Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G138700.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PLX1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Barley -
Wheat -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G017300 - -
2 Sobic.006G077100 serine/threonine-protein kinase receptor precursor, putative, expressed -
3 Sobic.009G258700 SCP-like extracellular protein, expressed -
4 Sobic.002G069232 - -
5 Sobic.009G239000 OsMADS78 - MADS-box family gene with M-alpha type-box, expressed -
6 Sobic.008G116900 OsFBL38 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
7 Sobic.004G133800 expressed protein -
8 Sobic.001G359601 - -
9 Sobic.009G237900 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.006G077900 cysteine synthase, putative, expressed K01738: cysteine synthase
11 Sobic.001G493600 vesicle-associated membrane protein, putative, expressed -
12 Sobic.010G172666 - -
13 Sobic.004G286351 - -
14 Sobic.002G221500 ANTH domain containing protein, expressed -
15 Sobic.004G303150 - -
16 Sobic.010G062600 - -
17 Sobic.002G349800 ubiquitin-like protein SMT3, putative, expressed K12160: SUMO, small ubiquitin-related modifier
18 Sobic.010G111700 - -
19 Sobic.007G035100 cyclin, putative, expressed K05868: G2/mitotic-specific cyclin-B1
20 Sobic.004G274000 STE_MEK_ste7_MAP2K.4 - STE kinases include homologs to sterile 7, sterile 11 and sterile 20 from yeast, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G138700 Sobic006G138700 Sobic009G017300 Sobic009G017300 Sobic006G138700--Sobic009G017300 Sobic006G077100 Sobic006G077100 Sobic006G138700--Sobic006G077100 Sobic009G258700 Sobic009G258700 Sobic006G138700--Sobic009G258700 Sobic002G069232 Sobic002G069232 Sobic006G138700--Sobic002G069232 Sobic009G239000 Sobic009G239000 Sobic006G138700--Sobic009G239000 Sobic008G116900 Sobic008G116900 Sobic006G138700--Sobic008G116900 Sobic004G133800 Sobic004G133800 Sobic006G138700--Sobic004G133800 Sobic001G359601 Sobic001G359601 Sobic006G138700--Sobic001G359601 Sobic009G237900 Sobic009G237900 Sobic006G138700--Sobic009G237900 Sobic009G017300--Sobic006G138700 Sobic009G017300--Sobic009G239000 Sobic007G139800 Sobic007G139800 Sobic009G017300--Sobic007G139800 Sobic009G017300--Sobic008G116900 Sobic009G017300--Sobic002G069232 Sobic009G017300--Sobic001G359601 Sobic004G303150 Sobic004G303150 Sobic009G017300--Sobic004G303150 Sobic010G172666 Sobic010G172666 Sobic009G017300--Sobic010G172666 Sobic001G493600 Sobic001G493600 Sobic009G017300--Sobic001G493600 Sobic006G077900 Sobic006G077900 Sobic006G077100--Sobic006G077900 Sobic006G077100--Sobic009G239000 Sobic006G077100--Sobic006G138700 Sobic006G077100--Sobic002G069232 Sobic006G077100--Sobic008G116900 Sobic004G274000 Sobic004G274000 Sobic006G077100--Sobic004G274000 Sobic010G111700 Sobic010G111700 Sobic006G077100--Sobic010G111700 Sobic004G286351 Sobic004G286351 Sobic006G077100--Sobic004G286351 Sobic007G035100 Sobic007G035100 Sobic006G077100--Sobic007G035100 Sobic009G258700--Sobic006G138700 Sobic002G221500 Sobic002G221500 Sobic009G258700--Sobic002G221500 Sobic009G258700--Sobic002G069232 Sobic009G258700--Sobic006G077100 Sobic009G258700--Sobic009G237900 Sobic009G258700--Sobic004G133800 Sobic009G258700--Sobic008G116900 Sobic009G258700--Sobic009G239000 Sobic002G349800 Sobic002G349800 Sobic009G258700--Sobic002G349800 Sobic002G069232--Sobic004G133800 Sobic002G069232--Sobic008G116900 Sobic002G069232--Sobic009G239000 Sobic002G069232--Sobic004G303150 Sobic002G069232--Sobic010G172666 Sobic002G069232--Sobic001G493600 Sobic002G005500 Sobic002G005500 Sobic002G069232--Sobic002G005500 Sobic001G263801 Sobic001G263801 Sobic002G069232--Sobic001G263801 Sobic007G025350 Sobic007G025350 Sobic002G069232--Sobic007G025350 Sobic009G239000--Sobic010G172666 Sobic009G239000--Sobic001G493600 Sobic009G239000--Sobic004G303150 Sobic009G239000--Sobic008G116900 Sobic009G239000--Sobic002G069232 Sobic009G239000--Sobic004G286351 Sobic009G053001 Sobic009G053001 Sobic009G239000--Sobic009G053001 Sobic009G239000--Sobic004G133800 Sobic007G069450 Sobic007G069450 Sobic009G239000--Sobic007G069450 Sobic008G116900--Sobic002G069232 Sobic008G116900--Sobic009G239000 Sobic008G116900--Sobic004G133800 Sobic008G116900--Sobic004G303150 Sobic008G116900--Sobic010G172666 Sobic008G116900--Sobic001G493600 Sobic008G116900--Sobic002G005500 Sobic008G116900--Sobic001G263801 Sobic008G116900--Sobic007G025350 Sobic004G133800--Sobic002G069232 Sobic004G133800--Sobic008G116900 Sobic004G133800--Sobic002G005500 Sobic010G201100 Sobic010G201100 Sobic004G133800--Sobic010G201100 Sobic007G119101 Sobic007G119101 Sobic004G133800--Sobic007G119101 Sobic004G133800--Sobic001G263801 Sobic004G133800--Sobic007G025350 Sobic002G031301 Sobic002G031301 Sobic004G133800--Sobic002G031301 Sobic009G111700 Sobic009G111700 Sobic004G133800--Sobic009G111700 Sobic001G359601--Sobic001G263801 Sobic001G359601--Sobic007G025350 Sobic001G359601--Sobic002G005500 Sobic001G359601--Sobic010G201100 Sobic001G359601--Sobic009G111700 Sobic001G359601--Sobic007G119101 Sobic001G359601--Sobic004G133800 Sobic001G359601--Sobic002G031301 Sobic003G226950 Sobic003G226950 Sobic001G359601--Sobic003G226950 Sobic010G032200 Sobic010G032200 Sobic009G237900--Sobic010G032200 Sobic009G237900--Sobic007G119101 Sobic009G237900--Sobic004G133800 Sobic009G237900--Sobic002G031301 Sobic005G072850 Sobic005G072850 Sobic009G237900--Sobic005G072850 Sobic010G015100 Sobic010G015100 Sobic009G237900--Sobic010G015100 Sobic009G237900--Sobic010G201100 Sobic009G237900--Sobic001G359601 Sobic009G237900--Sobic009G111700
Octagon: transcription factors


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