Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G023300.2,Sobic.009G023300.1
Synonym Sb09g001980
Functional annotation -
UniProt C5YZ09
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G161900 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
2 Sobic.009G133900 inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein, putative, expressed -
3 Sobic.003G145800 OsHKT1@5 - Na+ transporter, expressed -
4 Sobic.002G144025 - -
5 Sobic.002G216801 - -
6 Sobic.008G167100 cycloartenol synthase, putative, expressed -
7 Sobic.004G247300 cysteine-rich repeat secretory protein precursor, putative, expressed -
8 Sobic.002G047100 - -
9 Sobic.010G221700 - -
10 Sobic.010G160100 - -
11 Sobic.002G023400 expressed protein -
12 Sobic.002G073400 - -
13 Sobic.001G194000 DEFL6 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
14 Sobic.006G268700 expressed protein -
15 Sobic.007G045100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
16 Sobic.005G054700 pollen signalling protein with adenylyl cyclase activity, putative, expressed -
17 Sobic.001G166000 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
18 Sobic.002G099401 - -
19 Sobic.005G162300 cytochrome P450 51, putative, expressed K05917: sterol 14alpha-demethylase
20 Sobic.007G104300 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G023300 Sobic009G023300 Sobic010G161900 Sobic010G161900 Sobic009G023300--Sobic010G161900 Sobic009G133900 Sobic009G133900 Sobic009G023300--Sobic009G133900 Sobic003G145800 Sobic003G145800 Sobic009G023300--Sobic003G145800 Sobic002G144025 Sobic002G144025 Sobic009G023300--Sobic002G144025 Sobic002G216801 Sobic002G216801 Sobic009G023300--Sobic002G216801 Sobic008G167100 Sobic008G167100 Sobic009G023300--Sobic008G167100 Sobic004G247300 Sobic004G247300 Sobic009G023300--Sobic004G247300 Sobic002G047100 Sobic002G047100 Sobic009G023300--Sobic002G047100 Sobic010G221700 Sobic010G221700 Sobic009G023300--Sobic010G221700 Sobic002G023400 Sobic002G023400 Sobic010G161900--Sobic002G023400 Sobic005G123900 Sobic005G123900 Sobic010G161900--Sobic005G123900 Sobic004G325300 Sobic004G325300 Sobic010G161900--Sobic004G325300 Sobic010G161900--Sobic008G167100 Sobic005G054700 Sobic005G054700 Sobic010G161900--Sobic005G054700 Sobic010G161900--Sobic004G247300 Sobic003G103000 Sobic003G103000 Sobic010G161900--Sobic003G103000 Sobic003G320500 Sobic003G320500 Sobic010G161900--Sobic003G320500 Sobic007G187400 Sobic007G187400 Sobic010G161900--Sobic007G187400 Sobic002G073400 Sobic002G073400 Sobic009G133900--Sobic002G073400 Sobic006G130501 Sobic006G130501 Sobic009G133900--Sobic006G130501 Sobic010G227950 Sobic010G227950 Sobic009G133900--Sobic010G227950 Sobic001G215900 Sobic001G215900 Sobic009G133900--Sobic001G215900 Sobic008G058400 Sobic008G058400 Sobic009G133900--Sobic008G058400 Sobic006G098200 Sobic006G098200 Sobic009G133900--Sobic006G098200 Sobic003G158100 Sobic003G158100 Sobic009G133900--Sobic003G158100 Sobic009G133900--Sobic004G247300 Sobic006G133600 Sobic006G133600 Sobic009G133900--Sobic006G133600 Sobic007G090460 Sobic007G090460 Sobic003G145800--Sobic007G090460 Sobic009G052800 Sobic009G052800 Sobic003G145800--Sobic009G052800 Sobic010G135100 Sobic010G135100 Sobic003G145800--Sobic010G135100 