Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G150500.1
Synonym Sb09g021440
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5R2U2
Pfam PF06749
Panther DB PTHR31769 PTHR31769:SF15
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G17210 : Protein of unknown function (DUF1218)
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g35930.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a043853
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G166700 sulfotransferase domain containing protein, expressed -
2 Sobic.004G029100 periplasmic beta-glucosidase precursor, putative, expressed K05349: beta-glucosidase
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6 Sobic.010G028100 GDP-mannose 4,6 dehydratase 2, putative, expressed K01711: gmd, GDPmannose 4,6-dehydratase
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11 Sobic.002G228800 expressed protein -
12 Sobic.003G182200 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog 1, putative, expressed -
13 Sobic.008G068300 transferase family protein, putative, expressed -
14 Sobic.006G273300 "cell wall modification, deposition of casparian strips, endodermis, transmembrane"(PubMedID : 24920445)@membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.008G109300 oxidoreductase, 2OG-Fe oxygenase family protein, putative, expressed -
16 Sobic.003G000100 STIGL1 - Stigma-specific Stig1 family protein precursor, expressed -
17 Sobic.001G261509 - K09872: aquaporin PIP
18 Sobic.001G414800 dirigent, putative, expressed -
19 Sobic.007G158800 patatin, putative, expressed -
20 Sobic.007G090460 - K08235: xyloglucan:xyloglucosyl transferase


Gene co-expression network
sample Sobic009G150500 Sobic009G150500 Sobic005G166700 Sobic005G166700 Sobic009G150500--Sobic005G166700 Sobic004G029100 Sobic004G029100 Sobic009G150500--Sobic004G029100 Sobic008G016000 Sobic008G016000 Sobic009G150500--Sobic008G016000 Sobic001G232200 Sobic001G232200 Sobic009G150500--Sobic001G232200 Sobic007G008600 Sobic007G008600 Sobic009G150500--Sobic007G008600 Sobic010G028100 Sobic010G028100 Sobic009G150500--Sobic010G028100 Sobic009G052800 Sobic009G052800 Sobic009G150500--Sobic009G052800 Sobic006G103300 Sobic006G103300 Sobic009G150500--Sobic006G103300 Sobic002G183700 Sobic002G183700 Sobic009G150500--Sobic002G183700 Sobic005G166700--Sobic001G232200 Sobic005G166700--Sobic007G008600 Sobic005G166700--Sobic009G150500 Sobic003G280000 Sobic003G280000 Sobic005G166700--Sobic003G280000 Sobic006G106900 Sobic006G106900 Sobic005G166700--Sobic006G106900 Sobic003G353200 Sobic003G353200 Sobic005G166700--Sobic003G353200 Sobic005G166700--Sobic006G103300 Sobic003G257400 Sobic003G257400 Sobic005G166700--Sobic003G257400 Sobic005G202300 Sobic005G202300 Sobic005G166700--Sobic005G202300 Sobic004G322100 Sobic004G322100 Sobic004G029100--Sobic004G322100 Sobic004G029100--Sobic002G183700 Sobic010G152400 Sobic010G152400 Sobic004G029100--Sobic010G152400 Sobic007G158800 Sobic007G158800 Sobic004G029100--Sobic007G158800 Sobic003G000100 Sobic003G000100 Sobic004G029100--Sobic003G000100 Sobic004G029100--Sobic007G008600 Sobic001G502000 Sobic001G502000 Sobic004G029100--Sobic001G502000 Sobic003G182200 Sobic003G182200 Sobic004G029100--Sobic003G182200 Sobic008G019800 Sobic008G019800 Sobic004G029100--Sobic008G019800 