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Transcriptome id Sobic.002G221450.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W5F7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G108700 - -
2 Sobic.010G111450 - -
3 Sobic.008G112550 - -
4 Sobic.002G040201 - -
5 Sobic.006G076100 - -
6 Sobic.003G013950 - -
7 Sobic.002G394466 - -
8 Sobic.001G499800 expansin precursor, putative, expressed -
9 Sobic.001G463600 - -
10 Sobic.001G366300 telomerase reverse transcriptase, putative, expressed K11126: TERT, telomerase reverse transcriptase
11 Sobic.001G166100 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
12 Sobic.002G251050 - -
13 Sobic.010G256100 LTPL154 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
14 Sobic.010G110100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@"A transcription factor(Ortholog in rice:Huang et al., 2012)"(PubMedID : 31659933)@transcription factor, putative, expressed K14431: transcription factor TGA
15 Sobic.001G170301 - -
16 Sobic.004G138600 - -
17 Sobic.005G054900 acyl-CoA synthetase protein, putative, expressed K01897: ACSL, long-chain acyl-CoA synthetase
18 Sobic.006G219950 - -
19 Sobic.003G407950 - -
20 Sobic.010G184400 SMP-30/Gluconolaconase/LRE-like region containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G221450 Sobic002G221450 Sobic004G108700 Sobic004G108700 Sobic002G221450--Sobic004G108700 Sobic010G111450 Sobic010G111450 Sobic002G221450--Sobic010G111450 Sobic008G112550 Sobic008G112550 Sobic002G221450--Sobic008G112550 Sobic002G040201 Sobic002G040201 Sobic002G221450--Sobic002G040201 Sobic006G076100 Sobic006G076100 Sobic002G221450--Sobic006G076100 Sobic003G013950 Sobic003G013950 Sobic002G221450--Sobic003G013950 Sobic002G394466 Sobic002G394466 Sobic002G221450--Sobic002G394466 Sobic001G499800 Sobic001G499800 Sobic002G221450--Sobic001G499800 Sobic001G463600 Sobic001G463600 Sobic002G221450--Sobic001G463600 Sobic004G108700--Sobic002G221450 Sobic008G126400 Sobic008G126400 Sobic004G108700--Sobic008G126400 Sobic001G405200 Sobic001G405200 Sobic004G108700--Sobic001G405200 Sobic003G407950 Sobic003G407950 Sobic004G108700--Sobic003G407950 Sobic001G166100 Sobic001G166100 Sobic004G108700--Sobic001G166100 Sobic004G108700--Sobic010G111450 Sobic003G331750 Sobic003G331750 Sobic004G108700--Sobic003G331750 Sobic002G251050 Sobic002G251050 Sobic004G108700--Sobic002G251050 Sobic004G108700--Sobic002G040201 Sobic010G111450--Sobic002G040201 Sobic010G111450--Sobic003G013950 Sobic010G111450--Sobic006G076100 Sobic010G111450--Sobic002G394466 Sobic010G111450--Sobic001G463600 Sobic010G111450--Sobic002G251050 Sobic001G366300 Sobic001G366300 Sobic010G111450--Sobic001G366300 Sobic004G138600 Sobic004G138600 Sobic010G111450--Sobic004G138600 Sobic003G243900 Sobic003G243900 Sobic010G111450--Sobic003G243900 Sobic001G144900 Sobic001G144900 Sobic008G112550--Sobic001G144900 Sobic009G026850 Sobic009G026850 Sobic008G112550--Sobic009G026850 Sobic005G167650 Sobic005G167650 Sobic008G112550--Sobic005G167650 Sobic001G497700 Sobic001G497700 Sobic008G112550--Sobic001G497700 Sobic009G104600 Sobic009G104600 Sobic008G112550--Sobic009G104600 Sobic008G112550--Sobic001G499800 Sobic002G383500 Sobic002G383500 Sobic008G112550--Sobic002G383500 Sobic003G300250 Sobic003G300250 Sobic008G112550--Sobic003G300250 Sobic006G219950 Sobic006G219950 Sobic008G112550--Sobic006G219950 Sobic002G040201--Sobic003G013950 Sobic002G040201--Sobic010G111450 Sobic002G040201--Sobic001G463600 Sobic002G040201--Sobic002G394466 Sobic002G040201--Sobic003G243900 Sobic002G040201--Sobic001G366300 Sobic002G040201--Sobic006G076100 Sobic009G230000 Sobic009G230000 Sobic002G040201--Sobic009G230000 Sobic002G040201--Sobic004G138600 Sobic006G076100--Sobic010G111450 Sobic006G076100--Sobic002G040201 Sobic006G076100--Sobic003G013950 Sobic006G076100--Sobic002G251050 Sobic006G076100--Sobic001G463600 Sobic006G076100--Sobic002G394466 Sobic006G076100--Sobic004G138600 Sobic006G076100--Sobic003G407950 Sobic009G187150 Sobic009G187150 Sobic006G076100--Sobic009G187150 Sobic003G013950--Sobic002G040201 Sobic003G013950--Sobic010G111450 Sobic010G121401 Sobic010G121401 Sobic003G013950--Sobic010G121401 Sobic003G013950--Sobic006G076100 Sobic003G013950--Sobic001G366300 Sobic003G013950--Sobic002G394466 Sobic003G013950--Sobic001G463600 Sobic003G013950--Sobic002G251050 Sobic004G091401 Sobic004G091401 Sobic003G013950--Sobic004G091401 Sobic002G394466--Sobic001G463600 Sobic002G394466--Sobic002G040201 Sobic004G349550 Sobic004G349550 Sobic002G394466--Sobic004G349550 Sobic002G394466--Sobic001G366300 Sobic008G149300 Sobic008G149300 Sobic002G394466--Sobic008G149300 Sobic001G122600 Sobic001G122600 Sobic002G394466--Sobic001G122600 Sobic001G495550 Sobic001G495550 Sobic001G499800--Sobic001G495550 Sobic001G499800--Sobic008G112550 Sobic003G344950 Sobic003G344950 Sobic001G499800--Sobic003G344950 Sobic001G366600 Sobic001G366600 Sobic001G499800--Sobic001G366600 Sobic001G170301 Sobic001G170301 Sobic001G499800--Sobic001G170301 Sobic001G519100 Sobic001G519100 Sobic001G499800--Sobic001G519100 Sobic001G499800--Sobic001G166100 Sobic010G184400 Sobic010G184400 Sobic001G499800--Sobic010G184400 Sobic009G121150 Sobic009G121150 Sobic001G499800--Sobic009G121150 Sobic001G463600--Sobic002G394466 Sobic001G463600--Sobic002G040201 Sobic001G463600--Sobic003G243900 Sobic001G463600--Sobic001G366300 Sobic001G463600--Sobic010G111450 Sobic003G372600 Sobic003G372600 Sobic001G463600--Sobic003G372600 Sobic001G208500 Sobic001G208500 Sobic001G463600--Sobic001G208500 Sobic001G463600--Sobic004G349550 Sobic002G211300 Sobic002G211300 Sobic001G463600--Sobic002G211300
Octagon: transcription factors


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