Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G499800.1
Synonym ATHEXPALPHA1.14, ATEXP11, EXP11, ATEXPA11, EXPA11
Functional annotation expansin precursor, putative, expressed
UniProt A0A1Z5SBA9
Pfam PF03330 PF01357
Panther DB PTHR31867
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G20190 : expansin 11
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g06020.1 : expansin precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a000709 , Zm00025a043994 , Zm00025a040298 , Zm00025a040299 , Zm00025a006808 , Zm00025a053441
Brachypodium KQJ81960 , KQJ96856 , KQK23579 , KQK10365 , KQK05753 , KQK23581
Barley HORVU1Hr1G069830.2 , HORVU1Hr1G069830.1 , HORVU1Hr1G069830.7 , HORVU1Hr1G069830.6 , HORVU1Hr1G069830.4 , HORVU3Hr1G081180.4 , HORVU3Hr1G081180.3 , HORVU3Hr1G081180.2 , HORVU3Hr1G081180.1 , HORVU3Hr1G081230.9 , HORVU3Hr1G081230.8 , HORVU3Hr1G081230.5 , HORVU3Hr1G081230.3 , HORVU3Hr1G081230.2 , HORVU3Hr1G075210.1 , HORVU3Hr1G075210.2 , HORVU4Hr1G072400.1
Wheat TraesCS3D02G338400 , TraesCS5D02G494800 , TraesCS5A02G481200 , TraesCS4B02G271100 , TraesCS3B02G376800 , TraesCS1D02G299700 , TraesCS1B02G156700 , TraesCS1A02G300200 , TraesCS1A02G300200 , TraesCS4B02G271000 , TraesCS1B02G310300 , TraesCS4D02G270100 , TraesCS3A02G344800 , TraesCS4D02G270200 , TraesCS5B02G494400 , TraesCS3B02G376900 , TraesCS3D02G338600
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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18 Sobic.001G320000 OsSub61 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
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20 Sobic.006G076100 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G499800 Sobic001G499800 Sobic001G495550 Sobic001G495550 Sobic001G499800--Sobic001G495550 Sobic008G112550 Sobic008G112550 Sobic001G499800--Sobic008G112550 Sobic003G344950 Sobic003G344950 Sobic001G499800--Sobic003G344950 Sobic001G366600 Sobic001G366600 Sobic001G499800--Sobic001G366600 Sobic001G170301 Sobic001G170301 Sobic001G499800--Sobic001G170301 Sobic001G519100 Sobic001G519100 Sobic001G499800--Sobic001G519100 Sobic001G166100 Sobic001G166100 Sobic001G499800--Sobic001G166100 Sobic010G184400 Sobic010G184400 Sobic001G499800--Sobic010G184400 Sobic009G121150 Sobic009G121150 Sobic001G499800--Sobic009G121150 Sobic002G028901 Sobic002G028901 Sobic001G495550--Sobic002G028901 Sobic003G333300 Sobic003G333300 Sobic001G495550--Sobic003G333300 Sobic001G495550--Sobic001G499800 Sobic009G064700 Sobic009G064700 Sobic001G495550--Sobic009G064700 Sobic001G495550--Sobic010G184400 Sobic001G495550--Sobic003G344950 Sobic005G035400 Sobic005G035400 Sobic001G495550--Sobic005G035400 Sobic001G495550--Sobic008G112550 Sobic003G098650 Sobic003G098650 Sobic001G495550--Sobic003G098650 Sobic001G144900 Sobic001G144900 Sobic008G112550--Sobic001G144900 Sobic009G026850 Sobic009G026850 Sobic008G112550--Sobic009G026850 Sobic005G167650 Sobic005G167650 Sobic008G112550--Sobic005G167650 Sobic001G497700 Sobic001G497700 Sobic008G112550--Sobic001G497700 Sobic009G104600 Sobic009G104600 Sobic008G112550--Sobic009G104600 Sobic008G112550--Sobic001G499800 Sobic002G383500 Sobic002G383500 Sobic008G112550--Sobic002G383500 Sobic003G300250 Sobic003G300250 Sobic008G112550--Sobic003G300250 