Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G256400.1
Synonym Sb06g031990
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y9Z8
Pfam PF05553
Panther DB PTHR33450 PTHR33450:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G42180 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g56995.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a009399
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G201400 OsFBX222 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.007G193600 - -
3 Sobic.001G241700 MBTB52 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
4 Sobic.002G188300 - -
5 Sobic.005G006900 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.008G155000 ankyrin, putative, expressed -
7 Sobic.007G133100 - -
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11 Sobic.005G041500 OsProCP5 - Putative Lysosomal Pro-x Carboxypeptidase homologue, expressed K01285: lysosomal Pro-X carboxypeptidase
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14 Sobic.009G149100 GASR6 - Gibberellin-regulated GASA/GAST/Snakin family protein precursor, expressed -
15 Sobic.010G261800 OsMADS16 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed K09264: MADS-box transcription factor, plant
16 Sobic.001G103600 gp176, putative, expressed -
17 Sobic.004G254700 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.004G256100 transporter-related, putative, expressed -
19 Sobic.009G240500 lipase class 3 family protein, putative, expressed -
20 Sobic.002G019300 OsFBL33 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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