Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G219950.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RG09
Pfam PF12442
Panther DB PTHR33530 PTHR33530:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g53080.1 : hypothetical protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G112550 - -
2 Sobic.003G333300 no apical meristem protein, putative, expressed -
3 Sobic.004G329600 SMP-30/Gluconolaconase/LRE-like region containing protein, expressed -
4 Sobic.010G111450 - -
5 Sobic.002G251050 - -
6 Sobic.009G121150 - -
7 Sobic.001G166100 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
8 Sobic.003G344950 - -
9 Sobic.002G040201 - -
10 Sobic.003G013950 - -
11 Sobic.006G076100 - -
12 Sobic.001G499800 expansin precursor, putative, expressed -
13 Sobic.002G221450 - -
14 Sobic.001G495550 - -
15 Sobic.009G187150 - -
16 Sobic.003G407950 - -
17 Sobic.004G138600 - -
18 Sobic.006G029250 - -
19 Sobic.001G094100 - -
20 Sobic.010G160500 - K13179: DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18/HAS1


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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