Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G103500.1,Sobic.008G103500.2
Synonym FUL, AGL8
Functional annotation OsMADS20 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed
UniProt A0A1B6PCV5 , A0A1B6PCQ5
Pfam PF00319 PF01486 PF01486
Panther DB PTHR11945 PTHR11945:SF155
NCBI CDD KOG0014; MADS box transcription factor
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003677; DNA binding GO:0006355regulation of transcription, DNA-templated GO:0005634nucleus GO:0003700DNA-binding transcription factor activity GO:0006355regulation of transcription, DNA-templated GO:0005634nucleus GO:0003700DNA-binding transcription factor activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G60910 : AGAMOUS-like 8
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g31748.2 : OsMADS20 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a054199
Brachypodium KQK01785 , PNT76212
Barley HORVU7Hr1G036130.23 , HORVU7Hr1G036130.22 , HORVU7Hr1G036130.21 , HORVU7Hr1G036130.20 , HORVU7Hr1G036130.27 , HORVU7Hr1G036130.26 , HORVU7Hr1G036130.25 , HORVU7Hr1G036130.24 , HORVU7Hr1G036130.1 , HORVU7Hr1G036130.8 , HORVU7Hr1G036130.9
Wheat TraesCS7A02G175200 , TraesCS7A02G175200 , TraesCS7D02G176700 , TraesCS7B02G080300 , TraesCS7B02G080300
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.001G261464 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G103500 Sobic008G103500 Sobic003G145800 Sobic003G145800 Sobic008G103500--Sobic003G145800 Sobic008G014000 Sobic008G014000 Sobic008G103500--Sobic008G014000 Sobic006G229700 Sobic006G229700 Sobic008G103500--Sobic006G229700 Sobic004G065600 Sobic004G065600 Sobic008G103500--Sobic004G065600 Sobic004G358301 Sobic004G358301 Sobic008G103500--Sobic004G358301 Sobic005G170800 Sobic005G170800 Sobic008G103500--Sobic005G170800 Sobic010G120000 Sobic010G120000 Sobic008G103500--Sobic010G120000 Sobic007G048400 Sobic007G048400 Sobic008G103500--Sobic007G048400 Sobic005G031901 Sobic005G031901 Sobic008G103500--Sobic005G031901 Sobic007G090460 Sobic007G090460 Sobic003G145800--Sobic007G090460 Sobic009G052800 Sobic009G052800 Sobic003G145800--Sobic009G052800 Sobic010G135100 Sobic010G135100 Sobic003G145800--Sobic010G135100 Sobic005G110406 Sobic005G110406 Sobic003G145800--Sobic005G110406 Sobic001G194000 Sobic001G194000 Sobic003G145800--Sobic001G194000 Sobic001G258600 Sobic001G258600 Sobic003G145800--Sobic001G258600 Sobic005G180500 Sobic005G180500 Sobic003G145800--Sobic005G180500 Sobic006G277500 Sobic006G277500 Sobic003G145800--Sobic006G277500 Sobic003G194200 Sobic003G194200 Sobic003G145800--Sobic003G194200 Sobic007G074800 Sobic007G074800 Sobic008G014000--Sobic007G074800 Sobic005G094600 Sobic005G094600 Sobic008G014000--Sobic005G094600 Sobic002G322600 Sobic002G322600 Sobic008G014000--Sobic002G322600 Sobic008G014000--Sobic007G048400 Sobic008G014000--Sobic004G065600 Sobic008G014000--Sobic008G103500 Sobic004G243700 Sobic004G243700 Sobic008G014000--Sobic004G243700 Sobic008G014000--Sobic003G145800 Sobic008G005100 Sobic008G005100 Sobic008G014000--Sobic008G005100 Sobic006G229700--Sobic004G358301 Sobic002G153900 Sobic002G153900 Sobic006G229700--Sobic002G153900 Sobic006G229700--Sobic008G103500 Sobic002G397650 