Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G072201.1,Sobic.006G072201.2,Sobic.006G072201.4,Sobic.006G072201.3
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RCT3 , A0A1Z5RD59 , A0A1Z5RCP8 , A0A1Z5RCS1
Pfam PF12706
Panther DB PTHR12553 PTHR12553:SF47
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G30300 : Metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g44140.1 : OsWAK26 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a011499
Brachypodium KQK13996
Barley HORVU7Hr1G087860.6 , HORVU7Hr1G087860.4 , HORVU7Hr1G087860.5 , HORVU7Hr1G087860.2 , HORVU7Hr1G087860.3 , HORVU7Hr1G087860.1 , HORVU2Hr1G049300.2 , HORVU2Hr1G049300.3 , HORVU2Hr1G049300.1
Wheat TraesCS7D02G363400 , TraesCS7B02G268100 , TraesCS7B02G268100 , TraesCS7B02G268100 , TraesCS7B02G268100
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G148200 OsWAK116 - OsWAK receptor-like cytoplasmic kinase OsWAK-RLCK, expressed -
2 Sobic.006G277800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
3 Sobic.007G094300 tetraspanin family protein, putative, expressed -
4 Sobic.006G104700 aldose 1-epimerase, putative, expressed K01785: galM, aldose 1-epimerase
5 Sobic.002G261300 expressed protein -
6 Sobic.002G099451 - -
7 Sobic.004G121700 expansin precursor, putative, expressed -
8 Sobic.003G399700 LTPL38 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
9 Sobic.001G256800 dirigent, putative, expressed -
10 Sobic.001G360400 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
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12 Sobic.002G184100 heat shock protein DnaJ, putative, expressed -
13 Sobic.002G219400 oxidoreductase/ transition metal ion binding protein, putative, expressed -
14 Sobic.008G173500 - -
15 Sobic.010G206800 expressed protein -
16 Sobic.006G277500 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
17 Sobic.010G063033 - -
18 Sobic.010G088800 cytokinin-O-glucosyltransferase 2, putative, expressed -
19 Sobic.009G183900 ICE-like protease p20 domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.007G164400 inorganic phosphate transporter, putative, expressed K08176: MFS transporter, PHS family, inorganic phosphate transporter


Gene co-expression network
sample Sobic006G072201 Sobic006G072201 Sobic008G148200 Sobic008G148200 Sobic006G072201--Sobic008G148200 Sobic006G277800 Sobic006G277800 Sobic006G072201--Sobic006G277800 Sobic007G094300 Sobic007G094300 Sobic006G072201--Sobic007G094300 Sobic006G104700 Sobic006G104700 Sobic006G072201--Sobic006G104700 Sobic002G261300 Sobic002G261300 Sobic006G072201--Sobic002G261300 Sobic002G099451 Sobic002G099451 Sobic006G072201--Sobic002G099451 Sobic004G121700 Sobic004G121700 Sobic006G072201--Sobic004G121700 Sobic003G399700 Sobic003G399700 Sobic006G072201--Sobic003G399700 Sobic001G256800 Sobic001G256800 Sobic006G072201--Sobic001G256800 Sobic008G148200--Sobic006G072201 Sobic001G360400 Sobic001G360400 Sobic008G148200--Sobic001G360400 Sobic008G148200--Sobic007G094300 Sobic008G148200--Sobic006G277800 Sobic010G088800 Sobic010G088800 Sobic008G148200--Sobic010G088800 Sobic008G148200--Sobic002G261300 Sobic007G021900 Sobic007G021900 Sobic008G148200--Sobic007G021900 Sobic005G166700 Sobic005G166700 Sobic008G148200--Sobic005G166700 Sobic009G150500 Sobic009G150500 Sobic008G148200--Sobic009G150500 Sobic006G277500 Sobic006G277500 Sobic006G277800--Sobic006G277500 Sobic005G110406 Sobic005G110406 Sobic006G277800--Sobic005G110406 Sobic006G277800--Sobic006G072201 