Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G238600.1
Synonym Sb02g027640
Functional annotation "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence." (PubMedID : 27586543)
-
UniProt C5X363
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G390000 dirigent, putative, expressed -
2 Sobic.001G381400 expressed protein -
3 Sobic.005G180500 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.006G104700 aldose 1-epimerase, putative, expressed K01785: galM, aldose 1-epimerase
5 Sobic.002G388800 cytochrome P450 72A1, putative, expressed -
6 Sobic.001G065900 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
7 Sobic.004G263100 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@hsp20/alpha crystallin family protein, putative, expressed K13993: HSP20 family protein
8 Sobic.003G060100 expressed protein -
9 Sobic.004G094900 expressed protein -
10 Sobic.003G112400 expressed protein -
11 Sobic.001G102150 - -
12 Sobic.002G090100 - -
13 Sobic.002G090100 - -
14 Sobic.002G090100 - -
15 Sobic.002G090100 - -
16 Sobic.002G090100 - -
17 Sobic.002G090100 - -
18 Sobic.007G159100 expressed high in San Chi San (an efficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@tetraspanin family protein, putative, expressed -
19 Sobic.002G102132 - -
20 Sobic.008G077550 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G238600 Sobic002G238600 Sobic002G390000 Sobic002G390000 Sobic002G238600--Sobic002G390000 Sobic001G381400 Sobic001G381400 Sobic002G238600--Sobic001G381400 Sobic005G180500 Sobic005G180500 Sobic002G238600--Sobic005G180500 Sobic006G104700 Sobic006G104700 Sobic002G238600--Sobic006G104700 Sobic002G388800 Sobic002G388800 Sobic002G238600--Sobic002G388800 Sobic001G065900 Sobic001G065900 Sobic002G238600--Sobic001G065900 Sobic004G263100 Sobic004G263100 Sobic002G238600--Sobic004G263100 Sobic003G060100 Sobic003G060100 Sobic002G238600--Sobic003G060100 Sobic004G094900 Sobic004G094900 Sobic002G238600--Sobic004G094900 Sobic002G390000--Sobic002G238600 Sobic002G390000--Sobic001G381400 Sobic002G390000--Sobic004G094900 Sobic002G090100 Sobic002G090100 Sobic002G390000--Sobic002G090100 Sobic001G381400--Sobic002G090100 Sobic001G381400--Sobic004G094900 Sobic001G381400--Sobic002G390000 Sobic007G159100 Sobic007G159100 Sobic001G381400--Sobic007G159100 Sobic008G077550 Sobic008G077550 Sobic005G180500--Sobic008G077550 Sobic005G180500--Sobic002G238600 Sobic010G135100 Sobic010G135100 Sobic005G180500--Sobic010G135100 Sobic004G295600 Sobic004G295600 Sobic005G180500--Sobic004G295600 Sobic001G311900 Sobic001G311900 Sobic005G180500--Sobic001G311900 Sobic004G229500 Sobic004G229500 Sobic005G180500--Sobic004G229500 Sobic005G180500--Sobic002G390000 Sobic005G180500--Sobic003G060100 Sobic004G229400 Sobic004G229400 Sobic005G180500--Sobic004G229400 Sobic006G104700--Sobic002G238600 Sobic003G112400 Sobic003G112400 Sobic006G104700--Sobic003G112400 Sobic006G104700--Sobic002G390000 Sobic006G104700--Sobic003G060100 Sobic006G277800 Sobic006G277800 Sobic006G104700--Sobic006G277800 Sobic006G072201 Sobic006G072201 Sobic006G104700--Sobic006G072201 Sobic006G104700--Sobic001G065900 Sobic005G110406 Sobic005G110406 Sobic006G104700--Sobic005G110406 Sobic006G104700--Sobic010G135100 Sobic002G388800--Sobic004G263100 Sobic005G171001 Sobic005G171001 Sobic002G388800--Sobic005G171001 Sobic004G092800 Sobic004G092800 Sobic002G388800--Sobic004G092800 Sobic002G388800--Sobic001G065900 Sobic002G388800--Sobic001G381400 Sobic002G388800--Sobic002G390000 Sobic002G102132 Sobic002G102132 Sobic002G388800--Sobic002G102132 Sobic002G388800--Sobic007G159100 Sobic004G251800 Sobic004G251800 Sobic002G388800--Sobic004G251800 Sobic001G065900--Sobic004G263100 Sobic004G165800 Sobic004G165800 Sobic001G065900--Sobic004G165800 Sobic002G100832 Sobic002G100832 Sobic001G065900--Sobic002G100832 Sobic001G065900--Sobic002G102132 Sobic001G065900--Sobic004G092800 Sobic006G057500 Sobic006G057500 Sobic001G065900--Sobic006G057500 Sobic001G065900--Sobic004G251800 Sobic001G065900--Sobic002G388800 Sobic004G341000 Sobic004G341000 Sobic001G065900--Sobic004G341000 Sobic004G263100--Sobic002G102132 Sobic004G263100--Sobic007G159100 Sobic004G263100--Sobic001G065900 Sobic004G263100--Sobic002G100832 Sobic004G263100--Sobic002G388800 Sobic004G263100--Sobic004G165800 Sobic004G263100--Sobic001G381400 Sobic004G263100--Sobic006G057500 Sobic004G263100--Sobic002G090100 Sobic003G060100--Sobic001G065900 Sobic001G487500 Sobic001G487500 Sobic003G060100--Sobic001G487500 Sobic009G194400 Sobic009G194400 Sobic003G060100--Sobic009G194400 Sobic003G060100--Sobic002G388800 Sobic005G013500 Sobic005G013500 Sobic003G060100--Sobic005G013500 Sobic003G060100--Sobic003G112400 Sobic003G060100--Sobic004G251800 Sobic003G060100--Sobic004G341000 Sobic003G060100--Sobic002G238600 Sobic004G094900--Sobic001G381400 Sobic004G094900--Sobic002G390000 Sobic007G100032 Sobic007G100032 Sobic004G094900--Sobic007G100032 Sobic008G079500 Sobic008G079500 Sobic004G094900--Sobic008G079500 Sobic004G094900--Sobic002G090100
Octagon: transcription factors


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