Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G176400.1
Synonym Sb07g024820
Functional annotation STIGL2 - Stigma-specific Stig1 family protein precursor, putative, expressed
UniProt C5YH23
Pfam PF04885
Panther DB PTHR33227 PTHR33227:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G11925 : Stigma-specific Stig1 family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g18860.1 : STIGL2 - Stigma-specific Stig1 family protein precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a005673
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G102500 BES1/BZR1 homolog protein, putative, expressed -
2 Sobic.006G134600 thaumatin, putative, expressed -
3 Sobic.006G200100 expressed protein -
4 Sobic.001G398150 - -
5 Sobic.005G089800 OsFBL33 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
6 Sobic.010G062700 LTPL29 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
7 Sobic.010G115450 - -
8 Sobic.004G121500 expansin precursor, putative, expressed -
9 Sobic.010G142132 - -
10 Sobic.004G135600 - -
11 Sobic.005G067000 OsWAK91 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
12 Sobic.010G116650 - -
13 Sobic.001G328850 - -
14 Sobic.002G417101 - -
15 Sobic.002G175000 ras-related protein, putative, expressed K07976: Rab family, other
16 Sobic.010G169500 - -
17 Sobic.002G064100 DNA-binding storekeeper protein-related, putative, expressed -
18 Sobic.007G181801 - -
19 Sobic.003G063801 - -
20 Sobic.003G095301 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G176400 Sobic007G176400 Sobic004G102500 Sobic004G102500 Sobic007G176400--Sobic004G102500 Sobic006G134600 Sobic006G134600 Sobic007G176400--Sobic006G134600 Sobic006G200100 Sobic006G200100 Sobic007G176400--Sobic006G200100 Sobic001G398150 Sobic001G398150 Sobic007G176400--Sobic001G398150 Sobic005G089800 Sobic005G089800 Sobic007G176400--Sobic005G089800 Sobic010G062700 Sobic010G062700 Sobic007G176400--Sobic010G062700 Sobic010G115450 Sobic010G115450 Sobic007G176400--Sobic010G115450 Sobic004G121500 Sobic004G121500 Sobic007G176400--Sobic004G121500 Sobic010G142132 Sobic010G142132 Sobic007G176400--Sobic010G142132 Sobic004G102500--Sobic006G200100 Sobic004G102500--Sobic006G134600 Sobic004G135600 Sobic004G135600 Sobic004G102500--Sobic004G135600 Sobic004G102500--Sobic005G089800 Sobic005G162100 Sobic005G162100 Sobic004G102500--Sobic005G162100 Sobic004G102500--Sobic001G398150 Sobic010G169500 Sobic010G169500 Sobic004G102500--Sobic010G169500 Sobic004G102500--Sobic007G176400 Sobic004G102500--Sobic010G062700 Sobic006G134600--Sobic001G398150 Sobic006G134600--Sobic006G200100 Sobic006G134600--Sobic005G089800 Sobic006G134600--Sobic004G102500 Sobic006G134600--Sobic010G062700 Sobic006G134600--Sobic010G115450 Sobic006G134600--Sobic010G142132 Sobic005G067000 Sobic005G067000 Sobic006G134600--Sobic005G067000 Sobic006G134600--Sobic007G176400 Sobic006G200100--Sobic006G134600 Sobic006G200100--Sobic005G089800 Sobic006G200100--Sobic001G398150 Sobic006G200100--Sobic004G102500 Sobic006G200100--Sobic010G115450 Sobic006G200100--Sobic010G062700 Sobic006G200100--Sobic007G176400 Sobic006G200100--Sobic010G169500 Sobic006G200100--Sobic005G162100 Sobic001G398150--Sobic006G134600 Sobic001G398150--Sobic010G062700 Sobic001G398150--Sobic006G200100 Sobic001G398150--Sobic005G089800 Sobic001G398150--Sobic010G142132 Sobic001G398150--Sobic005G067000 Sobic001G398150--Sobic010G115450 Sobic006G176300 Sobic006G176300 Sobic001G398150--Sobic006G176300 Sobic007G221300 Sobic007G221300 Sobic001G398150--Sobic007G221300 Sobic005G089800--Sobic006G134600 Sobic005G089800--Sobic006G200100 Sobic005G089800--Sobic001G398150 Sobic005G089800--Sobic004G102500 Sobic005G089800--Sobic010G115450 Sobic005G089800--Sobic010G062700 Sobic005G089800--Sobic007G176400 Sobic005G089800--Sobic010G142132 Sobic005G089800--Sobic005G067000 Sobic010G062700--Sobic001G398150 Sobic010G062700--Sobic010G142132 Sobic010G062700--Sobic006G176300 Sobic010G062700--Sobic005G067000 Sobic010G062700--Sobic006G134600 Sobic010G062700--Sobic007G221300 Sobic005G207900 Sobic005G207900 Sobic010G062700--Sobic005G207900 Sobic009G128901 Sobic009G128901 Sobic010G062700--Sobic009G128901 Sobic005G193900 Sobic005G193900 Sobic010G062700--Sobic005G193900 Sobic010G115450--Sobic001G398150 Sobic010G115450--Sobic006G134600 Sobic010G115450--Sobic005G089800 Sobic010G115450--Sobic006G200100 Sobic010G115450--Sobic010G062700 Sobic010G115450--Sobic005G067000 Sobic010G115450--Sobic010G142132 Sobic002G291000 Sobic002G291000 Sobic010G115450--Sobic002G291000 Sobic010G115450--Sobic006G176300 Sobic002G417101 Sobic002G417101 Sobic004G121500--Sobic002G417101 Sobic005G062300 Sobic005G062300 Sobic004G121500--Sobic005G062300 Sobic005G077666 Sobic005G077666 Sobic004G121500--Sobic005G077666 Sobic003G095301 Sobic003G095301 Sobic004G121500--Sobic003G095301 Sobic001G328850 Sobic001G328850 Sobic004G121500--Sobic001G328850 Sobic007G181801 Sobic007G181801 Sobic004G121500--Sobic007G181801 Sobic004G123801 Sobic004G123801 Sobic004G121500--Sobic004G123801 Sobic002G175000 Sobic002G175000 Sobic004G121500--Sobic002G175000 Sobic009G219601 Sobic009G219601 Sobic004G121500--Sobic009G219601 Sobic010G142132--Sobic007G221300 Sobic010G142132--Sobic006G176300 Sobic009G067700 Sobic009G067700 Sobic010G142132--Sobic009G067700 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic010G142132--Sobic001G018700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.