Sobic006G277800--Sobic007G094300 Sobic010G135100 Sobic010G135100 Sobic006G277800--Sobic010G135100 Sobic006G277800--Sobic002G261300 Sobic008G068300 Sobic008G068300 Sobic006G277800--Sobic008G068300 Sobic006G277800--Sobic008G148200 Sobic008G077550 Sobic008G077550 Sobic006G277800--Sobic008G077550 Sobic007G094300--Sobic004G121700 Sobic007G094300--Sobic008G148200 Sobic007G094300--Sobic006G277800 Sobic007G094300--Sobic005G110406 Sobic007G094300--Sobic006G072201 Sobic007G094300--Sobic010G088800 Sobic007G094300--Sobic002G099451 Sobic007G094300--Sobic006G277500 Sobic009G052800 Sobic009G052800 Sobic007G094300--Sobic009G052800 Sobic002G238600 Sobic002G238600 Sobic006G104700--Sobic002G238600 Sobic003G112400 Sobic003G112400 Sobic006G104700--Sobic003G112400 Sobic002G390000 Sobic002G390000 Sobic006G104700--Sobic002G390000 Sobic003G060100 Sobic003G060100 Sobic006G104700--Sobic003G060100 Sobic006G104700--Sobic006G277800 Sobic006G104700--Sobic006G072201 Sobic001G065900 Sobic001G065900 Sobic006G104700--Sobic001G065900 Sobic006G104700--Sobic005G110406 Sobic006G104700--Sobic010G135100 Sobic007G164400 Sobic007G164400 Sobic002G261300--Sobic007G164400 Sobic007G030501 Sobic007G030501 Sobic002G261300--Sobic007G030501 Sobic001G159900 Sobic001G159900 Sobic002G261300--Sobic001G159900 Sobic004G234100 Sobic004G234100 Sobic002G261300--Sobic004G234100 Sobic001G434800 Sobic001G434800 Sobic002G261300--Sobic001G434800 Sobic002G261300--Sobic006G277800 Sobic002G261300--Sobic001G360400 Sobic002G354200 Sobic002G354200 Sobic002G261300--Sobic002G354200 Sobic002G250000 Sobic002G250000 Sobic002G261300--Sobic002G250000 Sobic002G099451--Sobic007G094300 Sobic002G099451--Sobic004G121700 Sobic004G083401 Sobic004G083401 Sobic002G099451--Sobic004G083401 Sobic002G099451--Sobic006G072201 Sobic002G099451--Sobic005G110406 Sobic007G047500 Sobic007G047500 Sobic002G099451--Sobic007G047500 Sobic010G179400 Sobic010G179400 Sobic002G099451--Sobic010G179400 Sobic002G099451--Sobic008G148200 Sobic002G099451--Sobic002G261300 Sobic004G121700--Sobic007G094300 Sobic004G121700--Sobic006G277800 Sobic004G121700--Sobic005G110406 Sobic004G121700--Sobic002G099451 Sobic003G405300 Sobic003G405300 Sobic004G121700--Sobic003G405300 Sobic004G121700--Sobic006G072201 Sobic004G121700--Sobic008G068300 Sobic004G121700--Sobic006G104700 Sobic004G121700--Sobic005G166700 Sobic002G234400 Sobic002G234400 Sobic003G399700--Sobic002G234400 Sobic001G231900 Sobic001G231900 Sobic003G399700--Sobic001G231900 Sobic006G172550 Sobic006G172550 Sobic003G399700--Sobic006G172550 Sobic006G198700 Sobic006G198700 Sobic003G399700--Sobic006G198700 Sobic004G292900 Sobic004G292900 Sobic003G399700--Sobic004G292900 Sobic006G172500 Sobic006G172500 Sobic003G399700--Sobic006G172500 Sobic001G302600 Sobic001G302600 Sobic003G399700--Sobic001G302600 Sobic003G399700--Sobic002G250000 Sobic002G219400 Sobic002G219400 Sobic003G399700--Sobic002G219400 Sobic009G183900 Sobic009G183900 Sobic001G256800--Sobic009G183900 Sobic010G063033 Sobic010G063033 Sobic001G256800--Sobic010G063033 Sobic001G256800--Sobic002G234400 Sobic004G229400 Sobic004G229400 Sobic001G256800--Sobic004G229400 Sobic001G256800--Sobic002G261300 Sobic001G256800--Sobic003G399700 Sobic004G228500 Sobic004G228500 Sobic001G256800--Sobic004G228500 Sobic001G256800--Sobic002G354200 Sobic009G205500 Sobic009G205500 Sobic001G256800--Sobic009G205500
Octagon: transcription factors


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