Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G193400.1
Synonym Sb10g024300
Functional annotation GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed
UniProt C5Z664
Pfam PF00657
Panther DB PTHR22835 PTHR22835:SF137
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016788; hydrolase activity, acting on ester bonds


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G71250 : GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g50940.1 : GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a018523 , Zm00025a018521 , Zm00025a018524 , Zm00025a046297
Brachypodium PNT68369 , KQJ98868 , KQK01994
Barley HORVU6Hr1G076730.3 , HORVU6Hr1G076730.2 , HORVU6Hr1G076730.1 , HORVU6Hr1G076730.6 , HORVU6Hr1G076730.5 , HORVU6Hr1G076730.4 , HORVU6Hr1G076740.2
Wheat TraesCS6D02G290600 , TraesCS6A02G311100
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G318900 expressed protein -
2 Sobic.002G047100 - -
3 Sobic.002G382950 - -
4 Sobic.008G049000 diacylglycerol O-acyltransferase, putative, expressed -
5 Sobic.003G036950 - -
6 Sobic.010G160100 - -
7 Sobic.006G132200 CHIT3 - Chitinase family protein precursor, expressed K01183: chitinase
8 Sobic.007G066050 - -
9 Sobic.008G091900 - -
10 Sobic.001G132500 - -
11 Sobic.005G212600 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
12 Sobic.008G126200 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@calmodulin binding protein, putative, expressed -
13 Sobic.008G108900 GRF zinc finger family protein, expressed -
14 Sobic.010G114600 expressed protein -
15 Sobic.010G144000 AP-3 complex subunit delta, putative, expressed K12396: AP-3 complex subunit delta
16 Sobic.003G436900 OsFBX178 - F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.003G038000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Lipase class 3 family protein (At)(PubMedID : 27208977)@phospholipase, putative, expressed -
18 Sobic.007G115000 - -
19 Sobic.010G123500 B-box (BBX) protein(PubMedID : 30626335)@SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@CCT/B-box zinc finger protein, putative, expressed -
20 Sobic.003G107400 3-beta-hydroxysteroid-Delta-isomerase, putative, expressed K01824: cholestenol Delta-isomerase


Gene co-expression network
sample Sobic010G193400 Sobic010G193400 Sobic002G318900 Sobic002G318900 Sobic010G193400--Sobic002G318900 Sobic002G047100 Sobic002G047100 Sobic010G193400--Sobic002G047100 Sobic002G382950 Sobic002G382950 Sobic010G193400--Sobic002G382950 Sobic008G049000 Sobic008G049000 Sobic010G193400--Sobic008G049000 Sobic003G036950 Sobic003G036950 Sobic010G193400--Sobic003G036950 Sobic010G160100 Sobic010G160100 Sobic010G193400--Sobic010G160100 Sobic006G132200 Sobic006G132200 Sobic010G193400--Sobic006G132200 Sobic007G066050 Sobic007G066050 Sobic010G193400--Sobic007G066050 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic010G193400--Sobic008G091900 Sobic002G318900--Sobic010G193400 Sobic002G318900--Sobic006G132200 Sobic002G318900--Sobic008G049000 Sobic002G318900--Sobic007G066050 Sobic008G108900 Sobic008G108900 Sobic002G318900--Sobic008G108900 Sobic002G318900--Sobic002G047100 Sobic002G318900--Sobic008G091900 Sobic002G094500 Sobic002G094500 Sobic002G318900--Sobic002G094500 Sobic009G196700 Sobic009G196700 Sobic002G318900--Sobic009G196700 Sobic002G047100--Sobic008G049000 Sobic001G132500 Sobic001G132500 Sobic002G047100--Sobic001G132500 Sobic002G047100--Sobic006G132200 Sobic003G038000 Sobic003G038000 Sobic002G047100--Sobic003G038000 Sobic002G047100--Sobic007G066050 Sobic003G219000 