Sobic005G110406 Sobic005G110406 Sobic003G145800--Sobic005G110406 Sobic001G194000 Sobic001G194000 Sobic003G145800--Sobic001G194000 Sobic001G258600 Sobic001G258600 Sobic003G145800--Sobic001G258600 Sobic005G180500 Sobic005G180500 Sobic003G145800--Sobic005G180500 Sobic006G277500 Sobic006G277500 Sobic003G145800--Sobic006G277500 Sobic003G194200 Sobic003G194200 Sobic003G145800--Sobic003G194200 Sobic002G144025--Sobic008G167100 Sobic007G104300 Sobic007G104300 Sobic002G144025--Sobic007G104300 Sobic002G144025--Sobic002G023400 Sobic006G268700 Sobic006G268700 Sobic002G144025--Sobic006G268700 Sobic001G181900 Sobic001G181900 Sobic002G144025--Sobic001G181900 Sobic010G160100 Sobic010G160100 Sobic002G144025--Sobic010G160100 Sobic008G049000 Sobic008G049000 Sobic002G144025--Sobic008G049000 Sobic004G166301 Sobic004G166301 Sobic002G144025--Sobic004G166301 Sobic002G144025--Sobic002G047100 Sobic002G216801--Sobic008G167100 Sobic002G216801--Sobic002G023400 Sobic002G017000 Sobic002G017000 Sobic002G216801--Sobic002G017000 Sobic005G162300 Sobic005G162300 Sobic002G216801--Sobic005G162300 Sobic002G007600 Sobic002G007600 Sobic002G216801--Sobic002G007600 Sobic005G218100 Sobic005G218100 Sobic002G216801--Sobic005G218100 Sobic002G216801--Sobic002G144025 Sobic008G167100--Sobic002G023400 Sobic008G167100--Sobic005G162300 Sobic008G167100--Sobic007G104300 Sobic008G167100--Sobic002G144025 Sobic008G167100--Sobic008G049000 Sobic008G167100--Sobic004G166301 Sobic003G090500 Sobic003G090500 Sobic008G167100--Sobic003G090500 Sobic008G167100--Sobic002G216801 Sobic003G219000 Sobic003G219000 Sobic008G167100--Sobic003G219000 Sobic004G247300--Sobic005G054700 Sobic001G514400 Sobic001G514400 Sobic004G247300--Sobic001G514400 Sobic009G175200 Sobic009G175200 Sobic004G247300--Sobic009G175200 Sobic002G034301 Sobic002G034301 Sobic004G247300--Sobic002G034301 Sobic004G247300--Sobic001G215900 Sobic009G099700 Sobic009G099700 Sobic004G247300--Sobic009G099700 Sobic001G366800 Sobic001G366800 Sobic004G247300--Sobic001G366800 Sobic010G242900 Sobic010G242900 Sobic004G247300--Sobic010G242900 Sobic006G213100 Sobic006G213100 Sobic004G247300--Sobic006G213100 Sobic002G047100--Sobic008G049000 Sobic001G132500 Sobic001G132500 Sobic002G047100--Sobic001G132500 Sobic006G132200 Sobic006G132200 Sobic002G047100--Sobic006G132200 Sobic003G038000 Sobic003G038000 Sobic002G047100--Sobic003G038000 Sobic007G066050 Sobic007G066050 Sobic002G047100--Sobic007G066050 Sobic002G047100--Sobic003G219000 Sobic002G318900 Sobic002G318900 Sobic002G047100--Sobic002G318900 Sobic002G047100--Sobic008G167100 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic002G047100--Sobic008G091900 Sobic002G099401 Sobic002G099401 Sobic010G221700--Sobic002G099401 Sobic001G310166 Sobic001G310166 Sobic010G221700--Sobic001G310166 Sobic003G035332 Sobic003G035332 Sobic010G221700--Sobic003G035332 Sobic005G195700 Sobic005G195700 Sobic010G221700--Sobic005G195700 Sobic004G043400 Sobic004G043400 Sobic010G221700--Sobic004G043400 Sobic009G113200 Sobic009G113200 Sobic010G221700--Sobic009G113200 Sobic010G175700 Sobic010G175700 Sobic010G221700--Sobic010G175700
Octagon: transcription factors


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