Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G120000.1
Synonym Sb10g010570
Functional annotation embryogenesis transmembrane protein, putative, expressed
UniProt C5Z8Y0
Pfam PF13962
Panther DB PTHR24177 PTHR24177:SF53
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G11000 : Ankyrin repeat family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g17700.1 : embryogenesis transmembrane protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a050501
Brachypodium KQK18773 , PNT76062
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G328800 tubulin/FtsZ domain containing protein, putative, expressed K07375: tubulin beta
2 Sobic.004G154600 expressed protein -
3 Sobic.007G147901 - -
4 Sobic.008G136000 DnaK family protein, putative, expressed K03283: heat shock 70kDa protein 1/2/6/8
5 Sobic.004G195700 heavy metal associated domain containing protein, expressed -
6 Sobic.006G149101 - -
7 Sobic.001G179000 DNA-directed RNA polymerase subunit, putative, expressed K03014: RPB6, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2
8 Sobic.003G356200 homeodomain protein, putative, expressed -
9 Sobic.002G316500 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed -
10 Sobic.008G020900 disease resistance protein RPM1, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
11 Sobic.010G193400 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
12 Sobic.005G172300 OsFBDUF60 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
13 Sobic.004G298400 WRKY36, expressed -
14 Sobic.003G380500 expressed protein -
15 Sobic.004G099100 expressed protein -
16 Sobic.002G221700 microtubule associated protein, putative, expressed K16732: protein regulator of cytokinesis 1
17 Sobic.010G208500 - -
18 Sobic.005G148500 OsFBX402 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.008G106800 isoflavone reductase, putative, expressed -
20 Sobic.010G046400 glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G120000 Sobic010G120000 Sobic003G328800 Sobic003G328800 Sobic010G120000--Sobic003G328800 Sobic004G154600 Sobic004G154600 Sobic010G120000--Sobic004G154600 Sobic007G147901 Sobic007G147901 Sobic010G120000--Sobic007G147901 Sobic008G136000 Sobic008G136000 Sobic010G120000--Sobic008G136000 Sobic004G195700 Sobic004G195700 Sobic010G120000--Sobic004G195700 Sobic006G149101 Sobic006G149101 Sobic010G120000--Sobic006G149101 Sobic001G179000 Sobic001G179000 Sobic010G120000--Sobic001G179000 Sobic003G356200 Sobic003G356200 Sobic010G120000--Sobic003G356200 Sobic002G316500 Sobic002G316500 Sobic010G120000--Sobic002G316500 Sobic006G213100 Sobic006G213100 Sobic003G328800--Sobic006G213100 Sobic005G012000 Sobic005G012000 Sobic003G328800--Sobic005G012000 Sobic004G164650 Sobic004G164650 Sobic003G328800--Sobic004G164650 Sobic003G397300 Sobic003G397300 Sobic003G328800--Sobic003G397300 Sobic008G126200 Sobic008G126200 Sobic003G328800--Sobic008G126200 Sobic003G380500 Sobic003G380500 Sobic003G328800--Sobic003G380500 Sobic001G082300 Sobic001G082300 Sobic003G328800--Sobic001G082300 Sobic003G328800--Sobic008G136000 Sobic003G044900 Sobic003G044900 Sobic003G328800--Sobic003G044900 Sobic009G259500 Sobic009G259500 Sobic004G154600--Sobic009G259500 Sobic004G205500 Sobic004G205500 Sobic004G154600--Sobic004G205500 Sobic004G259101 Sobic004G259101 Sobic004G154600--Sobic004G259101 Sobic007G210900 Sobic007G210900 Sobic004G154600--Sobic007G210900 Sobic004G199700 Sobic004G199700 Sobic004G154600--Sobic004G199700 Sobic002G072700 Sobic002G072700 Sobic004G154600--Sobic002G072700 Sobic003G174900 Sobic003G174900 Sobic004G154600--Sobic003G174900 Sobic002G367300 Sobic002G367300 Sobic004G154600--Sobic002G367300 Sobic006G262600 Sobic006G262600 Sobic004G154600--Sobic006G262600 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic007G147901--Sobic001G305400 