Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G145800.1
Synonym ATHKT1, HKT1, Sb03g012590
Functional annotation OsHKT1
5 - Na+ transporter, expressed
UniProt C5XIQ5
Pfam PF02386
Panther DB PTHR31064
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008324; cation transmembrane transporter activity GO:0006812cation transport


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G10310 : high-affinity K+ transporter 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g20160.1 : OsHKT1;5 - Na+ transporter, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a024308
Brachypodium -
Barley HORVU4Hr1G087960.1 , HORVU4Hr1G087960.2
Wheat TraesCS4D02G361300 , TraesCS4B02G376000
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G090460 - K08235: xyloglucan:xyloglucosyl transferase
2 Sobic.009G052800 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
3 Sobic.010G135100 expressed protein -
4 Sobic.005G110406 - K16223: protein FLOWERING LOCUS T
5 Sobic.001G194000 DEFL6 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
6 Sobic.001G258600 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
7 Sobic.005G180500 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.006G277500 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
9 Sobic.003G194200 ZmGR2c, putative, expressed -
10 Sobic.007G148900 cytochrome P450, putative, expressed -
11 Sobic.007G094300 tetraspanin family protein, putative, expressed -
12 Sobic.002G238600 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@- -
13 Sobic.002G085900 expressed protein -
14 Sobic.010G014400 - -
15 Sobic.001G531300 glycosyl hydrolases family 16 protein, protein, expressed -
16 Sobic.010G088800 cytokinin-O-glucosyltransferase 2, putative, expressed -
17 Sobic.008G103500 OsMADS20 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed -
18 Sobic.004G083401 - -
19 Sobic.009G023300 - -
20 Sobic.007G149800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@tyrosine protein kinase domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G145800 Sobic003G145800 Sobic007G090460 Sobic007G090460 Sobic003G145800--Sobic007G090460 Sobic009G052800 Sobic009G052800 Sobic003G145800--Sobic009G052800 Sobic010G135100 Sobic010G135100 Sobic003G145800--Sobic010G135100 Sobic005G110406 Sobic005G110406 Sobic003G145800--Sobic005G110406 Sobic001G194000 Sobic001G194000 Sobic003G145800--Sobic001G194000 Sobic001G258600 Sobic001G258600 Sobic003G145800--Sobic001G258600 Sobic005G180500 Sobic005G180500 Sobic003G145800--Sobic005G180500 Sobic006G277500 Sobic006G277500 Sobic003G145800--Sobic006G277500 Sobic003G194200 Sobic003G194200 Sobic003G145800--Sobic003G194200 Sobic010G088800 Sobic010G088800 Sobic007G090460--Sobic010G088800 Sobic006G103300 Sobic006G103300 Sobic007G090460--Sobic006G103300 Sobic007G090460--Sobic005G110406 Sobic002G183700 Sobic002G183700 Sobic007G090460--Sobic002G183700 Sobic006G225500 Sobic006G225500 Sobic007G090460--Sobic006G225500 Sobic002G085900 Sobic002G085900 Sobic007G090460--Sobic002G085900 Sobic006G172500 Sobic006G172500 Sobic007G090460--Sobic006G172500 Sobic004G110700 Sobic004G110700 Sobic007G090460--Sobic004G110700 Sobic004G029100 Sobic004G029100 Sobic007G090460--Sobic004G029100 Sobic009G150500 Sobic009G150500 Sobic009G052800--Sobic009G150500 Sobic009G052800--Sobic005G110406 Sobic009G052800--Sobic007G090460 Sobic009G052800--Sobic010G135100 Sobic007G094300 Sobic007G094300 Sobic009G052800--Sobic007G094300 Sobic009G052800--Sobic006G277500 Sobic009G052800--Sobic006G103300 Sobic009G052800--Sobic010G088800 