Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G221700.1
Synonym ATMAP65-6, MAP65-6, Sb02g026260
Functional annotation microtubule associated protein, putative, expressed
UniProt C5X272
Pfam PF03999
Panther DB PTHR19321 PTHR19321:SF5
NCBI CDD KOG4302; Microtubule-associated protein essential for anaphase spindle elongation
KEGG Orthology K16732; protein regulator of cytokinesis 1
Gene Ontology GO:0008017; microtubule binding GO:0000910cytokinesis GO:0000226microtubule cytoskeleton organization


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G14690 : microtubule-associated protein 65-7
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g27700.2 : microtubule associated protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a047222
Brachypodium KQJ90473
Barley -
Wheat TraesCS5D02G240800 , TraesCS5B02G232400 , TraesCS5A02G233900 , TraesCS5A02G233900
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G221700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic002G221700 Sobic002G221700 Sobic004G164600 Sobic004G164600 Sobic002G221700--Sobic004G164600 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic002G221700--Sobic008G042250 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic002G221700--Sobic001G253100 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic002G221700--Sobic005G110430 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic002G221700--Sobic004G076732 Sobic008G009500 Sobic008G009500 Sobic002G221700--Sobic008G009500 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic002G221700--Sobic007G073400 Sobic008G157950 Sobic008G157950 Sobic002G221700--Sobic008G157950 Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic002G221700--Sobic004G212800 Sobic004G164600--Sobic004G212800 Sobic004G164600--Sobic005G110430 Sobic004G164600--Sobic007G073400 Sobic004G164600--Sobic008G042250 Sobic004G164600--Sobic008G157950 Sobic001G345333 Sobic001G345333 Sobic004G164600--Sobic001G345333 Sobic002G007250 Sobic002G007250 Sobic004G164600--Sobic002G007250 SobicK009900 SobicK009900 Sobic004G164600--SobicK009900 Sobic004G164600--Sobic004G076732 Sobic008G042250--Sobic005G110430 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic008G042250--Sobic008G049701 Sobic001G287301 Sobic001G287301 Sobic008G042250--Sobic001G287301 Sobic008G042250--Sobic001G253100 Sobic008G042250--Sobic008G157950 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic008G042250--Sobic009G209800 Sobic008G042250--SobicK009900 Sobic005G117801 Sobic005G117801 Sobic008G042250--Sobic005G117801 Sobic008G042250--Sobic004G164600 Sobic001G253100--Sobic005G117801 Sobic001G253100--Sobic009G209800 Sobic001G253100--Sobic005G110430 Sobic001G253100--Sobic008G042250 Sobic001G253100--Sobic004G076732 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic001G253100--Sobic001G240400 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic001G253100--Sobic008G091900 Sobic001G253100--Sobic008G049701 Sobic001G253100--SobicK009900 Sobic005G110430--Sobic008G042250 Sobic005G110430--Sobic008G049701 Sobic005G110430--Sobic001G253100 Sobic005G110430--Sobic008G157950 Sobic005G110430--SobicK009900 Sobic005G110430--Sobic001G287301 Sobic005G110430--Sobic004G164600 Sobic005G110430--Sobic005G117801 Sobic005G110430--Sobic009G209800 Sobic004G076732--SobicK009900 Sobic002G410200 Sobic002G410200 Sobic004G076732--Sobic002G410200 Sobic004G076732--Sobic001G253100 Sobic004G076732--Sobic008G009500 Sobic004G076732--Sobic007G073400 Sobic004G076732--Sobic009G209800 Sobic004G076732--Sobic008G042250 Sobic004G076732--Sobic005G110430 Sobic004G076732--Sobic004G212800 SobicK024000 SobicK024000 Sobic008G009500--SobicK024000 Sobic008G009500--Sobic004G076732 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic008G009500--Sobic002G062300 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic008G009500--Sobic009G113600 Sobic008G009500--Sobic001G253100 Sobic008G009500--Sobic007G073400 Sobic008G009500--Sobic009G209800 Sobic008G031350 Sobic008G031350 Sobic008G009500--Sobic008G031350 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic008G009500--Sobic005G221425 Sobic007G073400--Sobic004G212800 Sobic007G073400--Sobic004G164600 Sobic007G073400--Sobic004G076732 Sobic007G073400--Sobic008G009500 Sobic007G073400--Sobic009G113600 Sobic007G073400--Sobic008G031350 Sobic007G073400--Sobic008G042250 Sobic007G073400--Sobic005G110430 Sobic004G143700 Sobic004G143700 Sobic007G073400--Sobic004G143700 Sobic008G157950--Sobic008G042250 Sobic008G157950--Sobic005G110430 Sobic008G157950--Sobic004G164600 Sobic008G157950--Sobic008G049701 Sobic008G157950--Sobic001G287301 Sobic003G036950 Sobic003G036950 Sobic008G157950--Sobic003G036950 Sobic008G157950--Sobic002G007250 Sobic008G157950--Sobic001G253100 Sobic008G157950--Sobic004G212800 Sobic004G212800--Sobic007G073400 Sobic004G212800--Sobic004G164600 Sobic001G024200 Sobic001G024200 Sobic004G212800--Sobic001G024200 Sobic004G212800--Sobic001G345333 Sobic004G212800--Sobic002G007250 Sobic010G248200 Sobic010G248200 Sobic004G212800--Sobic010G248200 Sobic004G212800--Sobic004G076732 Sobic008G161401 Sobic008G161401 Sobic004G212800--Sobic008G161401 Sobic004G112500 Sobic004G112500 Sobic004G212800--Sobic004G112500
Octagon: transcription factors


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