Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G038900.1
Synonym Sb07g003310
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YGT4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G24370 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g05540.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a030136
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.007G038900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G287500 RNA recognition motif containing protein, expressed K13154: U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 31 kDa protein
2 Sobic.002G058600 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
3 Sobic.006G278600 oxidoreductase, 2OG-Fe oxygenase family protein, putative, expressed K10767: mRNA N6-methyladenine demethylase
4 Sobic.004G063750 - -
5 Sobic.004G295400 amino acid kinase, putative, expressed K00930: acetylglutamate kinase
6 Sobic.004G089700 - -
7 Sobic.002G173600 UDP-glucoronosyl/UDP-glucosyl transferase family protein, putative, expressed -
8 Sobic.004G206900 expressed protein -
9 Sobic.009G187500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@MONOCULM 1, putative, expressed -
10 Sobic.007G206550 - -
11 Sobic.001G457100 - -
12 Sobic.002G344100 - -
13 Sobic.007G157550 - -
14 Sobic.008G144100 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
15 Sobic.004G347866 - -
16 Sobic.002G003100 gibberellin 2-beta-dioxygenase 7, putative, expressed K04125: gibberellin 2beta-dioxygenase
17 Sobic.009G223700 - -
18 Sobic.004G221150 - -
19 Sobic.002G048250 - -
20 Sobic.008G119200 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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