Sobic006G219950 Sobic006G219950 Sobic008G112550--Sobic006G219950 Sobic003G344950--Sobic005G035400 Sobic003G344950--Sobic003G333300 Sobic003G344950--Sobic002G028901 Sobic001G369401 Sobic001G369401 Sobic003G344950--Sobic001G369401 Sobic004G147300 Sobic004G147300 Sobic003G344950--Sobic004G147300 Sobic006G037050 Sobic006G037050 Sobic003G344950--Sobic006G037050 Sobic003G344950--Sobic001G499800 Sobic003G344950--Sobic009G121150 Sobic005G230800 Sobic005G230800 Sobic003G344950--Sobic005G230800 Sobic001G366600--Sobic001G499800 Sobic005G165850 Sobic005G165850 Sobic001G366600--Sobic005G165850 Sobic010G082400 Sobic010G082400 Sobic001G366600--Sobic010G082400 Sobic006G076100 Sobic006G076100 Sobic001G366600--Sobic006G076100 Sobic001G366300 Sobic001G366300 Sobic001G366600--Sobic001G366300 Sobic002G055800 Sobic002G055800 Sobic001G366600--Sobic002G055800 Sobic007G076600 Sobic007G076600 Sobic001G366600--Sobic007G076600 Sobic001G320000 Sobic001G320000 Sobic001G366600--Sobic001G320000 Sobic010G111450 Sobic010G111450 Sobic001G366600--Sobic010G111450 Sobic001G170301--Sobic001G499800 Sobic003G247000 Sobic003G247000 Sobic001G170301--Sobic003G247000 Sobic010G213000 Sobic010G213000 Sobic001G170301--Sobic010G213000 Sobic001G170301--Sobic001G320000 Sobic001G170301--Sobic001G366600 Sobic002G221450 Sobic002G221450 Sobic001G170301--Sobic002G221450 Sobic002G051900 Sobic002G051900 Sobic001G170301--Sobic002G051900 Sobic009G222400 Sobic009G222400 Sobic001G170301--Sobic009G222400 Sobic007G023500 Sobic007G023500 Sobic001G170301--Sobic007G023500 Sobic001G519100--Sobic010G213000 Sobic001G519100--Sobic001G499800 Sobic007G097100 Sobic007G097100 Sobic001G519100--Sobic007G097100 Sobic001G519100--Sobic008G112550 Sobic001G061400 Sobic001G061400 Sobic001G519100--Sobic001G061400 Sobic001G519100--Sobic009G026850 Sobic001G519100--Sobic001G320000 Sobic004G142400 Sobic004G142400 Sobic001G519100--Sobic004G142400 Sobic001G519100--Sobic001G166100 Sobic001G405200 Sobic001G405200 Sobic001G166100--Sobic001G405200 Sobic002G251050 Sobic002G251050 Sobic001G166100--Sobic002G251050 Sobic003G407950 Sobic003G407950 Sobic001G166100--Sobic003G407950 Sobic001G166100--Sobic010G111450 Sobic002G040201 Sobic002G040201 Sobic001G166100--Sobic002G040201 Sobic001G166100--Sobic009G121150 Sobic006G029250 Sobic006G029250 Sobic001G166100--Sobic006G029250 Sobic009G034250 Sobic009G034250 Sobic001G166100--Sobic009G034250 Sobic001G166100--Sobic006G076100 Sobic005G196000 Sobic005G196000 Sobic010G184400--Sobic005G196000 Sobic010G184400--Sobic003G333300 Sobic010G184400--Sobic001G495550 Sobic010G184400--Sobic003G344950 Sobic010G184400--Sobic001G499800 Sobic010G184400--Sobic002G028901 Sobic010G184400--Sobic002G251050 Sobic010G184400--Sobic005G035400 Sobic010G184400--Sobic005G230800 Sobic009G121150--Sobic006G029250 Sobic009G121150--Sobic001G405200 Sobic009G121150--Sobic009G034250 Sobic009G121150--Sobic003G407950 Sobic004G198350 Sobic004G198350 Sobic009G121150--Sobic004G198350 Sobic009G121150--Sobic001G166100 Sobic009G121150--Sobic002G251050 Sobic009G013850 Sobic009G013850 Sobic009G121150--Sobic009G013850 Sobic007G082700 Sobic007G082700 Sobic009G121150--Sobic007G082700
Octagon: transcription factors


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