Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G287500.1
Synonym Sb02g031980
Functional annotation RNA recognition motif containing protein, expressed
UniProt C5X7L6
Pfam PF00098 PF00076
Panther DB PTHR23139
NCBI CDD -
KEGG Orthology K13154; U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 31 kDa protein
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0003676nucleic acid binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G10400 : RNA recognition motif and CCHC-type zinc finger domains containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g37720.1 : RNA recognition motif containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a047965 , Zm00025a014508
Brachypodium KQJ91360
Barley HORVU5Hr1G086960.3 , HORVU5Hr1G086960.6 , HORVU5Hr1G086960.7 , HORVU5Hr1G086960.4 , HORVU5Hr1G086960.5
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic002G287500 Sobic002G287500 Sobic007G038900 Sobic007G038900 Sobic002G287500--Sobic007G038900 Sobic004G063750 Sobic004G063750 Sobic002G287500--Sobic004G063750 Sobic009G088401 Sobic009G088401 Sobic002G287500--Sobic009G088401 Sobic006G273500 Sobic006G273500 Sobic002G287500--Sobic006G273500 Sobic007G072400 Sobic007G072400 Sobic002G287500--Sobic007G072400 Sobic002G173600 Sobic002G173600 Sobic002G287500--Sobic002G173600 Sobic008G119200 Sobic008G119200 Sobic002G287500--Sobic008G119200 Sobic002G058600 Sobic002G058600 Sobic002G287500--Sobic002G058600 Sobic009G187500 Sobic009G187500 Sobic002G287500--Sobic009G187500 Sobic007G038900--Sobic002G287500 Sobic007G038900--Sobic002G058600 Sobic006G278600 Sobic006G278600 Sobic007G038900--Sobic006G278600 Sobic007G038900--Sobic004G063750 Sobic004G295400 Sobic004G295400 Sobic007G038900--Sobic004G295400 Sobic004G089700 Sobic004G089700 Sobic007G038900--Sobic004G089700 Sobic007G038900--Sobic002G173600 Sobic004G206900 Sobic004G206900 Sobic007G038900--Sobic004G206900 Sobic007G038900--Sobic009G187500 Sobic001G399501 Sobic001G399501 Sobic004G063750--Sobic001G399501 Sobic008G144100 Sobic008G144100 Sobic004G063750--Sobic008G144100 Sobic004G063750--Sobic004G206900 Sobic004G063750--Sobic009G187500 Sobic004G063750--Sobic002G173600 Sobic004G063750--Sobic004G089700 Sobic002G339250 Sobic002G339250 Sobic004G063750--Sobic002G339250 Sobic001G431200 Sobic001G431200 Sobic004G063750--Sobic001G431200 Sobic008G002100 Sobic008G002100 Sobic004G063750--Sobic008G002100 Sobic008G023000 Sobic008G023000 Sobic009G088401--Sobic008G023000 Sobic005G209800 Sobic005G209800 Sobic009G088401--Sobic005G209800 Sobic006G171000 Sobic006G171000 Sobic009G088401--Sobic006G171000 Sobic009G088401--Sobic008G002100 Sobic003G173032 Sobic003G173032 Sobic009G088401--Sobic003G173032 Sobic001G527400 Sobic001G527400 Sobic009G088401--Sobic001G527400 Sobic009G088401--Sobic007G072400 Sobic004G226300 Sobic004G226300 Sobic009G088401--Sobic004G226300 Sobic007G183000 Sobic007G183000 Sobic009G088401--Sobic007G183000 Sobic008G098098 Sobic008G098098 Sobic006G273500--Sobic008G098098 Sobic006G273500--Sobic008G119200 Sobic004G107400 Sobic004G107400 Sobic006G273500--Sobic004G107400 Sobic002G285525 Sobic002G285525 Sobic006G273500--Sobic002G285525 Sobic001G137200 Sobic001G137200 Sobic006G273500--Sobic001G137200 Sobic010G002850 Sobic010G002850 Sobic006G273500--Sobic010G002850 Sobic006G273500--Sobic006G171000 Sobic006G273500--Sobic005G209800 Sobic005G231800 Sobic005G231800 Sobic006G273500--Sobic005G231800 Sobic007G072400--Sobic001G527400 Sobic007G072400--Sobic006G171000 Sobic007G072400--Sobic008G002100 Sobic007G072400--Sobic005G209800 Sobic007G072400--Sobic007G183000 Sobic007G072400--Sobic008G023000 Sobic007G072400--Sobic004G226300 Sobic007G072400--Sobic003G173032 Sobic007G072400--Sobic001G137200 Sobic002G173600--Sobic001G527400 Sobic002G048250 Sobic002G048250 Sobic002G173600--Sobic002G048250 Sobic002G173600--Sobic008G002100 Sobic002G173600--Sobic008G023000 Sobic002G173600--Sobic007G183000 Sobic002G173600--Sobic004G226300 Sobic002G173600--Sobic005G231800 Sobic002G173600--Sobic005G209800 Sobic002G173600--Sobic003G173032 Sobic008G119200--Sobic002G048250 Sobic008G119200--Sobic007G183000 Sobic008G119200--Sobic004G226300 Sobic008G119200--Sobic005G231800 Sobic008G119200--Sobic001G527400 Sobic008G119200--Sobic002G285525 Sobic008G119200--Sobic008G023000 Sobic008G119200--Sobic008G002100 Sobic004G347866 Sobic004G347866 Sobic008G119200--Sobic004G347866 Sobic002G366700 Sobic002G366700 Sobic002G058600--Sobic002G366700 Sobic002G058600--Sobic007G038900 Sobic001G513100 Sobic001G513100 Sobic002G058600--Sobic001G513100 Sobic002G058600--Sobic002G287500 Sobic001G494150 Sobic001G494150 Sobic002G058600--Sobic001G494150 Sobic002G058600--Sobic006G278600 Sobic010G087200 Sobic010G087200 Sobic002G058600--Sobic010G087200 Sobic009G236500 Sobic009G236500 Sobic002G058600--Sobic009G236500 Sobic003G008300 Sobic003G008300 Sobic002G058600--Sobic003G008300 Sobic009G187500--Sobic002G048250 Sobic009G187500--Sobic008G002100 Sobic009G187500--Sobic004G089700 Sobic009G187500--Sobic007G183000 Sobic009G187500--Sobic001G527400 Sobic009G187500--Sobic008G023000 Sobic009G187500--Sobic005G209800 Sobic009G187500--Sobic004G226300 Sobic004G224300 Sobic004G224300 Sobic009G187500--Sobic004G224300
Octagon: transcription factors


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