Sobic003G219000 Sobic002G047100--Sobic003G219000 Sobic002G047100--Sobic002G318900 Sobic008G167100 Sobic008G167100 Sobic002G047100--Sobic008G167100 Sobic002G047100--Sobic008G091900 Sobic002G383000 Sobic002G383000 Sobic002G382950--Sobic002G383000 Sobic009G011901 Sobic009G011901 Sobic002G382950--Sobic009G011901 Sobic002G382950--Sobic010G193400 Sobic009G012000 Sobic009G012000 Sobic002G382950--Sobic009G012000 Sobic003G107400 Sobic003G107400 Sobic002G382950--Sobic003G107400 Sobic006G074400 Sobic006G074400 Sobic002G382950--Sobic006G074400 Sobic001G515500 Sobic001G515500 Sobic002G382950--Sobic001G515500 Sobic008G106800 Sobic008G106800 Sobic002G382950--Sobic008G106800 Sobic005G047800 Sobic005G047800 Sobic002G382950--Sobic005G047800 Sobic008G049000--Sobic003G219000 Sobic008G049000--Sobic006G132200 Sobic008G049000--Sobic008G108900 Sobic001G164200 Sobic001G164200 Sobic008G049000--Sobic001G164200 Sobic008G049000--Sobic002G047100 Sobic008G049000--Sobic009G196700 Sobic008G013900 Sobic008G013900 Sobic008G049000--Sobic008G013900 Sobic008G049000--Sobic002G094500 Sobic008G049000--Sobic007G066050 Sobic008G157950 Sobic008G157950 Sobic003G036950--Sobic008G157950 Sobic004G164600 Sobic004G164600 Sobic003G036950--Sobic004G164600 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic003G036950--Sobic005G110430 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic003G036950--Sobic008G042250 Sobic002G221700 Sobic002G221700 Sobic003G036950--Sobic002G221700 Sobic001G345333 Sobic001G345333 Sobic003G036950--Sobic001G345333 Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic003G036950--Sobic004G212800 Sobic002G007250 Sobic002G007250 Sobic003G036950--Sobic002G007250 Sobic004G112500 Sobic004G112500 Sobic003G036950--Sobic004G112500 Sobic007G115000 Sobic007G115000 Sobic010G160100--Sobic007G115000 Sobic010G160100--Sobic008G108900 Sobic010G160100--Sobic008G049000 Sobic010G160100--Sobic006G132200 Sobic010G160100--Sobic002G047100 Sobic005G212600 Sobic005G212600 Sobic010G160100--Sobic005G212600 Sobic003G031750 Sobic003G031750 Sobic010G160100--Sobic003G031750 Sobic010G160100--Sobic008G091900 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic010G160100--Sobic002G221200 Sobic006G132200--Sobic008G108900 Sobic006G132200--Sobic009G196700 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic006G132200--Sobic002G062300 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic006G132200--Sobic009G113600 Sobic006G132200--Sobic005G212600 Sobic007G059300 Sobic007G059300 Sobic006G132200--Sobic007G059300 Sobic006G132200--Sobic003G031750 Sobic006G132200--Sobic008G091900 Sobic008G031350 Sobic008G031350 Sobic006G132200--Sobic008G031350 Sobic007G066050--Sobic006G132200 Sobic007G066050--Sobic009G196700 Sobic007G066050--Sobic008G108900 Sobic007G066050--Sobic008G049000 Sobic007G066050--Sobic003G031750 Sobic007G066050--Sobic007G059300 Sobic003G176100 Sobic003G176100 Sobic007G066050--Sobic003G176100 Sobic007G066050--Sobic009G113600 Sobic007G066050--Sobic002G062300 Sobic005G117801 Sobic005G117801 Sobic008G091900--Sobic005G117801 Sobic008G091900--Sobic002G221200 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic008G091900--Sobic001G253100 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic008G091900--Sobic001G305400 Sobic008G091900--Sobic003G031750 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic008G091900--Sobic001G240400 Sobic008G091900--Sobic002G062300 Sobic008G091900--Sobic005G110430 Sobic008G091900--Sobic005G212600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.