Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G038000.1
Synonym PLA-I{gamma}1, Sb03g003410,
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
Lipase class 3 family protein (At) (PubMedID : 27208977)
phospholipase, putative, expressed
UniProt C5XMK3
Pfam PF01764
Panther DB PTHR31403 PTHR31403:SF7
NCBI CDD KOG4569; Predicted lipase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006629; lipid metabolic process


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G06800 : alpha/beta-Hydrolases superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g32380.1 : phospholipase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a041590 , Zm00025a023124
Brachypodium -
Barley HORVU3Hr1G035880.1 , HORVU3Hr1G110320.4 , HORVU3Hr1G110320.5 , HORVU3Hr1G110320.2 , HORVU3Hr1G110320.3 , HORVU3Hr1G110320.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G047100 - -
2 Sobic.006G132200 CHIT3 - Chitinase family protein precursor, expressed K01183: chitinase
3 Sobic.010G208500 - -
4 Sobic.007G066050 - -
5 Sobic.009G197200 - -
6 Sobic.001G132500 - -
7 Sobic.002G318900 expressed protein -
8 Sobic.004G240900 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expressed in leaf, flower and stem, expression induced by IAA and BR treatments"(PubMedID : 20528920)@auxin efflux carrier component, putative, expressed K13947: auxin efflux carrier family protein
9 Sobic.003G424100 sulfotransferase domain containing protein, expressed -
10 Sobic.008G091900 - -
11 Sobic.008G068400 - -
12 Sobic.003G029300 lachrymatory factor synthase, putative, expressed -
13 Sobic.008G108900 GRF zinc finger family protein, expressed -
14 Sobic.008G049000 diacylglycerol O-acyltransferase, putative, expressed -
15 Sobic.002G316000 expressed protein -
16 Sobic.007G115000 - -
17 Sobic.003G031750 - -
18 Sobic.009G196700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@cytochrome P450, putative, expressed -
19 Sobic.001G046600 cycloartenol-C-24-methyltransferase 1, putative, expressed -
20 Sobic.004G154600 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic003G038000 Sobic003G038000 Sobic002G047100 Sobic002G047100 Sobic003G038000--Sobic002G047100 Sobic006G132200 Sobic006G132200 Sobic003G038000--Sobic006G132200 Sobic010G208500 Sobic010G208500 Sobic003G038000--Sobic010G208500 Sobic007G066050 Sobic007G066050 Sobic003G038000--Sobic007G066050 Sobic009G197200 Sobic009G197200 Sobic003G038000--Sobic009G197200 Sobic001G132500 Sobic001G132500 Sobic003G038000--Sobic001G132500 Sobic002G318900 Sobic002G318900 Sobic003G038000--Sobic002G318900 Sobic004G240900 Sobic004G240900 Sobic003G038000--Sobic004G240900 Sobic003G424100 Sobic003G424100 Sobic003G038000--Sobic003G424100 Sobic008G049000 Sobic008G049000 Sobic002G047100--Sobic008G049000 Sobic002G047100--Sobic001G132500 Sobic002G047100--Sobic006G132200 Sobic002G047100--Sobic003G038000 Sobic002G047100--Sobic007G066050 Sobic003G219000 Sobic003G219000 Sobic002G047100--Sobic003G219000 Sobic002G047100--Sobic002G318900 Sobic008G167100 Sobic008G167100 Sobic002G047100--Sobic008G167100 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic002G047100--Sobic008G091900 Sobic008G108900 Sobic008G108900 Sobic006G132200--Sobic008G108900 Sobic009G196700 Sobic009G196700 Sobic006G132200--Sobic009G196700 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic006G132200--Sobic002G062300 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic006G132200--Sobic009G113600 Sobic005G212600 