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic007G147901--Sobic002G221200 Sobic005G054600 Sobic005G054600 Sobic007G147901--Sobic005G054600 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic007G147901--Sobic005G142200 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic007G147901--Sobic008G045600 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic007G147901--Sobic002G060500 Sobic008G036500 Sobic008G036500 Sobic007G147901--Sobic008G036500 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic007G147901--Sobic004G121000 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic007G147901--Sobic008G091900 Sobic001G428400 Sobic001G428400 Sobic008G136000--Sobic001G428400 Sobic002G270300 Sobic002G270300 Sobic008G136000--Sobic002G270300 Sobic003G024800 Sobic003G024800 Sobic008G136000--Sobic003G024800 Sobic008G136000--Sobic003G328800 Sobic004G349100 Sobic004G349100 Sobic008G136000--Sobic004G349100 Sobic004G077000 Sobic004G077000 Sobic008G136000--Sobic004G077000 Sobic001G512600 Sobic001G512600 Sobic008G136000--Sobic001G512600 Sobic001G420700 Sobic001G420700 Sobic008G136000--Sobic001G420700 Sobic010G163900 Sobic010G163900 Sobic008G136000--Sobic010G163900 Sobic005G054300 Sobic005G054300 Sobic004G195700--Sobic005G054300 Sobic005G212600 Sobic005G212600 Sobic004G195700--Sobic005G212600 Sobic004G195700--Sobic005G054600 Sobic008G108900 Sobic008G108900 Sobic004G195700--Sobic008G108900 Sobic004G195700--Sobic004G164650 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic004G195700--Sobic002G062300 Sobic004G195700--Sobic005G012000 Sobic001G271000 Sobic001G271000 Sobic004G195700--Sobic001G271000 Sobic007G115000 Sobic007G115000 Sobic004G195700--Sobic007G115000 Sobic006G149101--Sobic001G179000 Sobic006G149101--Sobic006G213100 Sobic006G149101--Sobic003G380500 Sobic007G191100 Sobic007G191100 Sobic006G149101--Sobic007G191100 Sobic007G195400 Sobic007G195400 Sobic006G149101--Sobic007G195400 Sobic006G149101--Sobic004G349100 Sobic006G149101--Sobic006G262600 Sobic010G118700 Sobic010G118700 Sobic006G149101--Sobic010G118700 Sobic006G149101--Sobic003G328800 Sobic007G224900 Sobic007G224900 Sobic001G179000--Sobic007G224900 Sobic001G179000--Sobic003G380500 Sobic001G179000--Sobic006G149101 Sobic001G179000--Sobic007G195400 Sobic001G179000--Sobic004G349100 Sobic009G183500 Sobic009G183500 Sobic001G179000--Sobic009G183500 Sobic003G074000 Sobic003G074000 Sobic001G179000--Sobic003G074000 Sobic002G221900 Sobic002G221900 Sobic001G179000--Sobic002G221900 Sobic007G023700 Sobic007G023700 Sobic001G179000--Sobic007G023700 Sobic009G164900 Sobic009G164900 Sobic003G356200--Sobic009G164900 Sobic001G350501 Sobic001G350501 Sobic003G356200--Sobic001G350501 Sobic002G348000 Sobic002G348000 Sobic003G356200--Sobic002G348000 Sobic007G063200 Sobic007G063200 Sobic003G356200--Sobic007G063200 Sobic003G026300 Sobic003G026300 Sobic003G356200--Sobic003G026300 Sobic003G356200--Sobic003G380500 Sobic003G346000 Sobic003G346000 Sobic003G356200--Sobic003G346000 Sobic006G109300 Sobic006G109300 Sobic003G356200--Sobic006G109300 Sobic004G229100 Sobic004G229100 Sobic003G356200--Sobic004G229100 Sobic004G227500 Sobic004G227500 Sobic002G316500--Sobic004G227500 Sobic009G013100 Sobic009G013100 Sobic002G316500--Sobic009G013100 Sobic010G229000 Sobic010G229000 Sobic002G316500--Sobic010G229000 Sobic008G099500 Sobic008G099500 Sobic002G316500--Sobic008G099500 Sobic005G127300 Sobic005G127300 Sobic002G316500--Sobic005G127300 Sobic010G046400 Sobic010G046400 Sobic002G316500--Sobic010G046400 Sobic008G000800 Sobic008G000800 Sobic002G316500--Sobic008G000800 Sobic002G316500--Sobic007G195400 Sobic007G130300 Sobic007G130300 Sobic002G316500--Sobic007G130300
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.