Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G052800.1
Synonym Sb09g004490
Functional annotation helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6P6N4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g06520.1 : helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G150500 expressed protein -
2 Sobic.005G110406 - K16223: protein FLOWERING LOCUS T
3 Sobic.007G090460 - K08235: xyloglucan:xyloglucosyl transferase
4 Sobic.010G135100 expressed protein -
5 Sobic.007G094300 tetraspanin family protein, putative, expressed -
6 Sobic.006G277500 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
7 Sobic.006G103300 wound/stress protein, putative, expressed -
8 Sobic.010G088800 cytokinin-O-glucosyltransferase 2, putative, expressed -
9 Sobic.006G172500 LTPL121 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, putative, expressed -
10 Sobic.004G083401 - -
11 Sobic.008G109300 oxidoreductase, 2OG-Fe oxygenase family protein, putative, expressed -
12 Sobic.005G166700 sulfotransferase domain containing protein, expressed -
13 Sobic.010G127800 peptide transporter PTR2, putative, expressed K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
14 Sobic.006G277800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
15 Sobic.001G261509 - K09872: aquaporin PIP
16 Sobic.008G068300 transferase family protein, putative, expressed -
17 Sobic.007G148900 cytochrome P450, putative, expressed -
18 Sobic.008G016000 major facilitator superfamily antiporter, putative, expressed -
19 Sobic.008G148200 OsWAK116 - OsWAK receptor-like cytoplasmic kinase OsWAK-RLCK, expressed -
20 Sobic.006G225500 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G052800 Sobic009G052800 Sobic009G150500 Sobic009G150500 Sobic009G052800--Sobic009G150500 Sobic005G110406 Sobic005G110406 Sobic009G052800--Sobic005G110406 Sobic007G090460 Sobic007G090460 Sobic009G052800--Sobic007G090460 Sobic010G135100 Sobic010G135100 Sobic009G052800--Sobic010G135100 Sobic007G094300 Sobic007G094300 Sobic009G052800--Sobic007G094300 Sobic006G277500 Sobic006G277500 Sobic009G052800--Sobic006G277500 Sobic006G103300 Sobic006G103300 Sobic009G052800--Sobic006G103300 Sobic010G088800 Sobic010G088800 Sobic009G052800--Sobic010G088800 Sobic006G172500 Sobic006G172500 Sobic009G052800--Sobic006G172500 Sobic005G166700 Sobic005G166700 Sobic009G150500--Sobic005G166700 Sobic004G029100 Sobic004G029100 Sobic009G150500--Sobic004G029100 Sobic008G016000 Sobic008G016000 Sobic009G150500--Sobic008G016000 Sobic001G232200 Sobic001G232200 Sobic009G150500--Sobic001G232200 Sobic007G008600 Sobic007G008600 Sobic009G150500--Sobic007G008600 Sobic010G028100 Sobic010G028100 Sobic009G150500--Sobic010G028100 Sobic009G150500--Sobic009G052800 Sobic009G150500--Sobic006G103300 Sobic002G183700 Sobic002G183700 Sobic009G150500--Sobic002G183700 Sobic005G110406--Sobic010G135100 Sobic006G277800 Sobic006G277800 Sobic005G110406--Sobic006G277800 Sobic005G110406--Sobic007G090460 Sobic005G110406--Sobic007G094300 Sobic004G229400 Sobic004G229400 Sobic005G110406--Sobic004G229400 Sobic005G110406--Sobic006G277500 Sobic005G110406--Sobic009G052800 Sobic002G234400 