Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G229700.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PNH2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G358301 - -
2 Sobic.002G153900 ZOS9-02 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
3 Sobic.008G103500 OsMADS20 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed -
4 Sobic.002G397650 - -
5 Sobic.004G102000 expressed protein K13172: SRRM2, serine/arginine repetitive matrix protein 2
6 Sobic.006G109600 - -
7 Sobic.006G026300 expressed protein -
8 Sobic.008G170700 - -
9 Sobic.005G031901 - -
10 Sobic.010G147300 CAF1 family ribonuclease containing protein, putative, expressed K12581: CNOT7_8, CAF1, CCR4-NOT transcription complex subunit 7/8
11 Sobic.002G100100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
12 Sobic.003G126750 - -
13 Sobic.008G020900 disease resistance protein RPM1, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
14 Sobic.001G261464 - -
15 Sobic.003G017000 - -
16 Sobic.002G026150 - -
17 Sobic.004G243700 - -
18 Sobic.002G175700 STE_MEK_ste7_MAP2K.3 - STE kinases include homologs to sterile 7, sterile 11 and sterile 20 from yeast, expressed K04368: MAP2K1, mitogen-activated protein kinase kinase 1
19 Sobic.002G384600 expressed protein -
20 Sobic.005G048100 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G229700 Sobic006G229700 Sobic004G358301 Sobic004G358301 Sobic006G229700--Sobic004G358301 Sobic002G153900 Sobic002G153900 Sobic006G229700--Sobic002G153900 Sobic008G103500 Sobic008G103500 Sobic006G229700--Sobic008G103500 Sobic002G397650 Sobic002G397650 Sobic006G229700--Sobic002G397650 Sobic004G102000 Sobic004G102000 Sobic006G229700--Sobic004G102000 Sobic006G109600 Sobic006G109600 Sobic006G229700--Sobic006G109600 Sobic006G026300 Sobic006G026300 Sobic006G229700--Sobic006G026300 Sobic008G170700 Sobic008G170700 Sobic006G229700--Sobic008G170700 Sobic005G031901 Sobic005G031901 Sobic006G229700--Sobic005G031901 Sobic004G358301--Sobic005G031901 Sobic010G147300 Sobic010G147300 Sobic004G358301--Sobic010G147300 Sobic003G126750 Sobic003G126750 Sobic004G358301--Sobic003G126750 Sobic004G358301--Sobic006G109600 Sobic001G261464 Sobic001G261464 Sobic004G358301--Sobic001G261464 Sobic002G100100 Sobic002G100100 Sobic004G358301--Sobic002G100100 Sobic002G026150 Sobic002G026150 Sobic004G358301--Sobic002G026150 Sobic004G358301--Sobic002G153900 Sobic004G243700 Sobic004G243700 Sobic004G358301--Sobic004G243700 Sobic002G153900--Sobic003G126750 Sobic004G358200 Sobic004G358200 Sobic002G153900--Sobic004G358200 Sobic002G153900--Sobic001G261464 Sobic002G153900--Sobic002G026150 Sobic002G153900--Sobic006G026300 Sobic002G153900--Sobic006G109600 Sobic002G153900--Sobic005G031901 Sobic002G153900--Sobic004G358301 Sobic002G153900--Sobic002G100100 Sobic003G145800 Sobic003G145800 Sobic008G103500--Sobic003G145800 Sobic008G014000 Sobic008G014000 Sobic008G103500--Sobic008G014000 Sobic008G103500--Sobic006G229700 Sobic004G065600 Sobic004G065600 Sobic008G103500--Sobic004G065600 Sobic008G103500--Sobic004G358301 Sobic005G170800 Sobic005G170800 Sobic008G103500--Sobic005G170800 Sobic010G120000 Sobic010G120000 Sobic008G103500--Sobic010G120000 Sobic007G048400 Sobic007G048400 Sobic008G103500--Sobic007G048400 Sobic008G103500--Sobic005G031901 Sobic002G397650--Sobic006G109600 Sobic003G017000 Sobic003G017000 Sobic002G397650--Sobic003G017000 Sobic002G175700 Sobic002G175700 Sobic002G397650--Sobic002G175700 Sobic002G397650--Sobic005G031901 Sobic002G397650--Sobic003G126750 Sobic002G397650--Sobic010G147300 Sobic002G397650--Sobic001G261464 Sobic002G397650--Sobic002G100100 Sobic002G397650--Sobic002G026150 Sobic010G224300 Sobic010G224300 Sobic004G102000--Sobic010G224300 Sobic009G083400 Sobic009G083400 Sobic004G102000--Sobic009G083400 Sobic008G106000 Sobic008G106000 Sobic004G102000--Sobic008G106000 Sobic006G251900 Sobic006G251900 Sobic004G102000--Sobic006G251900 Sobic001G473000 Sobic001G473000 Sobic004G102000--Sobic001G473000 Sobic001G174900 Sobic001G174900 Sobic004G102000--Sobic001G174900 Sobic004G094500 Sobic004G094500 Sobic004G102000--Sobic004G094500 Sobic007G043500 Sobic007G043500 Sobic004G102000--Sobic007G043500 Sobic007G143300 Sobic007G143300 Sobic004G102000--Sobic007G143300 Sobic006G109600--Sobic003G126750 Sobic006G109600--Sobic005G031901 Sobic006G109600--Sobic010G147300 Sobic006G109600--Sobic001G261464 Sobic006G109600--Sobic002G100100 Sobic006G109600--Sobic002G026150 Sobic006G109600--Sobic002G175700 Sobic006G109600--Sobic004G358301 Sobic006G109600--Sobic004G243700 Sobic006G026300--Sobic002G100100 Sobic006G026300--Sobic001G261464 Sobic006G026300--Sobic002G153900 Sobic006G026300--Sobic004G243700 Sobic006G026300--Sobic005G031901 Sobic006G026300--Sobic004G358200 Sobic006G026300--Sobic003G126750 Sobic006G026300--Sobic006G109600 Sobic006G026300--Sobic010G147300 Sobic007G064000 Sobic007G064000 Sobic008G170700--Sobic007G064000 Sobic008G170700--Sobic004G358301 Sobic007G007600 Sobic007G007600 Sobic008G170700--Sobic007G007600 Sobic008G170700--Sobic002G175700 Sobic003G281700 Sobic003G281700 Sobic008G170700--Sobic003G281700 Sobic008G170700--Sobic010G147300 Sobic008G170700--Sobic002G026150 Sobic008G170700--Sobic005G031901 Sobic002G036500 Sobic002G036500 Sobic008G170700--Sobic002G036500 Sobic005G031901--Sobic010G147300 Sobic005G031901--Sobic006G109600 Sobic005G031901--Sobic003G126750 Sobic005G031901--Sobic001G261464 Sobic005G031901--Sobic004G358301 Sobic005G031901--Sobic002G100100 Sobic005G031901--Sobic002G026150 Sobic005G031901--Sobic002G175700 Sobic005G031901--Sobic007G064000
Octagon: transcription factors


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