Sobic009G052800--Sobic006G172500 Sobic010G135100--Sobic005G110406 Sobic010G135100--Sobic005G180500 Sobic002G234400 Sobic002G234400 Sobic010G135100--Sobic002G234400 Sobic003G112400 Sobic003G112400 Sobic010G135100--Sobic003G112400 Sobic004G229400 Sobic004G229400 Sobic010G135100--Sobic004G229400 Sobic002G238600 Sobic002G238600 Sobic010G135100--Sobic002G238600 Sobic006G277800 Sobic006G277800 Sobic010G135100--Sobic006G277800 Sobic001G487500 Sobic001G487500 Sobic010G135100--Sobic001G487500 Sobic010G135100--Sobic007G090460 Sobic005G110406--Sobic010G135100 Sobic005G110406--Sobic006G277800 Sobic005G110406--Sobic007G090460 Sobic005G110406--Sobic007G094300 Sobic005G110406--Sobic004G229400 Sobic005G110406--Sobic006G277500 Sobic005G110406--Sobic009G052800 Sobic005G110406--Sobic002G234400 Sobic005G110406--Sobic010G088800 Sobic003G397300 Sobic003G397300 Sobic001G194000--Sobic003G397300 Sobic006G213100 Sobic006G213100 Sobic001G194000--Sobic006G213100 Sobic001G082300 Sobic001G082300 Sobic001G194000--Sobic001G082300 Sobic001G069800 Sobic001G069800 Sobic001G194000--Sobic001G069800 Sobic006G241300 Sobic006G241300 Sobic001G194000--Sobic006G241300 Sobic004G318600 Sobic004G318600 Sobic001G194000--Sobic004G318600 Sobic008G036900 Sobic008G036900 Sobic001G194000--Sobic008G036900 Sobic001G194000--Sobic001G258600 Sobic008G136000 Sobic008G136000 Sobic001G194000--Sobic008G136000 Sobic003G368000 Sobic003G368000 Sobic001G258600--Sobic003G368000 Sobic003G099000 Sobic003G099000 Sobic001G258600--Sobic003G099000 Sobic010G045400 Sobic010G045400 Sobic001G258600--Sobic010G045400 Sobic008G037900 Sobic008G037900 Sobic001G258600--Sobic008G037900 Sobic001G258600--Sobic007G090460 Sobic001G250100 Sobic001G250100 Sobic001G258600--Sobic001G250100 Sobic003G183300 Sobic003G183300 Sobic001G258600--Sobic003G183300 Sobic006G201000 Sobic006G201000 Sobic001G258600--Sobic006G201000 Sobic003G017601 Sobic003G017601 Sobic001G258600--Sobic003G017601 Sobic008G077550 Sobic008G077550 Sobic005G180500--Sobic008G077550 Sobic005G180500--Sobic002G238600 Sobic005G180500--Sobic010G135100 Sobic004G295600 Sobic004G295600 Sobic005G180500--Sobic004G295600 Sobic001G311900 Sobic001G311900 Sobic005G180500--Sobic001G311900 Sobic004G229500 Sobic004G229500 Sobic005G180500--Sobic004G229500 Sobic002G390000 Sobic002G390000 Sobic005G180500--Sobic002G390000 Sobic003G060100 Sobic003G060100 Sobic005G180500--Sobic003G060100 Sobic005G180500--Sobic004G229400 Sobic006G277500--Sobic006G277800 Sobic001G261509 Sobic001G261509 Sobic006G277500--Sobic001G261509 Sobic008G068300 Sobic008G068300 Sobic006G277500--Sobic008G068300 Sobic004G299600 Sobic004G299600 Sobic006G277500--Sobic004G299600 Sobic006G277500--Sobic005G110406 Sobic006G277500--Sobic007G090460 Sobic005G222500 Sobic005G222500 Sobic006G277500--Sobic005G222500 Sobic001G502000 Sobic001G502000 Sobic006G277500--Sobic001G502000 Sobic006G277500--Sobic002G183700 Sobic001G328800 Sobic001G328800 Sobic003G194200--Sobic001G328800 Sobic001G481000 Sobic001G481000 Sobic003G194200--Sobic001G481000 Sobic002G411900 Sobic002G411900 Sobic003G194200--Sobic002G411900 Sobic009G130300 Sobic009G130300 Sobic003G194200--Sobic009G130300 Sobic004G271400 Sobic004G271400 Sobic003G194200--Sobic004G271400 Sobic001G161601 Sobic001G161601 Sobic003G194200--Sobic001G161601 Sobic003G305700 Sobic003G305700 Sobic003G194200--Sobic003G305700 Sobic002G218300 Sobic002G218300 Sobic003G194200--Sobic002G218300 Sobic009G232100 Sobic009G232100 Sobic003G194200--Sobic009G232100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.