Sobic002G234400 Sobic005G110406--Sobic002G234400 Sobic005G110406--Sobic010G088800 Sobic007G090460--Sobic010G088800 Sobic007G090460--Sobic006G103300 Sobic007G090460--Sobic005G110406 Sobic007G090460--Sobic002G183700 Sobic006G225500 Sobic006G225500 Sobic007G090460--Sobic006G225500 Sobic002G085900 Sobic002G085900 Sobic007G090460--Sobic002G085900 Sobic007G090460--Sobic006G172500 Sobic004G110700 Sobic004G110700 Sobic007G090460--Sobic004G110700 Sobic007G090460--Sobic004G029100 Sobic010G135100--Sobic005G110406 Sobic005G180500 Sobic005G180500 Sobic010G135100--Sobic005G180500 Sobic010G135100--Sobic002G234400 Sobic003G112400 Sobic003G112400 Sobic010G135100--Sobic003G112400 Sobic010G135100--Sobic004G229400 Sobic002G238600 Sobic002G238600 Sobic010G135100--Sobic002G238600 Sobic010G135100--Sobic006G277800 Sobic001G487500 Sobic001G487500 Sobic010G135100--Sobic001G487500 Sobic010G135100--Sobic007G090460 Sobic004G121700 Sobic004G121700 Sobic007G094300--Sobic004G121700 Sobic008G148200 Sobic008G148200 Sobic007G094300--Sobic008G148200 Sobic007G094300--Sobic006G277800 Sobic007G094300--Sobic005G110406 Sobic006G072201 Sobic006G072201 Sobic007G094300--Sobic006G072201 Sobic007G094300--Sobic010G088800 Sobic002G099451 Sobic002G099451 Sobic007G094300--Sobic002G099451 Sobic007G094300--Sobic006G277500 Sobic007G094300--Sobic009G052800 Sobic006G277500--Sobic006G277800 Sobic001G261509 Sobic001G261509 Sobic006G277500--Sobic001G261509 Sobic008G068300 Sobic008G068300 Sobic006G277500--Sobic008G068300 Sobic004G299600 Sobic004G299600 Sobic006G277500--Sobic004G299600 Sobic006G277500--Sobic005G110406 Sobic006G277500--Sobic007G090460 Sobic005G222500 Sobic005G222500 Sobic006G277500--Sobic005G222500 Sobic001G502000 Sobic001G502000 Sobic006G277500--Sobic001G502000 Sobic006G277500--Sobic002G183700 Sobic005G127400 Sobic005G127400 Sobic006G103300--Sobic005G127400 Sobic006G103300--Sobic006G225500 Sobic009G186500 Sobic009G186500 Sobic006G103300--Sobic009G186500 Sobic003G064800 Sobic003G064800 Sobic006G103300--Sobic003G064800 Sobic003G140700 Sobic003G140700 Sobic006G103300--Sobic003G140700 Sobic010G234500 Sobic010G234500 Sobic006G103300--Sobic010G234500 Sobic006G103300--Sobic007G008600 Sobic006G103300--Sobic004G110700 Sobic006G103300--Sobic010G088800 Sobic010G088800--Sobic007G090460 Sobic003G140600 Sobic003G140600 Sobic010G088800--Sobic003G140600 Sobic010G088800--Sobic006G103300 Sobic010G088800--Sobic006G172500 Sobic006G172550 Sobic006G172550 Sobic010G088800--Sobic006G172550 Sobic010G088800--Sobic006G225500 Sobic010G088800--Sobic005G166700 Sobic010G088800--Sobic002G085900 Sobic010G088800--Sobic007G008600 Sobic006G172500--Sobic006G172550 Sobic003G399600 Sobic003G399600 Sobic006G172500--Sobic003G399600 Sobic006G172500--Sobic002G085900 Sobic006G172500--Sobic006G225500 Sobic006G172500--Sobic010G088800 Sobic001G304201 Sobic001G304201 Sobic006G172500--Sobic001G304201 Sobic002G326500 Sobic002G326500 Sobic006G172500--Sobic002G326500 Sobic002G250000 Sobic002G250000 Sobic006G172500--Sobic002G250000 Sobic006G172500--Sobic007G090460
Octagon: transcription factors


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