Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G011900.1
Synonym AL2
Functional annotation PHD finger protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6PEV8
Pfam PF00628 PF12165
Panther DB PTHR12321 PTHR12321:SF39
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding GO:0006355regulation of transcription, DNA-templated


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G26210 : alfin-like 4
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g41740.1 : PHD finger protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G058400 - -
2 Sobic.010G011300 - -
3 Sobic.010G008200 LTPL31 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
4 Sobic.006G144201 - -
5 Sobic.005G141400 - -
6 Sobic.008G069600 CRP10 - Cysteine-rich family protein precursor, expressed -
7 Sobic.005G174800 - -
8 Sobic.003G167566 - -
9 Sobic.008G071550 - -
10 Sobic.003G010000 cytochrome P450, putative, expressed -
11 Sobic.005G213900 gamma-thionin family domain containing protein, expressed -
12 Sobic.001G266300 POEI3 - Pollen Ole e I allergen and extensin family protein precursor, expressed -
13 Sobic.009G078600 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
14 Sobic.008G070100 CRP7 - Cysteine-rich family protein precursor, expressed -
15 Sobic.003G238900 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
16 Sobic.004G316200 DEFL71 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
17 Sobic.003G179300 DEF9 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
18 Sobic.003G330800 LTPL29 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
19 Sobic.004G048300 - -
20 Sobic.003G207800 OsFBD2 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G011900 Sobic007G011900 Sobic005G058400 Sobic005G058400 Sobic007G011900--Sobic005G058400 Sobic010G011300 Sobic010G011300 Sobic007G011900--Sobic010G011300 Sobic010G008200 Sobic010G008200 Sobic007G011900--Sobic010G008200 Sobic006G144201 Sobic006G144201 Sobic007G011900--Sobic006G144201 Sobic005G141400 Sobic005G141400 Sobic007G011900--Sobic005G141400 Sobic008G069600 Sobic008G069600 Sobic007G011900--Sobic008G069600 Sobic005G174800 Sobic005G174800 Sobic007G011900--Sobic005G174800 Sobic003G167566 Sobic003G167566 Sobic007G011900--Sobic003G167566 Sobic008G071550 Sobic008G071550 Sobic007G011900--Sobic008G071550 Sobic005G058400--Sobic006G144201 Sobic005G058400--Sobic005G174800 Sobic005G058400--Sobic008G069600 Sobic005G058400--Sobic003G167566 Sobic005G058400--Sobic010G008200 Sobic005G058400--Sobic010G011300 Sobic003G010000 Sobic003G010000 Sobic005G058400--Sobic003G010000 Sobic005G058400--Sobic005G141400 Sobic001G266300 Sobic001G266300 Sobic005G058400--Sobic001G266300 Sobic010G011300--Sobic010G008200 Sobic010G011300--Sobic005G141400 Sobic010G011300--Sobic008G071550 Sobic010G011300--Sobic005G058400 Sobic005G213900 Sobic005G213900 Sobic010G011300--Sobic005G213900 Sobic010G011300--Sobic003G167566 Sobic010G011300--Sobic008G069600 Sobic009G078600 Sobic009G078600 Sobic010G011300--Sobic009G078600 Sobic010G011300--Sobic006G144201 Sobic010G008200--Sobic010G011300 Sobic010G008200--Sobic005G141400 Sobic010G008200--Sobic005G213900 Sobic010G008200--Sobic008G071550 Sobic010G008200--Sobic005G058400 Sobic010G008200--Sobic003G167566 Sobic010G008200--Sobic009G078600 Sobic010G008200--Sobic008G069600 Sobic003G207800 Sobic003G207800 Sobic010G008200--Sobic003G207800 Sobic006G144201--Sobic005G058400 Sobic006G144201--Sobic003G010000 Sobic006G144201--Sobic005G174800 Sobic008G070100 Sobic008G070100 Sobic006G144201--Sobic008G070100 Sobic006G144201--Sobic008G069600 Sobic004G316200 Sobic004G316200 Sobic006G144201--Sobic004G316200 Sobic006G144201--Sobic001G266300 Sobic003G179300 Sobic003G179300 Sobic006G144201--Sobic003G179300 Sobic004G048300 Sobic004G048300 Sobic006G144201--Sobic004G048300 Sobic005G141400--Sobic005G213900 Sobic005G141400--Sobic010G008200 Sobic005G141400--Sobic008G071550 Sobic005G141400--Sobic010G011300 Sobic005G141400--Sobic009G078600 Sobic005G141400--Sobic003G207800 Sobic005G141400--Sobic003G167566 Sobic002G094900 Sobic002G094900 Sobic005G141400--Sobic002G094900 Sobic005G141400--Sobic005G058400 Sobic008G069600--Sobic005G058400 Sobic008G069600--Sobic006G144201 Sobic008G069600--Sobic005G174800 Sobic008G069600--Sobic003G167566 Sobic008G069600--Sobic003G010000 Sobic008G069600--Sobic008G070100 Sobic008G069600--Sobic010G008200 Sobic008G069600--Sobic010G011300 Sobic008G069600--Sobic004G048300 Sobic005G174800--Sobic005G058400 Sobic005G174800--Sobic006G144201 Sobic005G174800--Sobic003G010000 Sobic005G174800--Sobic008G070100 Sobic005G174800--Sobic008G069600 Sobic005G174800--Sobic003G167566 Sobic005G174800--Sobic004G048300 Sobic005G174800--Sobic003G179300 Sobic005G174800--Sobic001G266300 Sobic003G167566--Sobic005G058400 Sobic003G167566--Sobic010G008200 Sobic003G167566--Sobic005G213900 Sobic003G167566--Sobic005G141400 Sobic003G167566--Sobic008G069600 Sobic003G167566--Sobic005G174800 Sobic003G167566--Sobic010G011300 Sobic003G238900 Sobic003G238900 Sobic003G167566--Sobic003G238900 Sobic003G167566--Sobic003G207800 Sobic008G071550--Sobic005G141400 Sobic008G071550--Sobic009G078600 Sobic008G071550--Sobic010G008200 Sobic008G071550--Sobic010G011300 Sobic008G071550--Sobic005G213900 Sobic003G245500 Sobic003G245500 Sobic008G071550--Sobic003G245500 Sobic008G071550--Sobic002G094900 Sobic002G053201 Sobic002G053201 Sobic008G071550--Sobic002G053201 Sobic007G024100 Sobic007G024100 Sobic008G071550--Sobic007G024100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.