Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G094300.1
Synonym TET8, Sb07g009360
Functional annotation tetraspanin family protein, putative, expressed
UniProt C5YJU5
Pfam PF00335
Panther DB PTHR32191 PTHR32191:SF19
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016021; integral component of membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G23810 : tetraspanin8
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g16050.1 : tetraspanin family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT66985
Barley HORVU7Hr1G112410.2 , HORVU7Hr1G112410.3 , HORVU7Hr1G112410.1
Wheat TraesCS5D02G228600 , TraesCS5A02G220600
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.004G029100 periplasmic beta-glucosidase precursor, putative, expressed K05349: beta-glucosidase


Gene co-expression network
sample Sobic007G094300 Sobic007G094300 Sobic004G121700 Sobic004G121700 Sobic007G094300--Sobic004G121700 Sobic008G148200 Sobic008G148200 Sobic007G094300--Sobic008G148200 Sobic006G277800 Sobic006G277800 Sobic007G094300--Sobic006G277800 Sobic005G110406 Sobic005G110406 Sobic007G094300--Sobic005G110406 Sobic006G072201 Sobic006G072201 Sobic007G094300--Sobic006G072201 Sobic010G088800 Sobic010G088800 Sobic007G094300--Sobic010G088800 Sobic002G099451 Sobic002G099451 Sobic007G094300--Sobic002G099451 Sobic006G277500 Sobic006G277500 Sobic007G094300--Sobic006G277500 Sobic009G052800 Sobic009G052800 Sobic007G094300--Sobic009G052800 Sobic004G121700--Sobic007G094300 Sobic004G121700--Sobic006G277800 Sobic004G121700--Sobic005G110406 Sobic004G121700--Sobic002G099451 Sobic003G405300 Sobic003G405300 Sobic004G121700--Sobic003G405300 Sobic004G121700--Sobic006G072201 Sobic008G068300 Sobic008G068300 Sobic004G121700--Sobic008G068300 Sobic006G104700 Sobic006G104700 Sobic004G121700--Sobic006G104700 Sobic005G166700 Sobic005G166700 Sobic004G121700--Sobic005G166700 Sobic008G148200--Sobic006G072201 Sobic001G360400 Sobic001G360400 Sobic008G148200--Sobic001G360400 Sobic008G148200--Sobic007G094300 Sobic008G148200--Sobic006G277800 Sobic008G148200--Sobic010G088800 Sobic002G261300 Sobic002G261300 Sobic008G148200--Sobic002G261300 Sobic007G021900 Sobic007G021900 Sobic008G148200--Sobic007G021900 Sobic008G148200--Sobic005G166700 Sobic009G150500 Sobic009G150500 Sobic008G148200--Sobic009G150500 Sobic006G277800--Sobic006G277500 Sobic006G277800--Sobic005G110406 Sobic006G277800--Sobic006G072201 Sobic006G277800--Sobic007G094300 Sobic010G135100 Sobic010G135100 Sobic006G277800--Sobic010G135100 Sobic006G277800--Sobic002G261300 Sobic006G277800--Sobic008G068300 Sobic006G277800--Sobic008G148200 Sobic008G077550 Sobic008G077550 Sobic006G277800--Sobic008G077550 Sobic005G110406--Sobic010G135100 Sobic005G110406--Sobic006G277800 Sobic007G090460 Sobic007G090460 Sobic005G110406--Sobic007G090460 Sobic005G110406--Sobic007G094300 Sobic004G229400 Sobic004G229400 Sobic005G110406--Sobic004G229400 Sobic005G110406--Sobic006G277500 Sobic005G110406--Sobic009G052800 Sobic002G234400 Sobic002G234400 Sobic005G110406--Sobic002G234400 Sobic005G110406--Sobic010G088800 Sobic006G072201--Sobic008G148200 Sobic006G072201--Sobic006G277800 Sobic006G072201--Sobic007G094300 Sobic006G072201--Sobic006G104700 Sobic006G072201--Sobic002G261300 Sobic006G072201--Sobic002G099451 Sobic006G072201--Sobic004G121700 Sobic003G399700 Sobic003G399700 Sobic006G072201--Sobic003G399700 Sobic001G256800 Sobic001G256800 Sobic006G072201--Sobic001G256800 Sobic010G088800--Sobic007G090460 Sobic003G140600 Sobic003G140600 Sobic010G088800--Sobic003G140600 Sobic006G103300 Sobic006G103300 Sobic010G088800--Sobic006G103300 Sobic006G172500 Sobic006G172500 Sobic010G088800--Sobic006G172500 Sobic006G172550 Sobic006G172550 Sobic010G088800--Sobic006G172550 Sobic006G225500 Sobic006G225500 Sobic010G088800--Sobic006G225500 Sobic010G088800--Sobic005G166700 Sobic002G085900 Sobic002G085900 Sobic010G088800--Sobic002G085900 Sobic007G008600 Sobic007G008600 Sobic010G088800--Sobic007G008600 Sobic002G099451--Sobic007G094300 Sobic002G099451--Sobic004G121700 Sobic004G083401 Sobic004G083401 Sobic002G099451--Sobic004G083401 Sobic002G099451--Sobic006G072201 Sobic002G099451--Sobic005G110406 Sobic007G047500 Sobic007G047500 Sobic002G099451--Sobic007G047500 Sobic010G179400 Sobic010G179400 Sobic002G099451--Sobic010G179400 Sobic002G099451--Sobic008G148200 Sobic002G099451--Sobic002G261300 Sobic006G277500--Sobic006G277800 Sobic001G261509 Sobic001G261509 Sobic006G277500--Sobic001G261509 Sobic006G277500--Sobic008G068300 Sobic004G299600 Sobic004G299600 Sobic006G277500--Sobic004G299600 Sobic006G277500--Sobic005G110406 Sobic006G277500--Sobic007G090460 Sobic005G222500 Sobic005G222500 Sobic006G277500--Sobic005G222500 Sobic001G502000 Sobic001G502000 Sobic006G277500--Sobic001G502000 Sobic002G183700 Sobic002G183700 Sobic006G277500--Sobic002G183700 Sobic009G052800--Sobic009G150500 Sobic009G052800--Sobic005G110406 Sobic009G052800--Sobic007G090460 Sobic009G052800--Sobic010G135100 Sobic009G052800--Sobic007G094300 Sobic009G052800--Sobic006G277500 Sobic009G052800--Sobic006G103300 Sobic009G052800--Sobic010G088800 Sobic009G052800--Sobic006G172500
Octagon: transcription factors


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