Sobic005G212600 Sobic006G132200--Sobic005G212600 Sobic007G059300 Sobic007G059300 Sobic006G132200--Sobic007G059300 Sobic003G031750 Sobic003G031750 Sobic006G132200--Sobic003G031750 Sobic006G132200--Sobic008G091900 Sobic008G031350 Sobic008G031350 Sobic006G132200--Sobic008G031350 Sobic010G208500--Sobic006G132200 Sobic010G208500--Sobic008G108900 Sobic010G208500--Sobic003G424100 Sobic010G208500--Sobic002G062300 Sobic010G208500--Sobic005G212600 Sobic009G109101 Sobic009G109101 Sobic010G208500--Sobic009G109101 Sobic010G208500--Sobic009G196700 Sobic010G208500--Sobic009G113600 Sobic007G115000 Sobic007G115000 Sobic010G208500--Sobic007G115000 Sobic007G066050--Sobic006G132200 Sobic007G066050--Sobic009G196700 Sobic007G066050--Sobic008G108900 Sobic007G066050--Sobic008G049000 Sobic007G066050--Sobic003G031750 Sobic007G066050--Sobic007G059300 Sobic003G176100 Sobic003G176100 Sobic007G066050--Sobic003G176100 Sobic007G066050--Sobic009G113600 Sobic007G066050--Sobic002G062300 Sobic004G291800 Sobic004G291800 Sobic009G197200--Sobic004G291800 Sobic004G020401 Sobic004G020401 Sobic009G197200--Sobic004G020401 Sobic009G110366 Sobic009G110366 Sobic009G197200--Sobic009G110366 Sobic009G109450 Sobic009G109450 Sobic009G197200--Sobic009G109450 Sobic008G068400 Sobic008G068400 Sobic009G197200--Sobic008G068400 Sobic006G273100 Sobic006G273100 Sobic009G197200--Sobic006G273100 Sobic008G091671 Sobic008G091671 Sobic009G197200--Sobic008G091671 Sobic010G144100 Sobic010G144100 Sobic009G197200--Sobic010G144100 Sobic002G212800 Sobic002G212800 Sobic009G197200--Sobic002G212800 Sobic001G132500--Sobic006G132200 Sobic008G157950 Sobic008G157950 Sobic001G132500--Sobic008G157950 Sobic001G132500--Sobic009G196700 Sobic001G132500--Sobic003G031750 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic001G132500--Sobic008G042250 Sobic008G036500 Sobic008G036500 Sobic001G132500--Sobic008G036500 Sobic004G164600 Sobic004G164600 Sobic001G132500--Sobic004G164600 Sobic001G132500--Sobic008G091900 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic001G132500--Sobic005G110430 Sobic010G193400 Sobic010G193400 Sobic002G318900--Sobic010G193400 Sobic002G318900--Sobic006G132200 Sobic002G318900--Sobic008G049000 Sobic002G318900--Sobic007G066050 Sobic002G318900--Sobic008G108900 Sobic002G318900--Sobic002G047100 Sobic002G318900--Sobic008G091900 Sobic002G094500 Sobic002G094500 Sobic002G318900--Sobic002G094500 Sobic002G318900--Sobic009G196700 Sobic004G240900--Sobic003G424100 Sobic006G133600 Sobic006G133600 Sobic004G240900--Sobic006G133600 Sobic001G046600 Sobic001G046600 Sobic004G240900--Sobic001G046600 Sobic007G099500 Sobic007G099500 Sobic004G240900--Sobic007G099500 Sobic004G016500 Sobic004G016500 Sobic004G240900--Sobic004G016500 Sobic009G059600 Sobic009G059600 Sobic004G240900--Sobic009G059600 Sobic003G029300 Sobic003G029300 Sobic004G240900--Sobic003G029300 Sobic004G193800 Sobic004G193800 Sobic004G240900--Sobic004G193800 Sobic004G240900--Sobic004G164600 Sobic003G424100--Sobic004G164600 Sobic003G424100--Sobic001G046600 Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic003G424100--Sobic004G212800 Sobic003G424100--Sobic004G240900 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic003G424100--Sobic007G073400 Sobic003G424100--Sobic009G059600 Sobic003G424100--Sobic007G099500 Sobic003G424100--Sobic004G016500 Sobic008G068800 Sobic008G068800 Sobic003G424100--Sobic008G068800
Octagon: transcription factors


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