Sobic002G326500 Sobic002G326500 Sobic008G016000--Sobic002G326500 Sobic008G016000--Sobic004G322100 Sobic008G016000--Sobic003G000100 Sobic004G271800 Sobic004G271800 Sobic008G016000--Sobic004G271800 Sobic003G399600 Sobic003G399600 Sobic008G016000--Sobic003G399600 Sobic008G016000--Sobic002G183700 Sobic004G110700 Sobic004G110700 Sobic008G016000--Sobic004G110700 Sobic003G140700 Sobic003G140700 Sobic008G016000--Sobic003G140700 Sobic008G016000--Sobic009G150500 Sobic001G232200--Sobic005G166700 Sobic001G487800 Sobic001G487800 Sobic001G232200--Sobic001G487800 Sobic010G267200 Sobic010G267200 Sobic001G232200--Sobic010G267200 Sobic001G232200--Sobic009G150500 Sobic005G224300 Sobic005G224300 Sobic001G232200--Sobic005G224300 Sobic001G232200--Sobic005G202300 Sobic001G232200--Sobic003G353200 Sobic001G232200--Sobic003G280000 Sobic002G228800 Sobic002G228800 Sobic001G232200--Sobic002G228800 Sobic002G255000 Sobic002G255000 Sobic007G008600--Sobic002G255000 Sobic007G100700 Sobic007G100700 Sobic007G008600--Sobic007G100700 Sobic003G064800 Sobic003G064800 Sobic007G008600--Sobic003G064800 Sobic006G273300 Sobic006G273300 Sobic007G008600--Sobic006G273300 Sobic007G008600--Sobic006G106900 Sobic005G127400 Sobic005G127400 Sobic007G008600--Sobic005G127400 Sobic007G008600--Sobic004G029100 Sobic007G008600--Sobic003G182200 Sobic006G225500 Sobic006G225500 Sobic007G008600--Sobic006G225500 Sobic006G092700 Sobic006G092700 Sobic010G028100--Sobic006G092700 Sobic006G135300 Sobic006G135300 Sobic010G028100--Sobic006G135300 Sobic010G028100--Sobic003G000100 Sobic007G090472 Sobic007G090472 Sobic010G028100--Sobic007G090472 Sobic010G082000 Sobic010G082000 Sobic010G028100--Sobic010G082000 Sobic002G146000 Sobic002G146000 Sobic010G028100--Sobic002G146000 Sobic010G113100 Sobic010G113100 Sobic010G028100--Sobic010G113100 Sobic006G003600 Sobic006G003600 Sobic010G028100--Sobic006G003600 Sobic010G028100--Sobic003G182200 Sobic009G052800--Sobic009G150500 Sobic005G110406 Sobic005G110406 Sobic009G052800--Sobic005G110406 Sobic007G090460 Sobic007G090460 Sobic009G052800--Sobic007G090460 Sobic010G135100 Sobic010G135100 Sobic009G052800--Sobic010G135100 Sobic007G094300 Sobic007G094300 Sobic009G052800--Sobic007G094300 Sobic006G277500 Sobic006G277500 Sobic009G052800--Sobic006G277500 Sobic009G052800--Sobic006G103300 Sobic010G088800 Sobic010G088800 Sobic009G052800--Sobic010G088800 Sobic006G172500 Sobic006G172500 Sobic009G052800--Sobic006G172500 Sobic006G103300--Sobic005G127400 Sobic006G103300--Sobic006G225500 Sobic009G186500 Sobic009G186500 Sobic006G103300--Sobic009G186500 Sobic006G103300--Sobic003G064800 Sobic006G103300--Sobic003G140700 Sobic010G234500 Sobic010G234500 Sobic006G103300--Sobic010G234500 Sobic006G103300--Sobic007G008600 Sobic006G103300--Sobic004G110700 Sobic006G103300--Sobic010G088800 Sobic002G183700--Sobic007G158800 Sobic002G183700--Sobic004G029100 Sobic002G183700--Sobic001G502000 Sobic002G183700--Sobic003G140700 Sobic006G089000 Sobic006G089000 Sobic002G183700--Sobic006G089000 Sobic006G274933 Sobic006G274933 Sobic002G183700--Sobic006G274933 Sobic002G183700--Sobic006G225500 Sobic002G183700--Sobic004G322100 Sobic003G311800 Sobic003G311800 Sobic002G183700--Sobic003G311800
Octagon: transcription factors


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