Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G166100.1,Sobic.001G166100.9,Sobic.001G166100.5,Sobic.001G166100.4,Sobic.001G166100.8,Sobic.001G166100.10,Sobic.001G166100.7,Sobic.001G166100.6
Synonym
Functional annotation B3 DNA binding domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6QJB7 , A0A1Z5S604 , A0A1Z5S5Y7
Pfam PF02362
Panther DB PTHR31391 PTHR31391:SF8
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003677; DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G33280 : AP2/B3-like transcriptional factor family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g42230.1 : B3 DNA binding domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a007398
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G405200 transcription factor like protein, putative, expressed -
2 Sobic.002G251050 - -
3 Sobic.003G407950 - -
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11 Sobic.003G013950 - -
12 Sobic.004G138600 - -
13 Sobic.005G196000 transporter family protein, putative, expressed -
14 Sobic.006G159200 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
15 Sobic.001G463600 - -
16 Sobic.001G499800 expansin precursor, putative, expressed -
17 Sobic.001G405450 - -
18 Sobic.001G366300 telomerase reverse transcriptase, putative, expressed K11126: TERT, telomerase reverse transcriptase
19 Sobic.004G198350 - -
20 Sobic.003G243900 sphingolipid C4-hydroxylase SUR2, putative, expressed K04713: sphinganine C4-monooxygenase


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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