Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G200100.1
Synonym Sb06g027210
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RER6
Pfam PF05056
Panther DB PTHR33103 PTHR33103:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G09140 : Protein of unknown function (DUF674)
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g50800.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a009979 , Zm00025a056611
Brachypodium -
Barley HORVU2Hr1G114950.1
Wheat TraesCS2B02G547700
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G134600 thaumatin, putative, expressed -
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8 Sobic.010G169500 - -
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11 Sobic.004G135600 - -
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14 Sobic.003G063801 - -
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16 Sobic.004G080350 - -
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18 Sobic.006G176300 OsSub44 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
19 Sobic.002G291000 - -
20 Sobic.006G142365 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G200100 Sobic006G200100 Sobic006G134600 Sobic006G134600 Sobic006G200100--Sobic006G134600 Sobic005G089800 Sobic005G089800 Sobic006G200100--Sobic005G089800 Sobic001G398150 Sobic001G398150 Sobic006G200100--Sobic001G398150 Sobic004G102500 Sobic004G102500 Sobic006G200100--Sobic004G102500 Sobic010G115450 Sobic010G115450 Sobic006G200100--Sobic010G115450 Sobic010G062700 Sobic010G062700 Sobic006G200100--Sobic010G062700 Sobic007G176400 Sobic007G176400 Sobic006G200100--Sobic007G176400 Sobic010G169500 Sobic010G169500 Sobic006G200100--Sobic010G169500 Sobic005G162100 Sobic005G162100 Sobic006G200100--Sobic005G162100 Sobic006G134600--Sobic001G398150 Sobic006G134600--Sobic006G200100 Sobic006G134600--Sobic005G089800 Sobic006G134600--Sobic004G102500 Sobic006G134600--Sobic010G062700 Sobic006G134600--Sobic010G115450 Sobic010G142132 Sobic010G142132 Sobic006G134600--Sobic010G142132 Sobic005G067000 Sobic005G067000 Sobic006G134600--Sobic005G067000 Sobic006G134600--Sobic007G176400 Sobic005G089800--Sobic006G134600 Sobic005G089800--Sobic006G200100 Sobic005G089800--Sobic001G398150 Sobic005G089800--Sobic004G102500 Sobic005G089800--Sobic010G115450 Sobic005G089800--Sobic010G062700 Sobic005G089800--Sobic007G176400 Sobic005G089800--Sobic010G142132 Sobic005G089800--Sobic005G067000 Sobic001G398150--Sobic006G134600 Sobic001G398150--Sobic010G062700 Sobic001G398150--Sobic006G200100 Sobic001G398150--Sobic005G089800 Sobic001G398150--Sobic010G142132 Sobic001G398150--Sobic005G067000 Sobic001G398150--Sobic010G115450 Sobic006G176300 Sobic006G176300 Sobic001G398150--Sobic006G176300 Sobic007G221300 Sobic007G221300 Sobic001G398150--Sobic007G221300 Sobic004G102500--Sobic006G200100 Sobic004G102500--Sobic006G134600 Sobic004G135600 Sobic004G135600 Sobic004G102500--Sobic004G135600 Sobic004G102500--Sobic005G089800 Sobic004G102500--Sobic005G162100 Sobic004G102500--Sobic001G398150 Sobic004G102500--Sobic010G169500 Sobic004G102500--Sobic007G176400 Sobic004G102500--Sobic010G062700 Sobic010G115450--Sobic001G398150 Sobic010G115450--Sobic006G134600 Sobic010G115450--Sobic005G089800 Sobic010G115450--Sobic006G200100 Sobic010G115450--Sobic010G062700 Sobic010G115450--Sobic005G067000 Sobic010G115450--Sobic010G142132 Sobic002G291000 Sobic002G291000 Sobic010G115450--Sobic002G291000 Sobic010G115450--Sobic006G176300 Sobic010G062700--Sobic001G398150 Sobic010G062700--Sobic010G142132 Sobic010G062700--Sobic006G176300 Sobic010G062700--Sobic005G067000 Sobic010G062700--Sobic006G134600 Sobic010G062700--Sobic007G221300 Sobic005G207900 Sobic005G207900 Sobic010G062700--Sobic005G207900 Sobic009G128901 Sobic009G128901 Sobic010G062700--Sobic009G128901 Sobic005G193900 Sobic005G193900 Sobic010G062700--Sobic005G193900 Sobic007G176400--Sobic004G102500 Sobic007G176400--Sobic006G134600 Sobic007G176400--Sobic006G200100 Sobic007G176400--Sobic001G398150 Sobic007G176400--Sobic005G089800 Sobic007G176400--Sobic010G062700 Sobic007G176400--Sobic010G115450 Sobic004G121500 Sobic004G121500 Sobic007G176400--Sobic004G121500 Sobic007G176400--Sobic010G142132 Sobic010G169500--Sobic004G102500 Sobic010G169500--Sobic005G162100 Sobic010G169500--Sobic004G135600 Sobic010G079200 Sobic010G079200 Sobic010G169500--Sobic010G079200 Sobic010G169500--Sobic006G200100 Sobic005G211801 Sobic005G211801 Sobic010G169500--Sobic005G211801 Sobic010G169500--Sobic006G134600 Sobic010G169500--Sobic005G089800 Sobic002G018000 Sobic002G018000 Sobic010G169500--Sobic002G018000 Sobic002G354300 Sobic002G354300 Sobic005G162100--Sobic002G354300 Sobic005G162100--Sobic004G135600 Sobic005G162100--Sobic004G102500 Sobic005G162100--Sobic010G169500 Sobic009G244800 Sobic009G244800 Sobic005G162100--Sobic009G244800 Sobic009G116000 Sobic009G116000 Sobic005G162100--Sobic009G116000 Sobic007G083200 Sobic007G083200 Sobic005G162100--Sobic007G083200 Sobic009G169050 Sobic009G169050 Sobic005G162100--Sobic009G169050 Sobic005G162100--Sobic006G200100
Octagon: transcription factors


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