078000
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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20 Sobic.010G158300 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G373200 Sobic003G373200 Sobic005G041800 Sobic005G041800 Sobic003G373200--Sobic005G041800 Sobic002G032033 Sobic002G032033 Sobic003G373200--Sobic002G032033 Sobic003G268650 Sobic003G268650 Sobic003G373200--Sobic003G268650 Sobic005G216866 Sobic005G216866 Sobic003G373200--Sobic005G216866 Sobic007G011500 Sobic007G011500 Sobic003G373200--Sobic007G011500 Sobic004G224350 Sobic004G224350 Sobic003G373200--Sobic004G224350 Sobic001G183900 Sobic001G183900 Sobic003G373200--Sobic001G183900 Sobic001G167701 Sobic001G167701 Sobic003G373200--Sobic001G167701 Sobic005G167600 Sobic005G167600 Sobic003G373200--Sobic005G167600 Sobic005G041800--Sobic003G373200 Sobic005G041800--Sobic007G011500 Sobic005G041800--Sobic002G032033 Sobic005G041800--Sobic005G216866 Sobic006G129200 Sobic006G129200 Sobic005G041800--Sobic006G129200 Sobic005G041800--Sobic004G224350 Sobic002G393266 Sobic002G393266 Sobic005G041800--Sobic002G393266 Sobic005G041800--Sobic003G268650 Sobic005G041800--Sobic001G183900 Sobic002G032033--Sobic001G183900 Sobic002G032033--Sobic005G216866 Sobic002G032033--Sobic004G224350 Sobic004G246950 Sobic004G246950 Sobic002G032033--Sobic004G246950 Sobic002G032033--Sobic005G167600 Sobic002G032033--Sobic003G268650 Sobic003G072100 Sobic003G072100 Sobic002G032033--Sobic003G072100 Sobic002G032033--Sobic001G167701 Sobic002G430601 Sobic002G430601 Sobic002G032033--Sobic002G430601 Sobic003G268650--Sobic001G183900 Sobic003G268650--Sobic002G032033 Sobic003G094850 Sobic003G094850 Sobic003G268650--Sobic003G094850 Sobic005G102750 Sobic005G102750 Sobic003G268650--Sobic005G102750 Sobic005G190400 Sobic005G190400 Sobic003G268650--Sobic005G190400 Sobic003G268650--Sobic005G216866 Sobic009G219601 Sobic009G219601 Sobic003G268650--Sobic009G219601 Sobic003G268650--Sobic004G246950 Sobic003G268650--Sobic003G072100 Sobic005G216866--Sobic001G183900 Sobic005G216866--Sobic002G032033 Sobic005G216866--Sobic004G246950 Sobic001G338200 Sobic001G338200 Sobic005G216866--Sobic001G338200 Sobic005G216866--Sobic004G224350 Sobic010G090550 Sobic010G090550 Sobic005G216866--Sobic010G090550 Sobic005G216866--Sobic003G072100 Sobic005G216866--Sobic005G167600 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic005G216866--Sobic001G018700 Sobic007G011500--Sobic005G041800 Sobic007G011500--Sobic006G129200 Sobic002G152300 Sobic002G152300 Sobic007G011500--Sobic002G152300 Sobic003G254500 Sobic003G254500 Sobic007G011500--Sobic003G254500 Sobic007G024600 Sobic007G024600 Sobic007G011500--Sobic007G024600 Sobic007G011500--Sobic003G373200 Sobic002G367500 Sobic002G367500 Sobic007G011500--Sobic002G367500 Sobic007G011500--Sobic002G032033 Sobic007G011500--Sobic002G393266 Sobic004G224350--Sobic001G183900 Sobic004G224350--Sobic002G032033 Sobic003G090100 Sobic003G090100 Sobic004G224350--Sobic003G090100 Sobic005G207900 Sobic005G207900 Sobic004G224350--Sobic005G207900 Sobic004G224350--Sobic005G216866 Sobic004G224350--Sobic004G246950 Sobic004G224350--Sobic003G072100 Sobic004G224350--Sobic001G018700 Sobic001G183900--Sobic003G072100 Sobic001G183900--Sobic004G246950 Sobic001G183900--Sobic002G032033 Sobic001G183900--Sobic001G018700 Sobic007G104201 Sobic007G104201 Sobic001G167701--Sobic007G104201 Sobic001G167701--Sobic001G183900 Sobic001G167701--Sobic002G032033 Sobic001G167701--Sobic005G216866 Sobic001G167701--Sobic004G246950 Sobic001G167701--Sobic004G224350 Sobic001G167701--Sobic003G072100 Sobic002G397001 Sobic002G397001 Sobic001G167701--Sobic002G397001 Sobic007G146800 Sobic007G146800 Sobic001G167701--Sobic007G146800 Sobic009G248700 Sobic009G248700 Sobic005G167600--Sobic009G248700 Sobic005G167600--Sobic001G183900 Sobic005G167600--Sobic002G032033 Sobic001G273600 Sobic001G273600 Sobic005G167600--Sobic001G273600 Sobic003G434500 Sobic003G434500 Sobic005G167600--Sobic003G434500 Sobic005G167600--Sobic004G246950 Sobic005G167600--Sobic003G072100 Sobic005G167600--Sobic005G216866 Sobic005G167600--Sobic004G224350
Octagon: transcription factors


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