Sobic002G397650 Sobic006G229700--Sobic002G397650 Sobic004G102000 Sobic004G102000 Sobic006G229700--Sobic004G102000 Sobic006G109600 Sobic006G109600 Sobic006G229700--Sobic006G109600 Sobic006G026300 Sobic006G026300 Sobic006G229700--Sobic006G026300 Sobic008G170700 Sobic008G170700 Sobic006G229700--Sobic008G170700 Sobic006G229700--Sobic005G031901 Sobic004G065600--Sobic002G322600 Sobic007G064000 Sobic007G064000 Sobic004G065600--Sobic007G064000 Sobic007G221201 Sobic007G221201 Sobic004G065600--Sobic007G221201 Sobic008G079733 Sobic008G079733 Sobic004G065600--Sobic008G079733 Sobic008G139250 Sobic008G139250 Sobic004G065600--Sobic008G139250 Sobic010G147300 Sobic010G147300 Sobic004G065600--Sobic010G147300 Sobic004G358200 Sobic004G358200 Sobic004G065600--Sobic004G358200 Sobic003G126750 Sobic003G126750 Sobic004G065600--Sobic003G126750 Sobic004G065600--Sobic005G031901 Sobic004G358301--Sobic005G031901 Sobic004G358301--Sobic010G147300 Sobic004G358301--Sobic003G126750 Sobic004G358301--Sobic006G109600 Sobic001G261464 Sobic001G261464 Sobic004G358301--Sobic001G261464 Sobic002G100100 Sobic002G100100 Sobic004G358301--Sobic002G100100 Sobic002G026150 Sobic002G026150 Sobic004G358301--Sobic002G026150 Sobic004G358301--Sobic002G153900 Sobic004G358301--Sobic004G243700 Sobic005G085100 Sobic005G085100 Sobic005G170800--Sobic005G085100 Sobic005G221550 Sobic005G221550 Sobic005G170800--Sobic005G221550 Sobic005G148400 Sobic005G148400 Sobic005G170800--Sobic005G148400 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic005G170800--Sobic005G142200 Sobic003G436900 Sobic003G436900 Sobic005G170800--Sobic003G436900 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic005G170800--Sobic008G045600 Sobic005G148500 Sobic005G148500 Sobic005G170800--Sobic005G148500 Sobic006G190800 Sobic006G190800 Sobic005G170800--Sobic006G190800 Sobic010G144000 Sobic010G144000 Sobic005G170800--Sobic010G144000 Sobic003G328800 Sobic003G328800 Sobic010G120000--Sobic003G328800 Sobic004G154600 Sobic004G154600 Sobic010G120000--Sobic004G154600 Sobic007G147901 Sobic007G147901 Sobic010G120000--Sobic007G147901 Sobic008G136000 Sobic008G136000 Sobic010G120000--Sobic008G136000 Sobic004G195700 Sobic004G195700 Sobic010G120000--Sobic004G195700 Sobic006G149101 Sobic006G149101 Sobic010G120000--Sobic006G149101 Sobic001G179000 Sobic001G179000 Sobic010G120000--Sobic001G179000 Sobic003G356200 Sobic003G356200 Sobic010G120000--Sobic003G356200 Sobic002G316500 Sobic002G316500 Sobic010G120000--Sobic002G316500 Sobic007G048400--Sobic001G261464 Sobic007G048400--Sobic004G243700 Sobic007G048400--Sobic003G126750 Sobic007G048400--Sobic002G100100 Sobic007G048400--Sobic005G031901 Sobic007G048400--Sobic006G109600 Sobic007G048400--Sobic010G147300 Sobic007G048400--Sobic004G358301 Sobic002G175700 Sobic002G175700 Sobic007G048400--Sobic002G175700 Sobic005G031901--Sobic010G147300 Sobic005G031901--Sobic006G109600 Sobic005G031901--Sobic003G126750 Sobic005G031901--Sobic001G261464 Sobic005G031901--Sobic004G358301 Sobic005G031901--Sobic002G100100 Sobic005G031901--Sobic002G026150 Sobic005G031901--Sobic002G175700 Sobic005G031901--Sobic007G064000
Octagon: transcription factors


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